Рибосомный лидер S15 - Ribosomal S15 leader

Рибосомный лидер S15
RF00114-rscape.svg
Идентификаторы
СимволS15
РфамRF00114
Прочие данные
РНК типСнг; лидер
Домен (ы)Бактерии
ТАКSO: 0005836
PDB структурыPDBe

S15 Лидеры рибосомных белков являются частью биогенез рибосом. Они использовались в качестве механизма ауторегуляции для контроля концентрации рибосомальные белки S15. Структура расположена в 5'-нетранслируемых областях мРНК кодирование рибосомальные белки S15 (rpsO). Множественные различные структурные типы лидеров рибосомных белков S15 известны у разных организмов.

В Кишечная палочка рибосомальный лидер S15 является Элемент РНК что может образовать две альтернативы структуры обнаружен в рибосомном белке S15. Одна из двух альтернативных структур представляет собой серию из трех заколки для волос, другой включает псевдоузел.[1] Эта структура вызывает трансляционную регуляцию S15 белок. У других видов сохранились только две последние шпильки.

Другой пример для Бактерии был предсказан в Флавобактерии.[2] Вторичная структура его предполагаемого рибосомного лидера у большинства видов состоит из шпильки. Однако у некоторых видов эта шпилька отсутствует. Такое отсутствие очевидной вторичной структуры было бы необычным для рибосомного лидера, что делает этот кандидат в рибосомный лидер менее определенным предсказанием.[2]

Два примера в Археи (один в Галобактерии и один в Метаномикробия ) были предсказаны.[2] В этой структуре сходство между рРНК сайт связывания S15 рибосомальный белок и S15 лидер рибосомального белка сайт связывания не обнаружен.[2] Это предполагает, что рибосомные лидеры у этих организмов функционируют, имитируя сайт связывания S15 в рРНК.

Предсказанная вторичная структура и сохранение последовательности лидера рибосомного белка S15 в Археи. Это изображение было адаптировано из предыдущей публикации. [2]


Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Бенар Л., Филипп С., Эресманн Б., Эресманн С., Портье С. (1996). «Псевдоузел и контроль трансляции в экспрессии рибосомного белка S15». Биохимия. 78 (7): 568–576. Дои:10.1016 / S0300-9084 (96) 80003-4. ЧВК  7131963. PMID  8955900.
  2. ^ а б c d е Эккерт, я; Вайнберг, З. (24 мая 2020 г.). «Открытие 20 новых кандидатов в лидеры рибосом у бактерий и архей». BMC Microbiology. 20 (130): 130. Дои:10.1186 / s12866-020-01823-6. ЧВК  7247131. PMID  32448158.

внешняя ссылка