SH3BP1 - SH3BP1

SH3BP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4J9D, 4J9F
Идентификаторы
Псевдонимы	SH3BP1, ARHGAP43, белок 1, связывающий домен SH3
Внешние идентификаторы	OMIM: 617368 MGI: 104603 ГомолоГен: 7534 Генные карты: SH3BP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q13.1 Начинать 37,634,654 бп[1] Конец 37,656,119 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 E1 Начинать 78,899,768 бп[2] Конец 78,912,051 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Привязка домена SH3 • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • связывание рецептора семафорина • Связывание Rac GTPase Сотовый компонент • цитоплазма • экзоциста • ламеллиподиум • фагоцитарная чашка • ядро клетки • цитозоль • стык • двухклеточное плотное соединение • соединение клеток • проекция клетки • передний край ячейки • внутриклеточный Биологический процесс • преобразование сигнала • фагоцитоз, поглощение • организация актиновых филаментов • регуляция деполимеризации актиновых филаментов • регуляция организации актинового цитоскелета • узел соединения ячеек • регуляция миграции эндотелиальных клеток кровеносных сосудов • установление апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток • отрицательная регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • семафорин-плексиновый сигнальный путь • фагоцитоз • миграция клеток • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • сборка филоподиума • сборка с оборками Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23616	20401
Ансамбль	ENSG00000100092	ENSMUSG00000022436
UniProt	Q9Y3L3	P55194
RefSeq (мРНК)	NM_018957 NM_001350055	NM_009164 NM_001316684 NM_001316685 NM_001316686
RefSeq (белок)	NP_061830 NP_001336984	NP_001303613 NP_001303614 NP_001303615 NP_033190
Расположение (UCSC)	Chr 22: 37.63 - 37.66 Мб	Chr 15: 78.9 - 78.91 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SH3-домен-связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется SH3BP1 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100092 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022436 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Биэр Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен К. П. и др. (Декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
6. Скотт М.П., ​​Заппакоста Ф., Ким Е.Ю., Аннан Р.С., Миллер В.Т. (июль 2002 г.). «Идентификация новых лигандов домена SH3 для киназы Hck семейства Src. Синдромный белок Вискотта-Олдрича (WASP), WASP-взаимодействующий белок (WIP) и ELMO1». J Biol Chem. 277 (31): 28238–46. Дои:10.1074 / jbc.M202783200. PMID  12029088.
7. "Ген Entrez: SH3BP1 SH3-домен связывающий белок 1".

дальнейшее чтение

• Cicchetti P, Mayer BJ, Thiel G, Baltimore D (1992). «Идентификация белка, который связывается с областью SH3 Abl и похож на Bcr и GAP-rho». Наука. 257 (5071): 803–6. Дои:10.1126 / science.1379745. PMID  1379745.
• Чжан Б., Чжэн И (1998). «Регулирование гидролиза RhoA GTP белками, активирующими GTPase, p190, p50RhoGAP, Bcr и 3BP-1». Биохимия. 37 (15): 5249–57. Дои:10.1021 / bi9718447. PMID  9548756.
• Вестрик И., Эйкхольт Б.Дж., Уолш Ф.С. и др. (2000). «Sema3A-индуцированный коллапс конуса роста опосредуется аминокислотами 17-32 Rac1». Curr. Биол. 9 (18): 991–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (99) 80447-3. PMID  10508610.
• Итак, CW, So CK, Cheung N и др. (2000). «Взаимодействие между EEN и Abi-1, двумя партнерами по слиянию MLL и синаптоянином и динамином: последствия для лейкемогенеза». Лейкемия. 14 (4): 594–601. Дои:10.1038 / sj.leu.2401692. PMID  10764144.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Коллинз Дж. Э., Райт К. Л., Эдвардс К. А. и др. (2005). «Основанный на аннотации генома подход к клонированию ORFeome человека». Геном Биол. 5 (10): R84. Дои:10.1186 / gb-2004-5-10-r84. ЧВК  545604. PMID  15461802.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.