SEC31A - SEC31A

SEC31A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3WXA
Идентификаторы
Псевдонимы	SEC31A, ABP125, ABP130, HSPC334, SEC31L1, HSPC275, гомолог A SEC31, компонент комплекса оболочки COPII, NEDSOSB
Внешние идентификаторы	OMIM: 610257 MGI: 1916412 ГомолоГен: 42056 Генные карты: SEC31A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q21.22 Начните 82,818,509 бп[1] Конец 82,901,166 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 E4 Начните 100,361,649 бп[2] Конец 100,416,234 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • кальций-зависимое связывание с белками • структурная молекулярная активность Сотовый компонент • ER, покрытый COPII, в транспортную везикулу Гольджи • цитоплазматический пузырек • ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • перинуклеарная область цитоплазмы • мембрана • эндоплазматический ретикулум • цитоплазма • место выхода эндоплазматического ретикулума • мембрана эндоплазматического ретикулума • везикулярная оболочка • Мембрана Гольджи • цитозоль • Покрытие везикул COPII Биологический процесс • IRE1-опосредованный ответ развернутого белка • ответ на ион кальция • Покрытие везикул COPII • везикулярный транспорт • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • транспорт белка • процессинг антигена и презентация пептидного антигена через MHC класса I • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • загрузка груза в везикулу, покрытую COPII • внутриклеточный транспорт белка • Почкование пузырьков, покрытых COPII • организация эндоплазматического ретикулума Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	22872	69162
Ансамбль	ENSG00000138674	ENSMUSG00000035325
UniProt	O94979	Q3UPL0
RefSeq (мРНК)	NM_001077206 NM_001077207 NM_001077208 NM_001191049 NM_001300744 NM_001300745 NM_014933 NM_016211 NM_001318119 NM_001318120	NM_026969 NM_001359323 NM_001359332 NM_001359344 NM_001359348 NM_001359349 NM_001359350
RefSeq (белок)	NP_001070674 NP_001070675 NP_001070676 NP_001177978 NP_001287673 NP_001287674 NP_001305048 NP_001305049 NP_057295	NP_081245 NP_001346252 NP_001346261 NP_001346273 NP_001346277 NP_001346278 NP_001346279
Расположение (UCSC)	Chr 4: 82,82 - 82,9 Мб	Chr 5: 100,36 - 100,42 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белковый транспортный белок Sec31A это белок что у людей кодируется SEC31A ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, подобен белку SEC31 белок из дрожжи. Известно, что дрожжевой белок SEC31 является компонентом COPII белковый комплекс, который отвечает за отпочкование пузырьков из эндоплазматического ретикулума (ER). Было обнаружено, что этот белок колокализируется с SEC13, одним из других компонентов COPII, в субклеточных структурах, соответствующих транспортной функции везикул. Эксперимент по истощению иммунитета подтвердил, что этот белок необходим для транспорта ER-Golgi. Альтернативная сварка приводит к множественным вариантам транскрипта, кодирующим разные изоформы.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138674 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035325 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (6): 355–64. Дои:10.1093 / днарес / 5.6.355. PMID  10048485.
6. Тан Б.Л., Чжан Т., Лоу Д.Й., Вонг Е.Т., Хорстманн Х., Хонг В. (май 2000 г.). «Гомологи дрожжей sec31p у млекопитающих. Повсеместно экспрессируемая форма локализована в местах выхода эндоплазматического ретикулума (ER) и важна для транспорта ER-Golgi». Журнал биологической химии. 275 (18): 13597–604. Дои:10.1074 / jbc.275.18.13597. PMID  10788476.
7. «Ген Entrez: SEC31A гомолог SEC31 A (S. cerevisiae)».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ким Дж. Х., Хонг Дж. А., Пих К. Т., Хван И. (апрель 2001 г.). «Идентификация и выделение дифференциально экспрессируемых генов в кератиноцитах ротовой полости человека, подвергнутых осмотическому стрессу». Архивы оральной биологии. 46 (4): 335–41. Дои:10.1016 / S0003-9969 (00) 00133-3. PMID  11269867.
• Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Fariss RN, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (июнь 2002 г.). «Анализ экспрессируемой последовательности меток человеческого RPE / сосудистой оболочки для проекта NEIBank: более 6000 неизбыточных транскриптов, новые гены и варианты сплайсинга». Молекулярное зрение. 8: 205–20. PMID  12107410.
• Геваерт К., Гётальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (Май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природа Биотехнологии. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Loïodice I, Alves A, Rabut G, Van Overbeek M, Ellenberg J, Sibarita JB, Doye V (июль 2004 г.). «Весь комплекс Nup107-160, включая трех новых членов, нацелен как единое целое на кинетохоры в митозе». Молекулярная биология клетки. 15 (7): 3333–44. Дои:10.1091 / mbc.E03-12-0878. ЧВК  452587. PMID  15146057.
• Панагопулос И., Нильссон Т., Домански Г.А., Исакссон М., Линдблом П., Мертенс Ф., Мандаль Н. (март 2006 г.). «Слияние генов SEC31L1 и ALK в воспалительной миофибробластической опухоли». Международный журнал рака. 118 (5): 1181–6. Дои:10.1002 / ijc.21490. PMID  16161041. S2CID  6860211.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кусида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Стагг С.М., Гюркан С., Фаулер Д.М., ЛаПойнт П., Фосс Т.Р., Поттер С.С., Каррагер Б., Балч В.Е. (январь 2006 г.). "Структура защитной клетки Sec13 / 31 COPII". Природа. 439 (7073): 234–8. Дои:10.1038 / природа04339. PMID  16407955. S2CID  2426465.
• Ямасаки А., Тани К., Ямамото А., Китамура Н., Комада М. (ноябрь 2006 г.). «Са2 + -связывающий белок ALG-2 рекрутируется Sec31A в сайты выхода эндоплазматического ретикулума и стабилизирует локализацию Sec31A». Молекулярная биология клетки. 17 (11): 4876–87. Дои:10.1091 / mbc.E06-05-0444. ЧВК  1635383. PMID  16957052.
• Сибата Х, Сузуки Х, Йошида Х, Маки М (февраль 2007 г.). «ALG-2 напрямую связывает Sec31A и локализуется в сайтах выхода эндоплазматического ретикулума Са2 + -зависимым образом». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 353 (3): 756–63. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.12.101. PMID  17196169.
• la Cour JM, Mollerup J, Berchtold MW (февраль 2007 г.). «ALG-2 колеблется в субклеточной локализации вместе с колебаниями кальция». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 353 (4): 1063–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.12.143. PMID  17214967.