Ретикулон 4 - Reticulon 4

RTN4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2G31, 2JV5
Идентификаторы
Псевдонимы	RTN4, ASY, NI220 / 250, NOGO, NOGO-A, NOGOC, NSP, NSP-CL, Nbla00271, Nbla10545, Nogo-B, Nogo-C, RTN-X, RTN4-A, RTN4-B1, RTN4-B2, RTN4 -C, Ретикулон 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 604475 MGI: 1915835 ГомолоГен: 10743 Генные карты: RTN4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п16.1 Начинать 54,972,187 бп[1] Конец 55,112,621 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A3.3 Начинать 29,692,947 бп[2] Конец 29,744,331 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание кадгерина • связывание убиквитин-протеин-лигазы Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • проекция клетки • ядерная оболочка • мембрана • неотъемлемый компонент мембраны эндоплазматического ретикулума • внутриклеточный • эндоплазматический ретикулум • мембрана эндоплазматического ретикулума • клеточная мембрана • внеклеточная экзосома • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • трубчатая сеть эндоплазматического ретикулума • тело нейрональной клетки • мембрана трубчатой ​​сети эндоплазматического ретикулума • соединение клеток Биологический процесс • сборка ядерно-порового комплекса • регуляция апоптотического процесса • миграция под контролем радиальной глии коры головного мозга • регуляция морфогенеза ветвления нерва • сердечный эпителиальный переход в мезенхимальный • отрицательная регуляция удлинения аксона • апоптотический процесс • отрицательная регуляция аксоногенеза • развитие нервной системы • регуляция развития нервной системы • формирование трубчатой ​​сети эндоплазматического ретикулума • организация трубчатой ​​сети эндоплазматического ретикулума • регулирование миграции клеток • отрицательная регуляция роста клеток • аксональная фасцикуляция • положительная регуляция миграции эпителиальных клеток • положительная регуляция пролиферации эпителиальных клеток молочных желез • стабилизация белка • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • положительная регуляция локализации белка в эндоплазматическом ретикулуме • положительная регуляция сигнального пути ERBB3 • мембранная организация трубчатой ​​сети эндоплазматического ретикулума • образование бластоцисты • положительная регуляция сигнального пути толл-подобного рецептора 9 • локализация белка в лизосоме • клеточный гомеостаз сфинголипидов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	57142	68585
Ансамбль	ENSG00000115310	ENSMUSG00000020458
UniProt	Q9NQC3	Q99P72
RefSeq (мРНК)	NM_007008 NM_020532 NM_153828 NM_207520 NM_207521 NM_001321859 NM_001321860 NM_001321861 NM_001321862 NM_001321863 NM_001321904	NM_024226 NM_194051 NM_194052 NM_194053 NM_194054
RefSeq (белок)	NP_001308788 NP_001308789 NP_001308790 NP_001308791 NP_001308792 NP_001308833 NP_008939 NP_065393 NP_722550 NP_997403 NP_997404	NP_077188 NP_918940 NP_918941 NP_918942 NP_918943
Расположение (UCSC)	Chr 2: 54.97 - 55.11 Мб	Chr 11: 29.69 - 29.74 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ретикулон 4, также известный как Ингибитор роста нейритов или же Ного, это белок что у людей кодируется RTN4 ген^[5][6][7] который был идентифицирован как ингибитор из нейрит рост, характерный для Центральная нервная система. Во время нервного развития Nogo экспрессируется в основном нейронами и обеспечивает подавляющий сигнал для миграции и разрастания эндотелиальных (концевых) клеток ЦНС, тем самым ограничивая плотность кровеносных сосудов.

Этот ген принадлежит к семейству сетка -кодирующие гены. Ретикулоны связаны с эндоплазматическим ретикулумом и участвуют в нейроэндокринной секреции или в мембранном переносе нейроэндокринных клеток. Продукт этого гена является мощным ингибитором роста нейритов, который также может помочь блокировать регенерацию центральной нервной системы у высших позвоночных. Были идентифицированы альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, полученные как в результате дифференциального сплайсинга, так и в результате использования дифференциального промотора, и кодирующие различные изоформы.^[7] Есть три изоформы: Nogo A, B и C. Nogo-A имеет два известных ингибирующих домена, включая амино-Nogo на N-конце и Nogo-66, который составляет внеклеточную петлю молекулы. И амино-Nogo, и Nogo-66 участвуют в ингибирующих ответах, где амино-Nogo является сильным ингибитором роста нейритов, а Nogo-66 участвует в конус роста разрушение.^[8]

Исследования показывают, что блокирование Nogo-A при повреждении нейронов (от таких заболеваний, как рассеянный склероз ) поможет защитить или восстановить поврежденные нейроны.^[8][9] Изучение механизмов этого белка представляет большой потенциал для лечения аутоиммунный опосредованный демиелинизирующие заболевания и повреждение спинного мозга регенерация. Также было обнаружено, что он играет ключевую роль в процессе, посредством которого физические упражнения улучшают процессы обучения и памяти в мозге.^[10] Также было показано, что Nogo-A отрицательно регулирует рост и восстановление сосудов после ишемического инсульта. Генетическая делеция и опосредованная антителами блокада Nogo-A привели к усилению реваскуляризации и функциональному восстановлению в экспериментальной модели инсульта на мышах.^[11][12][13] Более того, сосудистая утечка, являющаяся основным осложнением после инсульта, была уменьшена после лечения антителом против Nogo-A.^[14]

Взаимодействия

Ретикулон 4 показал взаимодействовать с WWP1,^[15] BCL2-подобный 1^[16] и Bcl-2.^[16]

Смотрите также

• Рецептор ретикулона 4

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115310 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000020458 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. ГрандПре Т., Накамура Ф., Вартаниан Т., Strittmatter SM (январь 2000 г.). «Идентификация ингибитора регенерации аксонов Nogo как белка ретикулон». Природа. 403 (6768): 439–44. Bibcode:2000Натура 403..439Г. Дои:10.1038/35000226. PMID  10667797. S2CID  1926168.
6. Ян Дж, Ю Л., Би А.Д., Чжао С.Ю. (июнь 2000 г.). «Отнесение гена ретикулона 4 человека (RTN4) к хромосоме 2p14 -> 2p13 с помощью радиационного гибридного картирования». Цитогенетика и клеточная генетика. 88 (1–2): 101–2. Дои:10.1159/000015499. PMID  10773680. S2CID  37521141.
7. «Entrez Gene: RTN4 ретикулон 4».
8. Карнезис Т., Мандемакерс В., Маккуалтер Дж.Л., Чжэн Б., Хо П.П., Джордан К.А. и др. (Июль 2004 г.). «Ингибитор роста нейритов Nogo A участвует в аутоиммунно-опосредованной демиелинизации». Природа Неврология. 7 (7): 736–44. Дои:10.1038 / nn1261. PMID  15184901. S2CID  9613584.
9. Созмен Е.Г., Розенцвейг С., Льоренте И.Л., ДиТуллио Д.Д., Мачницки М., Винтерс Х.В. и др. (Декабрь 2016 г.). «Блокада Nogo-рецептора преодолевает неэффективность ремиелинизации после инсульта белого вещества и стимулирует функциональное восстановление у старых мышей». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 113 (52): E8453 – E8462. Дои:10.1073 / pnas.1615322113. ЧВК  5206535. PMID  27956620.
10. Ли Х, Райкер С.Дж., Венкатеш К., Гири Р., Робак Л.А., Чжан И, Йе Х.Х., Шрагер П., Гигер Р.Дж. (март 2008 г.). «Синаптическая функция рецептора Nogo-66 NgR1: регуляция морфологии дендритных шипов и зависимая от активности синаптическая сила». Журнал неврологии. 28 (11): 2753–65. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.5586-07.2008. ЧВК  6670664. PMID  18337405. Сложить резюме – Eurek Alert.
11. Руст Р., Грённерт Л., Гантнер С., Энцлер А., Малдерс Г., Вебер Р. З. и др. (Июль 2019). «Таргетная терапия Nogo-A способствует восстановлению сосудов и функциональному восстановлению после инсульта». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 116 (28): 14270–14279. Дои:10.1073 / пнас.1905309116. ЧВК  6628809. PMID  31235580.
12. Ржавчина, R; Grönnert, L; Вебер, Р.З .; Малдерс, G; Шваб, Мэн (сентябрь 2019 г.). «Заправка ишемической ЦНС: направляющие молекулы для восстановления сосудов». Тенденции в неврологии. 42 (9): 644–656. Дои:10.1016 / j.tins.2019.05.006. PMID  31285047. S2CID  195834057.
13. Ржавчина, R; Гантнер, C; Шваб, Мэн (январь 2019 г.). «Про- и антиангиогенная терапия: текущее состояние и клинические последствия». Журнал FASEB. 33 (1): 34–48. Дои:10.1096 / fj.201800640RR. PMID  30085886. S2CID  51937342.
14. Руст Р., Вебер Р.З., Грённерт Л., Малдерс Г., Маурер М.А., Хофер А.С. и др. (Декабрь 2019 г.). «Антитела против Nogo-A предотвращают протекание сосудов и действуют как проангиогенные факторы после инсульта». Научные отчеты. 9 (1): 20040. Bibcode:2019НатСР ... 920040Р. Дои:10.1038 / s41598-019-56634-1. ЧВК  6934709. PMID  31882970.
15. Цинь Х, Пу Х., Ли М., Ахмед С., Сон Дж. (Декабрь 2008 г.). «Идентификация и структурный механизм нового взаимодействия между убиквитинлигазой WWP1 и Nogo-A, ключевым ингибитором регенерации центральной нервной системы». Биохимия. 47 (51): 13647–58. Дои:10.1021 / bi8017976. PMID  19035836.
16. Tagami S, Eguchi Y, Kinoshita M, Takeda M, Tsujimoto Y (ноябрь 2000 г.). «Новый белок, RTN-XS, взаимодействует как с Bcl-XL, так и с Bcl-2 в эндоплазматическом ретикулуме и снижает их антиапоптотическую активность». Онкоген. 19 (50): 5736–46. Дои:10.1038 / sj.onc.1203948. PMID  11126360.

дальнейшее чтение

• Teng FY, Tang BL (август 2008 г.). «Автономная функция клеток Nogo и ретикулонов: новая история в эндоплазматическом ретикулуме». Журнал клеточной физиологии. 216 (2): 303–8. Дои:10.1002 / jcp.21434. PMID  18330888. S2CID  34163142.
• Ng CE, Tang BL (март 2002 г.). «Nogos и рецептор Nogo-66: факторы, ингибирующие регенерацию нейронов ЦНС». Журнал неврологических исследований. 67 (5): 559–65. Дои:10.1002 / jnr.10134. PMID  11891768. S2CID  26061828.
• Ватари А., Юцудо М. (январь 2003 г.). «Многофункциональный ген ASY / Nogo / RTN-X / RTN4: апоптоз, подавление опухоли и ингибирование регенерации нейронов». Апоптоз. 8 (1): 5–9. Дои:10.1023 / А: 1021639016300. PMID  12510146. S2CID  37206000.
• Schweigreiter R, Bandtlow CE (2006). «Ного в травме спинного мозга». Журнал нейротравмы. 23 (3–4): 384–96. Дои:10.1089 / neu.2006.23.384. PMID  16629624.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (декабрь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 5 (6): 355–64. Дои:10.1093 / днарес / 5.6.355. PMID  10048485.
• Prinjha R, Moore SE, Vinson M, Blake S, Morrow R, Christie G, Michalovich D, Simmons DL, Walsh FS (январь 2000 г.). «Ингибитор роста нейритов у человека». Природа. 403 (6768): 383–4. Дои:10.1038/35000287. PMID  10667780. S2CID  205004005.
• Chen MS, Huber AB, van der Haar ME, Frank M, Schnell L, Spillmann AA, Christ F, Schwab ME (январь 2000 г.). «Nogo-A является миелин-ассоциированным ингибитором роста нейритов и антигеном моноклонального антитела IN-1». Природа. 403 (6768): 434–9. Bibcode:2000Натура 403..434C. Дои:10.1038/35000219. PMID  10667796. S2CID  4388618.
• Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Tagami S, Eguchi Y, Kinoshita M, Takeda M, Tsujimoto Y (ноябрь 2000 г.). «Новый белок, RTN-XS, взаимодействует как с Bcl-XL, так и с Bcl-2 в эндоплазматическом ретикулуме и снижает их антиапоптотическую активность». Онкоген. 19 (50): 5736–46. Дои:10.1038 / sj.onc.1203948. PMID  11126360.
• Fournier AE, GrandPre T, Strittmatter SM (январь 2001 г.). «Идентификация рецептора, опосредующего ингибирование регенерации аксонов Nogo-66». Природа. 409 (6818): 341–6. Bibcode:2001Натура.409..341F. Дои:10.1038/35053072. PMID  11201742. S2CID  4404627.
• Джозефсон А., Уиденфальк Дж., Видмер Х.В., Олсон Л., Спенгер С. (июнь 2001 г.). «Экспрессия мРНК NOGO в нервной ткани взрослого и плода человека и крысы и при травме из-за падения веса». Экспериментальная неврология. 169 (2): 319–28. Дои:10.1006 / exnr.2001.7659. PMID  11358445. S2CID  23996169.
• Zhou ZM, Sha JH, Li JM, Lin M, Zhu H, Zhou YD, Wang LR, Zhu H, Wang YQ, Zhou KY (февраль 2002 г.). «Экспрессия нового ретикулоноподобного гена в семенниках человека». Размножение. 123 (2): 227–34. Дои:10.1530 / rep.0.1230227. PMID  11866689.
• ГрандПре Т., Ли С., Strittmatter SM (май 2002 г.). «Пептид-антагонист рецептора Nogo-66 способствует регенерации аксонов». Природа. 417 (6888): 547–51. Bibcode:2002Натурал.417..547Г. Дои:10.1038 / 417547a. PMID  12037567. S2CID  4414714.
• Ху WH, Хаусманн О.Н., Ян М.С., Уолтерс В.М., Вонг П.К., Бетеа-младший (апрель 2002 г.). «Идентификация и характеристика нового митохондриального белка, взаимодействующего с Nogo (NIMP)». Журнал нейрохимии. 81 (1): 36–45. Дои:10.1046 / j.1471-4159.2002.00788.x. PMID  12067236. S2CID  38794348.
• Лю Б.П., Фурнье А., ГрандПре Т., Strittmatter SM (август 2002 г.). «Миелин-ассоциированный гликопротеин как функциональный лиганд рецептора Nogo-66». Наука. 297 (5584): 1190–3. Bibcode:2002Наука ... 297.1190Л. Дои:10.1126 / science.1073031. PMID  12089450. S2CID  1357777.
• Dupuis L, Gonzalez de Aguilar JL, di Scala F, Rene F, de Tapia M, Pradat PF, Lacomblez L, Seihlan D, Prinjha R, Walsh FS, Meininger V, Loeffler JP (август 2002 г.). «Nogo обеспечивает молекулярный маркер для диагностики бокового амиотрофического склероза». Нейробиология болезней. 10 (3): 358–65. Дои:10.1006 / nbdi.2002.0522. PMID  12270696. S2CID  45996722.
• Такэтоми М., Киношита Н., Кимура К., Китада М., Нода Т., Асу Х., Накамура Т., Иде С. (октябрь 2002 г.). «Экспрессия Nogo-A в зрелых олигодендроцитах спинного мозга крысы в ​​сочетании со специфическими молекулами». Письма о неврологии. 332 (1): 37–40. Дои:10.1016 / S0304-3940 (02) 00910-2. HDL:2433/148718. PMID  12377379. S2CID  13433362.
• Ли М., Ши Дж, Вэй З, Дэн Ф.Й., Тан Б.Л., Сон Дж. (Сентябрь 2004 г.). «Структурная характеристика функциональных доменов Nogo-A человека. Структура раствора Nogo-40, антагониста рецептора Nogo-66, усиливающего регенерацию поврежденного спинного мозга». Европейский журнал биохимии / FEBS. 271 (17): 3512–22. Дои:10.1111 / j.0014-2956.2004.04286.x. PMID  15317586.
• Ли М., Лю Дж., Сон Дж. (Август 2006 г.). «Nogo идет в чистой воде: структура раствора Nogo-60 и дизайн структурированного и растворимого в буфере Nogo-54 для усиления регенерации ЦНС». Белковая наука. 15 (8): 1835–41. Дои:10.1110 / пс 062306906. ЧВК  2242580. PMID  16877707.
• Ли М., Сон Дж. (Июль 2007 г.). «N- и C-концы молекул Nogo человека по своей природе неструктурированы: биоинформатика, CD, характеристика ЯМР и функциональные последствия». Белки. 68 (1): 100–8. Дои:10.1002 / prot.21385. PMID  17397058. S2CID  21507005.
• Ли М., Сон Дж. (Август 2007 г.). «Рецептор Nogo-B обладает внутренне неструктурированным эктодоменом и частично свернутым цитоплазматическим доменом». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 360 (1): 128–34. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.06.031. PMID  17585875.