SEMA5A - SEMA5A

SEMA5A
Идентификаторы
Псевдонимы	SEMA5A, SEMAF, semF, семафорин 5A
Внешние идентификаторы	OMIM: 609297 MGI: 107556 ГомолоГен: 2949 Генные карты: SEMA5A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5п15.31 Начинать 9,035,033 бп[1] Конец 9,546,075 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 B3.1 | 15 13,02 см Начинать 32,244,810 бп[2] Конец 32,696,341 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • хондроитинсульфат связывание протеогликанов • гепарансульфат связывание протеогликанов • привязка синдекана • связывание рецептора семафорина • связывание нейропилина • хеморепеллентная активность Сотовый компонент • мембрана • клеточная мембрана • внеклеточная экзосома • неотъемлемый компонент мембраны • внеклеточный Биологический процесс • отрицательная регуляция процесса апоптоза эндотелиальных клеток • отрицательная регуляция клеточной адгезии • дифференциация клеток • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • положительная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток • положительная регуляция хемотаксиса эндотелиальных клеток • передача сигналов от клетки к клетке • положительная регуляция удлинения аксонов, участвующих в ведении аксонов • пролиферация эндотелиальных клеток кровеносных сосудов, участвующих в прорастании ангиогенеза • развитие нервной системы • положительная регуляция ангиогенеза • развитие многоклеточного организма • развитие промежуточного мозга • клеточная адгезия • кластеризация сигналов • хемотаксис клеток • положительный хемотаксис • аксональная фасцикуляция • положительная регуляция деполимеризации актиновых филаментов • отрицательная регуляция удлинения аксонов, участвующих в ведении аксонов • отрицательный хемотаксис • миграция клеток нервного гребня • положительное регулирование миграции клеток • семафорин-плексиновый сигнальный путь • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt • расширение аксона • управление проекцией нейронов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9037	20356
Ансамбль	ENSG00000112902	ENSMUSG00000022231
UniProt	Q13591	Q62217 Q3UPZ0
RefSeq (мРНК)	NM_003966	NM_009154
RefSeq (белок)	NP_003957	NP_033180
Расположение (UCSC)	Chr 5: 9.04 - 9.55 Мб	Chr 15: 32,24 - 32,7 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Семафорин-5А это белок что у людей кодируется SEMA5A ген.^[5][6][7]

Члены семейства белков семафоринов, такие как SEMA5A, участвуют в аксональное руководство в течение нейронное развитие (Адамс и др., 1996 г.) [предоставлено OMIM]^[7]

Семафорин 5А также играет роль в аутизм, снижая способность нейроны для формирования связей с другими нейронами в определенных областях мозга (Mosca-Boidron et al, 2016).

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112902 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022231 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Адамс Р. Х., Бец Х., Пушель А. В. (февраль 1997 г.). «Новый класс семафоринов мышей, гомологичных тромбоспондину, дифференциально экспрессируется во время раннего эмбриогенеза». Мех Дев. 57 (1): 33–45. Дои:10.1016/0925-4773(96)00525-4. PMID  8817451. S2CID  17827262.
6. Simmons AD, Puschel AW, McPherson JD, Overhauser J, Lovett M (март 1998 г.). «Молекулярное клонирование и картирование человеческого семафорина F из интервала кандидатов Cri-du-chat». Biochem Biophys Res Commun. 242 (3): 685–91. Дои:10.1006 / bbrc.1997.8027. PMID  9464278.
7. «Ген Entrez: сема-домен SEMA5A, семь тромбоспондиновых повторов (типа 1 и типа 1-подобных), трансмембранный домен (TM) и короткий цитоплазматический домен (семафорин) 5A».

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Симмонс А.Д., Оверхаузер Дж., Ловетт М (1997). «Выделение кДНК из критической области Cri-du-chat прямым скринингом библиотеки кДНК, специфичной для 5 хромосомы». Genome Res. 7 (2): 118–27. Дои:10.1101 / gr.7.2.118. PMID  9049630.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Артигиани С., Конротто П., Фаззари П. и др. (2005). «Плексин-В3 - функциональный рецептор семафорина 5А». EMBO Rep. 5 (7): 710–4. Дои:10.1038 / sj.embor.7400189. ЧВК  1299100. PMID  15218527.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Шмутц Дж., Мартин Дж., Терри А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 5 человека». Природа. 431 (7006): 268–74. Дои:10.1038 / природа02919. PMID  15372022.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Мелин М., Карлссон Б., Анкарсатер Х. и др. (2007). «Конституционное подавление экспрессии SEMA5A при аутизме». Нейропсихобиология. 54 (1): 64–9. Дои:10.1159/000096040. ЧВК  2553518. PMID  17028446.