SENP8 - SENP8

SENP8
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1XT9, 2BKQ, 2BKR
Идентификаторы
Псевдонимы	SENP8, DEN1, NEDP1, PRSC2, член семейства SUMO / сентрин-пептидаз, специфичный для NEDD8, член семейства пептидаз SUMO, специфичный для NEDD8
Внешние идентификаторы	OMIM: 608659 MGI: 1918849 ГомолоГен: 14084 Генные карты: SENP8
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q23 Начинать 72,114,258 бп[1] Конец 72,143,692 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 млрд Начинать 59,734,259 бп[2] Конец 59,750,710 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • пептидазная активность • активность пептидазы цистеинового типа • гидролазная активность • NEDD8-специфическая протеазная активность • эндопептидазная активность Сотовый компонент • цитозоль • ядро клетки Биологический процесс • протеолиз • деубиквитинирование белков • десумоилирование белков • посттрансляционная модификация Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	123228	71599
Ансамбль	ENSG00000166192	ENSMUSG00000051705
UniProt	Q96LD8	Q9D2Z4
RefSeq (мРНК)	NM_001166340 NM_001172109 NM_001172110 NM_001172111 NM_145204	NM_001172068 NM_001172069 NM_001172070 NM_001172071 NM_027838
RefSeq (белок)	NP_001159812 NP_001165580 NP_001165581 NP_001165582 NP_660205	NP_001165539 NP_001165540 NP_001165541 NP_001165542 NP_082114
Расположение (UCSC)	Chr 15: 72.11 - 72.14 Мб	Chr 9: 59.73 - 59.75 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Сентрин-специфическая протеаза 8 является фермент что у людей кодируется SENP8 ген.^[5][6][7]

NEDD8 (MIM 603171) - это убиквитин -подобный белок, который становится конъюгированным с Cullin (видеть CUL1; MIM 603134) субъединица из нескольких убиквитинлигазы. Это спряжение, называемое неддилирование, необходим для оптимальной активности убиквитинлигазы. NEDD8-специфичные денеддилазы, такие как NEDP1 или DEN1, необходимы для обработки NEDD8 пропептид на С-концевом мотиве диглицина и для удаления NEDD8 из куллинов (Gan-Erdene et al., 2003) [предоставлено OMIM]^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000166192 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051705 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мендоза Х.М., Шен Л.Н., Боттинг С., Льюис А., Чен Дж., Инк Б., Хэй RT (июль 2003 г.). «NEDP1, высококонсервативная цистеиновая протеаза, которая deNEDDylates Cullins». J Biol Chem. 278 (28): 25637–43. Дои:10.1074 / jbc.M212948200. PMID  12730221.
6. Ган-Эрдене Т., Нагамалесвари К., Инь Л., Ву К., Пан З. К., Уилкинсон К.Д. (июль 2003 г.). «Идентификация и характеристика DEN1, денеддилазы семейства ULP». J Biol Chem. 278 (31): 28892–900. Дои:10.1074 / jbc.M302890200. PMID  12759362.
7. «Ген Entrez: SENP8, член семейства SUMO / сентринспецифическая пептидаза 8».

дальнейшее чтение

• Миколайчик Дж., Драг М., Бекеш М., Цао Дж. Т., Ронаи З., Сальвесен Г.С. (2007). «Малый убиквитин-связанный модификатор (SUMO) -специфические протеазы: профилирование специфичности и активности человеческих SENP». J. Biol. Chem. 282 (36): 26217–24. Дои:10.1074 / jbc.M702444200. PMID  17591783.
• Drag M, Mikolajczyk J, Krishnakumar IM, Huang Z, Salvesen GS (2008). «Профили активности человеческих deSUMOylating энзимов (SENP) с синтетическими субстратами предполагает неожиданную специфичность двух недавно охарактеризованных членов этого семейства». Biochem. J. 409 (2): 461–9. Дои:10.1042 / BJ20070940. PMID  17916063.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ву К., Ямоа К., Долиос Дж. И др. (2003). «DEN1 представляет собой протеазу с двойной функцией, способную обрабатывать C-конец Nedd8 и деконъюгировать гипер-неддилированный CUL1». J. Biol. Chem. 278 (31): 28882–91. Дои:10.1074 / jbc.M302888200. PMID  12759363.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Xirodimas DP, Saville MK, Bourdon JC и др. (2004). «Mdm2-опосредованная NEDD8 конъюгация р53 ингибирует его транскрипционную активность». Клетка. 118 (1): 83–97. Дои:10.1016 / j.cell.2004.06.016. PMID  15242646.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Reverter D, Wu K, Erdene TG и др. (2005). «Структура комплекса между Nedd8 и членом семейства протеаз Ulp / Senp Den1». J. Mol. Биол. 345 (1): 141–51. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.10.022. PMID  15567417.
• Шен Л.Н., Лю Х., Донг С. и др. (2005). «Структурная основа дискриминации убиквитина NEDD8 ферментом deNEDDylating NEDP1». EMBO J. 24 (7): 1341–51. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600628. ЧВК  1142549. PMID  15775960.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q96LD8 (Сентрин-специфическая протеаза 8) на PDBe-KB.