SEPSECS - SEPSECS

SEPSECS
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3HL2, 4ZDO, 4ZDL, 4ZDP
Идентификаторы
Псевдонимы	SEPSECS, LP, PCH2D, SLA, SLA / LP, Sep (O-фосфосерин) тРНК: Sec (селеноцистеин) тРНК-синтаза, растворимый антиген печени
Внешние идентификаторы	OMIM: 613009 MGI: 1098791 ГомолоГен: 15031 Генные карты: SEPSECS
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4п15.2 Начинать 25,120,014 бп[1] Конец 25,160,449 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 C1 | 5 28,44 см Начинать 52,640,087 бп[2] Конец 52,669,708 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание тРНК • трансферазная активность, переносящая селенсодержащие группы • каталитическая активность • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • активность фосфосерил-селеноцистеинил-тРНК селентрансферазы Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • ядро клетки Биологический процесс • включение селеноцистеина • биосинтез белка • метаболический процесс селеноцистеина • биосинтетический процесс селеноцистеинил-тРНК (Sec) Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51091	211006
Ансамбль	ENSG00000109618	ENSMUSG00000029173
UniProt	Q9HD40	Q6P6M7
RefSeq (мРНК)	NM_001159728 NM_016955	NM_172490 NM_001363463
RefSeq (белок)	NP_058651	NP_766078 NP_001350392
Расположение (UCSC)	Chr 4: 25.12 - 25.16 Мб	Chr 5: 52,64 - 52,67 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

О-фосфосерил-тРНК (Sec) селентрансфераза является фермент что у людей кодируется SEPSECS ген.^{[5][6][7][8][9]}

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000109618 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000029173 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сюй XM, Mix H, Карлсон Б.А., Грабовски П.Дж., Гладышев В.Н., Берри М.Дж., Хэтфилд Д.Л. (декабрь 2005 г.). «Доказательства прямой роли двух дополнительных факторов, SECp43 и растворимого антигена печени, в аппарате синтеза селенопротеина». J. Biol. Chem. 280 (50): 41568–75. Дои:10.1074 / jbc.M506696200. PMID  16230358.
6. Коста М., Родригес-Санчес Дж. Л., Чая А. Дж., Гелпи К. (август 2000 г.). «Выделение и характеристика кДНК, кодирующей антигенный белок комплекса tRNP (Ser) Sec человека, распознаваемый аутоантителами у пациентов с аутоиммунным гепатитом 1 типа». Clin. Exp. Иммунол. 121 (2): 364–74. Дои:10.1046 / j.1365-2249.2000.01280.x. ЧВК  1905695. PMID  10931155.
7. Юань Дж., Палиура С., Салазар Дж. К., Су Д., О'Донохью П., Хон М. Дж., Кардосо А. М., Уитмен В. Б., Сёлл Д. (декабрь 2006 г.). «РНК-зависимая конверсия фосфосерина в формы селеноцистеина у эукариот и архей». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (50): 18923–7. Дои:10.1073 / pnas.0609703104. ЧВК  1748153. PMID  17142313.
8. Сюй XM, Карлсон BA, Mix H, Zhang Y, Saira K, Glass RS, Berry MJ, Gladyshev VN, Hatfield DL (апрель 2007 г.). «Биосинтез селеноцистеина на его тРНК у эукариот». ПЛОС Биол. 5 (1): e4. Дои:10.1371 / journal.pbio.0050004. ЧВК  1717018. PMID  17194211.
9. «Ген Entrez: SLA / LP растворимый антиген печени / антиген поджелудочной железы печени».

дальнейшее чтение

• Herkel J, Heidrich B, Nieraad N, Wies I, Rother M, Lohse AW (2002). «Тонкая специфичность аутоантител к растворимому антигену печени и печени / поджелудочной железы». Гепатология. 35 (2): 403–8. Дои:10.1053 / jhep.2002.30699. PMID  11826415. S2CID  46400743.
• Фолькманн М., Мартин Л., Бурле А., Хейд Х., Страсбург С.П., Траутвайн С., Файн В., Маннс М.П. (2001). «Растворимый антиген печени: выделение рекомбинантного белка с молекулярной массой 35 кДа (SLA-p35), специфически распознающего сыворотку от пациентов с аутоиммунным гепатитом». Гепатология. 33 (3): 591–6. Дои:10.1053 / jhep.2001.22218. PMID  11230739. S2CID  11978013.
• Wies I, Brunner S, Henninger J, Herkel J, Kanzler S, Meyer zum Büschenfelde KH, Lohse AW (2000). «Идентификация антигена-мишени для аутоантител SLA / LP при аутоиммунном гепатите». Ланцет. 355 (9214): 1510–5. Дои:10.1016 / S0140-6736 (00) 02166-8. PMID  10801173. S2CID  45159673.