SEC22B - SEC22B

SEC22B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2NUP, 2ГАЙКА, 3EGD, 3EGX
Идентификаторы
Псевдонимы	SEC22B, ERS-24, SEC22L1, гомолог B SEC22, белок транспорта везикул (ген / псевдоген), гомолог B SEC22, белок транспорта везикул
Внешние идентификаторы	OMIM: 604029 MGI: 1338759 ГомолоГен: 3597 Генные карты: SEC22B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п12 Начинать 120,150,898 бп[1] Конец 120,176,520 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • Активность рецептора SNAP • GO: 0001948 связывание с белками • связывание синтаксина • Привязка SNARE Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • аппарат Гольджи • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • меланосома • эндоплазматический ретикулум • эндоплазматический ретикулум-мембрана промежуточного отсека Гольджи • эндоплазматический ретикулум-промежуточный компартмент Гольджи • Комплекс SNARE • Мембрана Гольджи • транспортная везикула • мембрана фагоцитарных везикул • ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи • синаптический пузырек Биологический процесс • положительная регуляция белкового катаболического процесса • слияние пузырьков с помощью аппарата Гольджи • Покрытие везикул COPII • транспорт белка • везикулярный транспорт • экзоцитоз • ретроградный транспорт, опосредованный пузырьками, Гольджи в ER • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса I, TAP-зависимый • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • слияние везикул с мембраной эндоплазматического ретикулума и промежуточного компартмента Гольджи (ERGIC) • отрицательная регуляция сборки аутофагосом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9554	20333
Ансамбль	ENSG00000265808	ENSMUSG00000027879
UniProt	O75396	O08547
RefSeq (мРНК)	NM_004892	NM_011342
RefSeq (белок)	NP_004883	NP_035472
Расположение (UCSC)	Chr 1: 120,15 - 120,18 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок переноса везикул SEC22b это белок что у людей кодируется SEC22B ген.^[4][5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков транспорта везикул SEC22. По-видимому, он образует комплекс с SNARE и, как полагают, играет роль в перемещении белка ER-Golgi. Этот протеин очень похож на протеины Mus musculus и Cricetulus griseus. Имеются данные об использовании нескольких сайтов полиаденилирования для транскрипта.^[6] Было показано, что SEC22B взаимодействует с синтаксином 18.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000265808 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Hay JC, Chao DS, Kuo CS, Scheller RH (апрель 1997 г.). «Белковые взаимодействия, регулирующие транспорт везикул между эндоплазматическим ретикулумом и аппаратом Гольджи в клетках млекопитающих». Клетка. 89 (1): 149–58. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80191-9. PMID  9094723.
5. Окумура AJ, Hatsuzawa K, Tamura T., Nagaya H, Saeki K, Okumura F, Nagao K, Nishikawa M, Yoshimura A, Wada I (февраль 2006 г.). «Вовлечение нового Q-SNARE, D12, в контроль качества эндомембранной системы». Журнал биологической химии. 281 (7): 4495–506. Дои:10.1074 / jbc.M509715200. PMID  16354670.
6. «Ген Entrez: SEC22B, гомолог B белка переноса везикул SEC22 (S. cerevisiae)».

дальнейшее чтение

• Chi A, Valencia JC, Hu ZZ, Watabe H, Yamaguchi H, Mangini NJ, Huang H, Canfield VA, Cheng KC, Yang F, Abe R, Yamagishi S, Shabanowitz J, Hearing VJ, Wu C, Appella E, Hunt DF (Ноябрь 2006 г.). «Протеомная и биоинформатическая характеристика биогенеза и функции меланосом». Журнал протеомных исследований. 5 (11): 3135–44. Дои:10.1021 / pr060363j. PMID  17081065.
• Breuza L, Halbeisen R, Jenö P, Otte S, Barlowe C, Hong W., Hauri HP (ноябрь 2004 г.). «Протеомика мембран эндоплазматического ретикулума-промежуточного компартмента Гольджи (ERGIC) из клеток HepG2, обработанных брефельдином А, позволяет идентифицировать ERGIC-32, новый циклический белок, который взаимодействует с Erv46 человека». Журнал биологической химии. 279 (45): 47242–53. Дои:10.1074 / jbc.M406644200. PMID  15308636.
• Накадзима К., Хиросе Х, Танигути М., Курашина Х., Арасаки К., Нагахама М., Тани К., Ямамото А., Тагая М. (август 2004 г.). «Участие BNIP1 в апоптозе и слиянии мембран эндоплазматического ретикулума». Журнал EMBO. 23 (16): 3216–26. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600333. ЧВК  514507. PMID  15272311.
• Фу Г.К., Ван Дж. Т., Ян Дж., Ау-Ён Дж., Стюв Л.Л. (июль 2004 г.). «Циклическая быстрая амплификация концов кДНК для клонирования частичных генов с высокой пропускной способностью». Геномика. 84 (1): 205–10. Дои:10.1016 / j.ygeno.2004.01.011. PMID  15203218.
• Хиросе Х, Арасаки К., Дохмае Н., Такио К., Хацудзава К., Нагахама М., Тани К., Ямамото А., Тохьяма М., Тагая М. (март 2004 г.). «Влияние ZW10 на мембранный перенос между эндоплазматическим ретикулумом и Гольджи». Журнал EMBO. 23 (6): 1267–78. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600135. ЧВК  381410. PMID  15029241.
• Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Xu D, Joglekar AP, Williams AL, Hay JC (декабрь 2000 г.). "Субъединичная структура комплекса ER / Golgi SNARE млекопитающих". Журнал биологической химии. 275 (50): 39631–9. Дои:10.1074 / jbc.M007684200. PMID  11035026.
• Парлати Ф., МакНью Дж. А., Фукуда Р., Миллер Р., Зёлльнер Т. Х., Ротман Дж. Э. (сентябрь 2000 г.). «Топологическое ограничение SNARE-зависимого слияния мембран». Природа. 407 (6801): 194–8. Дои:10.1038/35025076. PMID  11001058.
• Мао М, Фу Джи, Ву Дж.С., Чжан К.Х., Чжоу Дж., Кан LX, Хуан К.Х., Хе К.Л., Гу Б.В., Хан З.Г., Шен Й, Гу Дж, Юй Ю, Сюй Ш, Ван YX, Чен С.Дж., Чен З. (Июль 1998 г.). «Идентификация генов, экспрессируемых в человеческих CD34 (+) гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках, с помощью тегов экспрессируемой последовательности и эффективного клонирования кДНК полной длины». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (14): 8175–80. Дои:10.1073 / пнас.95.14.8175. ЧВК  20949. PMID  9653160.