SMTN - SMTN

SMTN
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2Д87
Идентификаторы
Псевдонимы	SMTN, смутелин
Внешние идентификаторы	OMIM: 602127 MGI: 1354727 ГомолоГен: 8482 Генные карты: SMTN
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q12.2 Начните 31,064,105 бп[1] Конец 31,104,757 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A1 Начните 3,517,523 бп[2] Конец 3,540,612 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание актина • структурная составляющая мышцы Сотовый компонент • цитоплазма • цитоскелет • актиновый цитоскелет • центр организации микротрубочек • нитчатый актин • нуклеоплазма Биологический процесс • сокращение гладких мышц • развитие мышечных органов • организация актинового цитоскелета Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6525	29856
Ансамбль	ENSG00000183963	ENSMUSG00000020439
UniProt	P53814	Q921U8
RefSeq (мРНК)	NM_001207017 NM_001207018 NM_006932 NM_134269 NM_134270	NM_001159284 NM_001284427 NM_001284428 NM_001284429 NM_013870
RefSeq (белок)	NP_001193946 NP_001193947 NP_008863 NP_599031 NP_599032 NP_001369567 NP_001369568 NP_001369569 NP_001369570 NP_001369571 NP_001369572 NP_001369573 NP_001369574 NP_001369575 NP_001369576 NP_001369577	NP_001152756 NP_001271356 NP_001271357 NP_001271358 NP_038898
Расположение (UCSC)	Chr 22: 31.06 - 31,1 Мб	Chr 11: 3.52 - 3.54 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Smoothelin это белок что у людей кодируется SMTN ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует структурный белок что находится исключительно в сократительной гладкая мышца клетки. Он ассоциируется со стрессовыми волокнами и составляет часть цитоскелет. Этот ген локализован в хромосома 22q12.3, дистальнее локуса TUPLE1 и вне Синдром ДиДжорджи удаление. Альтернативная сварка этого гена приводит к трем вариантам транскрипта.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183963 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020439 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Engelen JJ, Esterling LE, Albrechts JC, Detera-Wadleigh SD, van Eys GJ (сентябрь 1997 г.). «Присвоение человеческого гена смоотелина (SMTN) хромосоме 22q12 с помощью флуоресцентной гибридизации in situ и радиационного гибридного картирования». Геномика. 43 (2): 245–7. Дои:10.1006 / geno.1997.9999. PMID  9244445.
6. van der Loop FT, Schaart G, Timmer ED, Ramaekers FC, van Eys GJ (сентябрь 1996 г.). «Smoothelin, новый цитоскелетный белок, специфичный для гладкомышечных клеток». J Cell Biol. 134 (2): 401–11. Дои:10.1083 / jcb.134.2.401. ЧВК  2120883. PMID  8707825.
7. "Entrez Gene: SMTN Smoothelin".

дальнейшее чтение

• Люфт ФК (1999). «Отличие одного гладкого оператора от другого». J. Mol. Med. 77 (2): 255–7. Дои:10.1007 / s001090050347. PMID  10023778.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• van Eys GJ, Völler MC, Timmer ED, et al. (1997). «Характеристики экспрессии Smoothelin: развитие системы гладкомышечных клеток in vitro и идентификация сосудистого варианта». Сотовая структура. Funct. 22 (1): 65–72. Дои:10.1247 / csf.22.65. PMID  9113392.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (1999). «К полной последовательности человеческого генома». Genome Res. 8 (11): 1097–108. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID  9847074.
• Кремер Дж., Агирре-Артета А.М., Тиль С. и др. (1999). «Новая изоформа маркера дифференцировки гладкомышечных клеток Smoothelin». J. Mol. Med. 77 (2): 294–8. Дои:10.1007 / s001090050352. PMID  10023782.
• Йоханссон Б., Эрикссон А., Рамаекерс Ф., Торнелл Л. (2000). «Смуотелин в артериях и миокарде взрослых и развивающихся людей». Histochem. Cell Biol. 112 (4): 291–9. Дои:10.1007 / s004180050450. PMID  10550614.
• Данэм И., Шимицу Н., Роу Б.А. и др. (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
• Гселл С., Эшенхаген Т., Каспарейт Г. и др. (2000). «Очевидная повышающая регуляция стимулирующих альфа-субъединиц G-белка в миометрии беременного человека имитируется повышенной экспрессией смоотелина». FASEB J. 14 (1): 17–26. Дои:10.1096 / fasebj.14.1.17. PMID  10627276.
• Кремер Дж., Квенсель С., Мединг Дж. И др. (2001). «Идентификация и характеристика новых изоформ смоотелина в гладких мышцах сосудов». J. Vasc. Res. 38 (2): 120–32. Дои:10.1159/000051039. PMID  11316948.
• Ренсен С.С., Тийссен В.Л., Де Фриз С.Дж. и др. (2002). «Экспрессия гена смоотелина опосредуется альтернативными промоторами». Кардиоваск. Res. 55 (4): 850–63. Дои:10.1016 / S0008-6363 (02) 00491-1. PMID  12176134.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.