SMPD2 - SMPD2

SMPD2
Идентификаторы
Псевдонимы	SMPD2, ISC1, NSMASE, NSMASE1, сфингомиелинфосфодиэстераза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 603498 MGI: 1278330 ГомолоГен: 31129 Генные карты: SMPD2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q21 Начинать 109,440,724 бп[1] Конец 109,443,919 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B2 Начинать 41,485,642 бп[2] Конец 41,490,369 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность сфингомиелин фосфодиэстеразы • связывание ионов металлов • гидролазная активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • внутриклеточный • Caveola Биологический процесс • положительная регуляция процесса биосинтеза церамидов • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • липидный обмен • процесс биосинтеза керамидов • ответ на механический раздражитель • метаболический процесс сфингомиелина • сфинголипидный метаболический процесс • катаболический процесс сфингомиелина • метаболический процесс гликосфинголипидов Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6610	20598
Ансамбль	ENSG00000135587	ENSMUSG00000019822
UniProt	O60906	O70572
RefSeq (мРНК)	NM_003080	NM_009213
RefSeq (белок)	NP_003071	NP_033239
Расположение (UCSC)	Chr 6: 109.44 - 109.44 Мб	Chr 10: 41.49 - 41.49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Сфингомиелин фосфодиэстераза 2 является фермент что у людей кодируется SMPD2 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135587 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000019822 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Томюк С., Хофманн К., Никс М., Зумбансен М., Стоффель В. (март 1998 г.). "Клонированная нейтральная сфингомиелиназа млекопитающих: функции в передаче сигналов сфинголипидов?". Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (7): 3638–43. Bibcode:1998PNAS ... 95.3638T. Дои:10.1073 / пнас.95.7.3638. ЧВК  19888. PMID  9520418.
6. «Ген Entrez: SMPD2 сфингомиелин фосфодиэстераза 2, нейтральная мембрана (нейтральная сфингомиелиназа)».

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Савай Х, Дома Н, Наган Н, Ханнун Я. (декабрь 1999 г.). «Функция клонированной предполагаемой нейтральной сфингомиелиназы как фактора активации лизо-тромбоцитов - фосфолипазы C». Журнал биологической химии. 274 (53): 38131–9. Дои:10.1074 / jbc.274.53.38131. PMID  10608884.
• Марчезини Н., Оста В., Белявски Дж., Люберто К., Обейд Л.М., Ханнун Ю.А. (июнь 2004 г.). «Роль нейтральной сфингомиелиназы 2 млекопитающих в остановке роста клеток MCF7, вызванной слиянием». Журнал биологической химии. 279 (24): 25101–11. Дои:10.1074 / jbc.M313662200. PMID  15051724.
• Jensen JM, Fölster-Holst R, Baranowsky A, Schunck M, Winoto-Morbach S, Neumann C, Schütze S, Proksch E (июнь 2004 г.). «Нарушение активности сфингомиелиназы и эпидермальной дифференцировки при атопическом дерматите». Журнал следственной дерматологии. 122 (6): 1423–31. Дои:10.1111 / j.0022-202X.2004.22621.x. PMID  15175033.
• Яна А., Пахан К. (октябрь 2004 г.). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 gp120 индуцирует апоптоз в первичных нейронах человека посредством окислительно-восстановительной активации нейтральной сфингомиелиназы». Журнал неврологии. 24 (43): 9531–40. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.3085-04.2004. ЧВК  1955476. PMID  15509740.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кусида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Kim HT, Lee JY, Han BG, Kimm K, Oh B, Shin HD, Namkung JH, Kim E, Park T, Yang JM (май 2007 г.). «Ассоциативный анализ полиморфизмов сфингомиелиназы 2 для внешнего типа атопического дерматита у корейцев». Журнал дерматологической науки. 46 (2): 143–6. Дои:10.1016 / j.jdermsci.2006.12.001. PMID  17212982.
• Тани М., Ханнун Ю.А. (март 2007 г.). «Нейтральная сфингомиелиназа 2 пальмитоилируется по множеству остатков цистеина. Роль пальмитоилирования в субклеточной локализации». Журнал биологической химии. 282 (13): 10047–56. Дои:10.1074 / jbc.M611249200. PMID  17272284.