SH3GLB1 - SH3GLB1

SH3GLB1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1X43
Идентификаторы
Псевдонимы	SH3GLB1, Bif-1, PPP1R70, dJ612B15.2, CGI-61, домен SH3, содержащий GRB2-подобный эндофилину B1, SH3-домен, содержащий GRB2-подобный, эндофилин B1
Внешние идентификаторы	OMIM: 609287 MGI: 1859730 ГомолоГен: 9337 Генные карты: SH3GLB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п22.3 Начинать 86,704,570 бп[1] Конец 86,748,184 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 H2 Начинать 144,683,678 бп[2] Конец 144,720,335 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • связывание липидов • связывание кадгерина Сотовый компонент • цитоплазма • аппарат Гольджи • мембрана • Мембрана Гольджи • митохондриальная наружная мембрана • мембрана аутофагосомы • середина тела • митохондрия • внеклеточная экзосома • цитоплазматический пузырек • цитозоль Биологический процесс • клеточный ответ на голодание по глюкозе • регуляция цитокинеза • регулирование стабильности белка • положительная регуляция сборки аутофагосом • положительное регулирование аутофагии • положительное регулирование доставки белка в митохондрии • клеточный ответ на аминокислотное голодание • рецепторный катаболический процесс • аутофагия • олигомеризация белков • деление мембраны • положительное регулирование олигомеризации белков • положительная регуляция мембранных канальцев • гибель аутофагических клеток • регуляция макроаутофагии • локализация белка на вакуолярной мембране • апоптотический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51100	54673
Ансамбль	ENSG00000097033	ENSMUSG00000037062
UniProt	Q9Y371	Q9JK48
RefSeq (мРНК)	NM_001206651 NM_001206652 NM_001206653 NM_016009	NM_001282037 NM_001282042 NM_019464 NM_001379170 NM_001379171 NM_001379172 NM_001379173 NM_001379174
RefSeq (белок)	NP_001193580 NP_001193581 NP_001193582 NP_057093	NP_001268966 NP_001268971 NP_062337 NP_001366099 NP_001366100 NP_001366101 NP_001366102 NP_001366103
Расположение (UCSC)	Chr 1: 86,7 - 86,75 Мб	Chr 3: 144,68 - 144,72 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Эндофилин-B1 это белок что у людей кодируется SH3GLB1 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

SH3GLB1 был показан взаимодействовать с SH3GLB2^[5] и Bcl-2-ассоциированный X-белок.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000097033 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037062 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пьерра Б., Симонен М., Куэто М., Местан Дж., Ферриньо П., Хайм Дж. (Февраль 2001 г.). «SH3GLB, новое семейство белков, связанных с эндофилином, с доменом SH3». Геномика. 71 (2): 222–34. Дои:10.1006 / geno.2000.6378. PMID  11161816.
6. Каддебэк С.М., Ямагути Х., Комацу К., Мияшита Т., Ямада М., Ву С., Сингх С., Ван Х.Г. (июнь 2001 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика Bif-1. Новый белок, содержащий 3 домен с гомологией Src, который ассоциируется с Bax». J Biol Chem. 276 (23): 20559–65. Дои:10.1074 / jbc.M101527200. PMID  11259440.
7. «Ген Entrez: SH3GLB1 SH3-домен GRB2-подобный эндофилин B1».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Секи Н., Охира М., Нагасе Т., Исикава К., Миядзима Н., Накадзима Д., Номура Н., Охара О. (1998). «Характеристика клонов кДНК в библиотеках кДНК, фракционированных по размеру, из человеческого мозга». ДНК Res. 4 (5): 345–9. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.345. PMID  9455484.
• Ховард Л., Нельсон К.К., Мацевич Р.А., Блобель С.П. (1999). «Взаимодействие дезинтегринов металлопротеиназы MDC9 и MDC15 с двумя белками, содержащими домен SH3, эндофилином I и SH3PX1». J. Biol. Chem. 274 (44): 31693–9. Дои:10.1074 / jbc.274.44.31693. PMID  10531379.
• Лай Ч., Чжоу Ц.Ю., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (2000). «Идентификация новых эволюционно консервативных генов человека у Caenorhabditis elegans с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
• Модреггер Дж., Шмидт А.А., Риттер Б., Хаттнер В.Б., Пломанн М. (2003). «Характеристика эндофилина B1b, специфической для мозга мембраносвязанной ацилтрансферазы лизофосфатидовой кислоты со свойствами, отличными от эндофилина A1». J. Biol. Chem. 278 (6): 4160–7. Дои:10.1074 / jbc.M208568200. PMID  12456676.
• Ли SY, Венк MR, Ким Y, Nairn AC, De Camilli P (2004). «Регулирование синаптоянина 1 с помощью циклин-зависимой киназы 5 в синапсах». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (2): 546–51. Дои:10.1073 / pnas.0307813100. ЧВК  327184. PMID  14704270.
• Карбовски М., Чон С.Ю., Юле Р.Дж. (2004). «Эндофилин B1 необходим для поддержания морфологии митохондрий». J. Cell Biol. 166 (7): 1027–39. Дои:10.1083 / jcb.200407046. ЧВК  2172012. PMID  15452144.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Такахаши Ю., Карбовски М., Ямагути Х., Кази А., Ву Дж., Себти С.М., Юле Р.Дж., Ван Х.Г. (2005). «Потеря Bif-1 подавляет изменение конформации Bax / Bak и митохондриальный апоптоз». Мол. Клетка. Биол. 25 (21): 9369–82. Дои:10.1128 / MCB.25.21.9369-9382.2005. ЧВК  1265816. PMID  16227588.
• Масуда М., Такеда С., Соне М., Оки Т., Мори Х., Камиока Ю., Мочизуки Н. (2006). «BAR-домен эндофилина управляет кривизной мембраны с помощью двух недавно идентифицированных структурных механизмов». EMBO J. 25 (12): 2889–97. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601176. ЧВК  1500852. PMID  16763557.
• Ли JW, Jeong EG, Soung YH, Nam SW, Lee JY, Yoo NJ, Lee SH (2006). «Снижение экспрессии опухолевого супрессора Bax-взаимодействующего фактора-1 (Bif-1), активатора Bax, при карциномах желудка». Патология. 38 (4): 312–5. Дои:10.1080/00313020600820880. PMID  16916719.