SLITRK2 - SLITRK2

SLITRK2
Идентификаторы
Псевдонимы	SLITRK2, CXorf2, SLITL1, SLIT и NTRK как член семейства 2, CXorf1, TMEM257
Внешние идентификаторы	OMIM: 300561 MGI: 2679449 ГомолоГен: 13054 Генные карты: SLITRK2
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq27.3 Начинать 145,817,832 бп[1] Конец 145,829,856 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X A7.1 Начинать 66,649,318 бп[2] Конец 66,661,393 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	84631	245450
Ансамбль	ENSG00000185985	ENSMUSG00000036790
UniProt	Q9H156	Q810C0
RefSeq (мРНК)	NM_001144003 NM_001144004 NM_001144005 NM_001144006 NM_001144007 NM_001144008 NM_001144009 NM_001144010 NM_032539	NM_001161431 NM_198863
RefSeq (белок)	NP_001137475 NP_001137476 NP_001137477 NP_001137478 NP_001137480 NP_001137481 NP_001137482 NP_115928	NP_001154903 NP_942563
Расположение (UCSC)	Chr X: 145,82 - 145,83 Мб	Chr X: 66.65 - 66.66 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SLIT и NTRK-подобный белок 2 это белок что у людей кодируется SLITRK2 ген.^[5][6][7]

Функция

Члены семейства SLITRK, такие как SLITRK2, представляют собой интегральные мембранные белки с 2 N-концевыми доменами с богатыми лейцином повторами (LRR), аналогичными доменам белков SLIT (см. SLIT1; MIM 603742). Большинство SLITRK, включая SLITRK2, также имеют С-концевые области, которые имеют гомологию с рецепторами нейротрофинов (см. NTRK1; MIM 191315). SLITRK экспрессируются преимущественно в нервных тканях и обладают нейрит-модулирующей активностью.^[7][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000185985 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036790 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Накаяма М., Накадзима Д., Кикуно Р., Охара О. (апрель 2001 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XX. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 8 (2): 85–95. Дои:10.1093 / днарес / 8.2.85. PMID  11347906.
6. Аруга Дж., Йокота Н., Микошиба К. (октябрь 2003 г.). «Человеческие гены семейства SLITRK: геномная организация и профили экспрессии в нормальном мозге и опухолевой ткани головного мозга». Ген. 315: 87–94. Дои:10.1016 / S0378-1119 (03) 00715-7. PMID  14557068.
7. "Entrez Gene: SLITRK2 SLIT и NTRK-подобное семейство, член 2".

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.