RNF5 - RNF5

RNF5
Идентификаторы
Псевдонимы	RNF5, RING5, RMA1, белок безымянного пальца 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 602677 MGI: 1860076 ГомолоГен: 56004 Генные карты: RNF5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.32 Начинать 32,178,405 бп[1] Конец 32,180,793 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • активность убиквитин-протеинтрансферазы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание убиквитин-подобного белка, конъюгированного с ферментом • трансферазная активность • идентичное связывание с белками • связывание ионов цинка • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • митохондриальные мембраны • мембрана • митохондрия • Ретротранслокационный комплекс Дерлин-1 • эндоплазматический ретикулум • мембрана эндоплазматического ретикулума • отделение контроля качества эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • реакция на бактерии • убиквитинирование, связанное с белком K63 • Катаболический процесс неправильно свернутого белка, связанный с ER • катаболический процесс клеточного белка • регуляция сборки аутофагосом • убиквитинирование, связанное с белком K48 • дестабилизация белков • убиквитинирование белков • отрицательная регуляция аутофагии • трансмембранный транспорт • обрезка маннозы эндоплазматического ретикулума • убиквитин-зависимый путь ERAD • Путь ERAD • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6048	54197
Ансамбль	ENSG00000227277 ENSG00000223767 ENSG00000228907 ENSG00000183574 ENSG00000204308 ENSG00000225452 ENSG00000228405	ENSMUSG00000015478
UniProt	Q99942	O35445
RefSeq (мРНК)	NM_006913	NM_019403
RefSeq (белок)	NP_008844	NP_062276
Расположение (UCSC)	Chr 6: 32,18 - 32,18 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза RNF5 является фермент что у людей кодируется RNF5 ген.^[4][5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, содержит Безымянный палец, который, как известно, участвует во взаимодействиях белок-белок. Этот белок связан с мембраной. убиквитинлигаза. Он может регулировать подвижность клеток путем нацеливания паксиллин убиквитинирование и изменение распределения и локализации паксиллина в цитоплазме и клетке очаговые спайки.^[5]

Рекомендации

1. ENSG00000223767, ENSG00000228907, ENSG00000183574, ENSG00000204308, ENSG00000225452, ENSG00000228405 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000227277, ENSG00000223767, ENSG1800S204228 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Кюсики Х, Куга Й, Судзуки М, Такахаши Э, Хори М (апрель 1998 г.). «Клонирование, экспрессия и картирование нового гена RING-finger (RNF5), человеческого гомолога предполагаемого гена цинкового пальца из Caenorhabditis elegans». Цитогенетика и клеточная генетика. 79 (1–2): 114–7. Дои:10.1159/000134695. PMID  9533025.
5. «Ген Entrez: белок 5 безымянного пальца RNF5».

дальнейшее чтение

• Кендалл Э., Сарджент Калифорния, Кэмпбелл Р. Д. (декабрь 1990 г.). «Главный комплекс гистосовместимости человека содержит новый кластер генов между локусами HLA-D и C4 комплемента». Исследования нуклеиновых кислот. 18 (24): 7251–7. Дои:10.1093 / nar / 18.24.7251. ЧВК  332860. PMID  2259622.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Barritt DS, Pearn MT, Zisch AH, Lee SS, Javier RT, Pasquale EB, Stallcup WB (август 2000 г.). «Белок с несколькими доменами PDZ MUPP1 представляет собой цитоплазматический лиганд для трансмембранного протеогликана NG2». Журнал клеточной биохимии. 79 (2): 213–24. Дои:10.1002 / 1097-4644 (20001101) 79: 2 <213 :: AID-JCB50> 3.0.CO; 2-G. ЧВК  3501957. PMID  10967549.
• Мацуда Н., Сузуки Т., Танака К., Накано А. (май 2001 г.). «Rma1, новый тип белка пальца RING, законсервированный от Arabidopsis до человека, представляет собой мембраносвязанную убиквитинлигазу». Журнал клеточной науки. 114 (Pt 10): 1949–57. PMID  11329381.
• Пули С., Прат А., Блейн М., Оливье А., Антел Дж. (Октябрь 2001 г.). «Иммунореактивность NG2 на эндотелиальных клетках головного мозга человека». Acta Neuropathologica. 102 (4): 313–20. Дои:10.1007 / s004010000350. PMID  11603805. S2CID  1353236.
• Didier C, Broday L, Bhoumik A, Israel S, Takahashi S, Nakayama K, Thomas SM, Turner CE, Henderson S, Sabe H, Ronai Z (август 2003 г.). «RNF5, белок пальца RING, который регулирует подвижность клеток, направляя убиквитинирование паксиллина и изменяя его локализацию». Молекулярная и клеточная биология. 23 (15): 5331–45. Дои:10.1128 / MCB.23.15.5331-5345.2003. ЧВК  165736. PMID  12861019.
• Се Т., Роуэн Л., Агуадо Б., Ахерн М.Э., Мадан А., Цинь С., Кэмпбелл Р.Д., Худ Л. (декабрь 2003 г.). «Анализ области класса III главного комплекса гистосовместимости с плотным геном и его сравнение с мышью». Геномные исследования. 13 (12): 2621–36. Дои:10.1101 / гр.1736803. ЧВК  403804. PMID  14656967.
• Ленер Б., Семпл Д.И., Браун С.Е., Советник Д., Кэмпбелл Р.Д., Сандерсон С.М. (январь 2004 г.). «Анализ двухгибридной системы дрожжей с высокой производительностью и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, кодируемых в области III класса MHC человека». Геномика. 83 (1): 153–67. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID  14667819.
• Лю А.М., Вонг Й.Х. (декабрь 2004 г.). «G16-опосредованная активация ядерного фактора kappaB аденозиновым рецептором A1 включает передачу сигналов c-Src, протеинкиназы C и ERK». Журнал биологической химии. 279 (51): 53196–204. Дои:10.1074 / jbc.M410196200. PMID  15485865.
• Барриос-Родилес М., Браун К. Р., Оздамар Б., Бозе Р., Лю З., Донован Р. С., Синджо Ф., Лю Ю., Дембовы Дж., Тейлор И. В., Луга В., Прзулдж Н., Робинсон М., Сузуки Н., Хаяшизаки Ю., Юрисика И., Wrana JL (март 2005 г.). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Научный ... 307.1621B. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153. S2CID  39457788.
• Чжан Ю., Хигашиде В., Дай С., Шерман Д.М., Чжоу Д. (ноябрь 2005 г.). «Распознавание и убиквитинирование эффектора SopA Salmonella типа III с помощью убиквитиновой лигазы E3, HsRMA1». Журнал биологической химии. 280 (46): 38682–8. Дои:10.1074 / jbc.M506309200. PMID  16176924.
• Младший Дж. М., Чен Л., Рен Х.Й., Россер М. Ф., Тернбулл Э. Л., Фан С. Ю., Паттерсон С., Сир Д. М. (август 2006 г.). «Последовательные контрольные точки контроля качества, сортировка неправильно свернутого регулятора трансмембранной проводимости при муковисцидозе». Клетка. 126 (3): 571–82. Дои:10.1016 / j.cell.2006.06.041. PMID  16901789. S2CID  51698.
• Бромберг К.Д., Клюгер Х.М., Делоне А., Аббас С., ДиВито К.А., Краевски С., Ронаи З. (сентябрь 2007 г.). «Повышенная экспрессия убиквитинлигазы E3 RNF5 связана со снижением выживаемости при раке груди». Исследования рака. 67 (17): 8172–9. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-0045. ЧВК  2962863. PMID  17804730.
• Fujita Y, Khateb A, Li Y, Tinoco R, Zhang T, Bar-Yoseph H, Tam MA, Chowers Y, Sabo E, Gerassy-Vainberg S, Starosvetsky E, James B., Brown K, Shen-Orr SS, Bradley LM , Tessier PA, Ronai ZA (сентябрь 2018 г.). «Регулирование стабильности S100A8 с помощью RNF5 в клетках кишечного эпителия определяет воспаление кишечника и тяжесть колита». Отчеты по ячейкам. 24 (12): 3296–3311.e6. Дои:10.1016 / j.celrep.2018.08.057. ЧВК  6185744. PMID  30232010.

внешняя ссылка

• RNF5 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)