Кривая численности ранга - Rank abundance curve

А кривая численности ранга или же Заговор Уиттакера диаграмма, используемая экологами для отображения относительное обилие видов, компонент биоразнообразие. Его также можно использовать для визуализации видовое богатство и видовая ровность. Он преодолевает недостатки индексы биоразнообразия которые не могут отобразить относительную роль различных переменных в своих расчетах.

Кривая рангового изобилия

Кривая представляет собой двухмерную диаграмму с относительной численностью по оси Y и рангом обилия по оси X.

  • Ось X: рейтинг изобилия. Самому многочисленному виду присваивается ранг 1, второму по численности - 2 и так далее.
  • Ось Y: относительная численность. Обычно измеряется в логарифмической шкале, это мера численности вида (например, числа особей) по сравнению с численностью других видов.

Интерпретация кривой рангового изобилия

Кривая рангового обилия наглядно отображает как видовое богатство, так и видовую однородность. Видовое богатство можно рассматривать как количество различных видов на диаграмме, т. Е. Сколько видов было ранжировано. Выравнивание видов отражается в наклоне линии, которая соответствует графику (при условии линейной, то есть логарифмической зависимости). Крутой градиент указывает на низкую ровность, поскольку виды с высоким рейтингом имеют гораздо более высокую численность, чем виды с низким рейтингом. Неглубокий градиент указывает на высокую равномерность, поскольку численность разных видов схожа.

Количественное сравнение кривых рангового обилия

Количественное сравнение ранговых кривых численности различных сообществ можно провести с помощью пакета RADanalysis в р. Этот пакет использует нормализация максимального ранга метод[1] в котором ранговое распределение численности выполнено путем нормализации кривых рангового обилия сообществ на одно и то же число рангов, а затем нормализации относительной численности к единице.

Рекомендации

  • Магурран, Энн Э. (2004). Измерение биологического разнообразия. Оксфорд: Блэквелл. ISBN  0-632-05633-9.
  • Уиттакер, Р. Х. (1965). «Доминирование и разнообразие в сообществах наземных растений: численные отношения видов выражают важность конкуренции в функционировании сообщества и его эволюции». Наука. 147 (3655): 250–260. Дои:10.1126 / science.147.3655.250. PMID  17788203.
Специфический
  1. ^ Саидгалати, М. (2017). «Количественное сравнение структур изобилия обобщенных сообществ: от репертуаров рецепторов B-клеток к микробиомам». PLOS Comput. Биол. 13 (1): e1005362. arXiv:1612.03692. Bibcode:2017PLSCB..13E5362S. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1005362. ЧВК  5293285. PMID  28114391.

внешняя ссылка

  • Диаграмма Уиттекера, Wiki по созданию процедурного контента - использование диаграмм Уиттекера в процедурной генерации контента
  • Пакет RADanalysis в R, Пакет в CRAN содержит функции для количественного сравнения кривых рангового содержания