Рибономика - Ribonomics

Рибономика это исследование рибонуклеиновых кислот (РНК ) связан с РНК-связывающие белки (ОДП). Термин был введен Роберт Седергрен и коллеги^[1] кто использовал инструмент биоинформатического поиска, чтобы открыть роман рибозимы и мотивы РНК, первоначально обнаруженные в ВИЧ.Рибономика, как геномика или протеомика, представляет собой крупномасштабный и высокопроизводительный подход к идентификации подмножеств РНК по их ассоциации с белки в камерах. Поскольку многие информационные РНК (мРНК) связаны с несколькими процессами, этот метод предлагает простой механизм для изучения взаимосвязи различных внутриклеточный системы.Прокариоты совместно регулируют гены, общие для клеточных процессов, через полицистронный оперон. Поскольку эукариотический транскрипция производит белки, кодирующие мРНК, в моноцистронный мода, многие генные продукты должны одновременно экспрессироваться (см. экспрессия гена ) и переведено по времени. ОДП считаются^{[кем? ]} быть молекулами, которые физически и биохимически организуют эти сообщения в различные клеточные области, где они могут быть переведены, разложены или сохранены. Поэтому считается, что изучение транскриптов, связанных с RBPs^{[кем? ]} быть важным в эукариоты как механизм согласованных генная регуляция. Вероятными биохимическими процессами, которые объясняют эту регуляцию, является ускоренная / отсроченная деградация РНК. Считается, что помимо влияния на период полужизни РНК, скорость трансляции также зависит от взаимодействия РНК-белок. Дрозофила Семья ELAV,^[2] семья Пуф^[3] в дрожжи, и человек Ла, Ро,^[4] и FMR^[5] Белки являются известными примерами RBP, показывающими различные виды и процессы, с которыми связана посттранскрипционная регуляция генов.

Смотрите также

• ELAVL1
• ELAVL2
• ELAVL3
• Расшифровка неизвестной функции

использованная литература

1. Бурдо В., Фербейр Г., Пейджо М., Пакуин Б., Седергрен Р. (ноябрь 1999 г.). «Распределение мотивов РНК в природных последовательностях». Нуклеиновые кислоты Res. 27 (22): 4457–67. Дои:10.1093 / nar / 27.22.4457. ЧВК  148730. PMID  10536156.
2. "Семья ЭЛАВ". Получено 30 августа 2019.
3. Гербер А.П., Хершлаг Д., Браун П.О. (март 2004 г.). «Обширная ассоциация функционально и цитотопно связанных мРНК с РНК-связывающими белками семейства Puf в дрожжах». PLoS Biol. 2 (3): E79. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020079. ЧВК  368173. PMID  15024427.
4. Kosmopoulou A, Vlassi M, Stavrakoudis A, Sakarellos C, Sakarellos-Daitsiotis M (июль 2006 г.). «Т-клеточные эпитопы аутоантигена La / SSB: прогноз, основанный на моделировании гомологии HLA-DQ2 / DQ7 с комплексом инсулин-B-пептид / HLA-DQ8». J Comput Chem. 27 (9): 1033–44. Дои:10.1002 / jcc.20422. PMID  16639700.
5. Маккензи Дж. Дж., Сумарго И., Тейлор С. А. (июль 2006 г.). «Скрытая полная мутация у мужчины с классическим фенотипом ломкой Х-хромосомы». Clin. Genet. 70 (1): 39–42. Дои:10.1111 / j.1399-0004.2006.00634.x. PMID  16813602.