РИПК2 - RIPK2

РИПК2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4C8B, 2N7Z, 5AR3, 5AR2, 5AR7, 5AR8, 5AR5, 5AR4, 2N83, 5J7B, 5J79
Идентификаторы
Псевдонимы	РИПК2, CARD3, CARDIAK, CCK, GIG30, RICK, RIP2, рецептор-взаимодействующая серин / треониновая киназа 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 603455 MGI: 1891456 ГомолоГен: 37856 Генные карты: РИПК2
Номер ЕС	2.7.10.2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q21.3 Начинать 89,757,806 бп[1] Конец 89,791,064 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 A2 | 4 6,7 см Начинать 16,122,733 бп[2] Конец 16,163,647 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Привязка домена LIM • киназная активность • Привязка домена CARD • рецепторное связывание • Связывание АТФ • активность протеинкиназы • немембранная активность протеинтирозинкиназы • трансферазная активность • активность гомодимеризации белков • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеотидов • активность преобразователя сигнала • активность протеин-серин / треонинкиназы • идентичное связывание с белками • связывание каспазы • JUN киназа киназа киназная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитоскелет • везикул • цитозоль • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • ответ на интерлейкин-1 • положительная регуляция опосредованного цитокинами сигнального пути • ответ на экзогенную дцРНК • положительное регулирование каскада JNK • положительная регуляция ксенофагии • клеточный ответ на мурамилдипептид • фосфорилирование белков • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • клеточный ответ на пептидогликан • положительная регуляция стресс-активируемого каскада MAPK • защитный ответ на грамположительные бактерии • апоптотический процесс • регуляция апоптотического процесса • положительное регулирование пролиферации незрелых Т-клеток • положительная регуляция продукции интерлейкина-12 • положительное регулирование выработки интерферона-альфа • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • Каскад JNK • ответ на интерлейкин-12 • нуклеотид-связывающий домен олигомеризации, содержащий 2 сигнальных пути • положительная регуляция иммунного ответа Т-хелперов 1 типа • положительное регулирование пролиферации альфа-бета Т-клеток • положительная регуляция продукции интерлейкина-6 • положительное регулирование выработки фактора некроза опухоли • положительная регуляция фосфорилирования пептидилтирозина • воспалительная реакция • I-kappaB киназа / передача сигналов NF-kappaB • нуклеотид-связывающий домен олигомеризации, содержащий 1 сигнальный путь • положительное регулирование выработки интерферона-бета • фосфорилирование • иммунная система • положительная регуляция дифференцировки Т-хелперов 1 клетки • отрицательная регуляция апоптотического процесса • активация активности MAPK • клеточный ответ на липотейхоевую кислоту • положительная регуляция выработки интерлейкина-2 • положительное регулирование производства хемокинов • нуклеотид-связывающий домен олигомеризации, содержащий сигнальный путь • положительная регуляция убиквитинирования белков • липополисахарид-опосредованный сигнальный путь • положительное регулирование выработки гамма-интерферона • Пролиферация Т-клеток • положительная регуляция фосфорилирования пептидил-треонина • положительная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • фосфорилирование пептидилтирозина • клеточный ответ на липополисахарид • Путь передачи сигналов рецептора Т-клеток • ответ на интерлейкин-18 • преобразование сигнала • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • сигнальный путь толл-подобного рецептора 4 • сигнальный путь toll-подобного рецептора 2 • врожденная иммунная система • Каскад MAPK • адаптивный иммунный ответ • положительное регулирование связывания белков • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • активация активности эндопептидазы цистеинового типа • положительное регулирование гибели клеток • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-1 • активация активности JNKK • активация активности киназы JUN Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8767	192656
Ансамбль	ENSG00000104312	ENSMUSG00000041135
UniProt	O43353	P58801
RefSeq (мРНК)	NM_003821 NM_001375360	NM_138952 NM_001329751
RefSeq (белок)	NP_003812 NP_001362289	NP_001316680 NP_620402
Расположение (UCSC)	Chr 8: 89.76 - 89.79 Мб	Chr 4: 16.12 - 16.16 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рецептор-взаимодействующая серин / треонин-протеинкиназа 2 является фермент что у людей кодируется РИПК2 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует член семейства сериновых / треониновых протеинкиназ из семейства рецептор-взаимодействующих белков (RIP). Кодируемый белок содержит С-конец домен найма caspase (CARD) и является компонентом сигнальных комплексов как врожденного, так и адаптивного иммунных путей. Это мощный активатор NF-κB и индуктор апоптоза в ответ на различные раздражители.^[7]

Взаимодействия

RIPK2 был показан взаимодействовать с BIRC2.^[6][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000104312 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041135 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Инохара Н., Дель Песо Л., Косеки Т., Чен С., Нуньес Г. (июнь 1998 г.). «RICK, новая протеинкиназа, содержащая домен рекрутирования каспазы, взаимодействует с CLARP и регулирует CD95-опосредованный апоптоз». J Biol Chem. 273 (20): 12296–300. Дои:10.1074 / jbc.273.20.12296. PMID  9575181.
6. Том М., Хофманн К., Бернс К., Мартинон Ф., Бодмер Дж. Л., Маттманн С., Чопп Дж. (Ноябрь 1998 г.). «Идентификация CARDIAK, RIP-подобной киназы, которая связывается с каспазой-1». Curr Biol. 8 (15): 885–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (07) 00352-1. PMID  9705938. S2CID  1235278.
7. «Ген Entrez: серин-треонинкиназа 2, взаимодействующая с рецептором RIPK2».
8. Маккарти, Дж. В .; Ni J; Dixit V M (июль 1998 г.). «RIP2 представляет собой новую киназу, активирующую NF-kappaB и вызывающую гибель клеток». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 273 (27): 16968–75. Дои:10.1074 / jbc.273.27.16968. ISSN  0021-9258. PMID  9642260.

дальнейшее чтение

• Меджитов Р., Джейнвей С. (2000). «Врожденное иммунное распознавание: механизмы и пути». Иммунол. Rev. 173: 89–97. Дои:10.1034 / j.1600-065X.2000.917309.x. PMID  10719670. S2CID  20844121.
• Дюфнер А., Мак Т.В. (2006). «Уловки CARD: контроль взаимодействия CARD6 с RICK и микротрубочками». Клеточный цикл. 5 (8): 797–800. Дои:10.4161 / cc.5.8.2635. PMID  16582588.
• Маккарти Дж. В., Ни Дж., Диксит В. М. (1998). «RIP2 представляет собой новую киназу, активирующую NF-kappaB и вызывающую гибель клеток». J. Biol. Chem. 273 (27): 16968–75. Дои:10.1074 / jbc.273.27.16968. PMID  9642260.
• Бертин Дж., Нир В.Дж., Фишер С.М. и др. (1999). «Человеческий белок CARD4 представляет собой новый член семейства клеточной смерти CED-4 / Apaf-1, который активирует NF-kappaB». J. Biol. Chem. 274 (19): 12955–8. Дои:10.1074 / jbc.274.19.12955. PMID  10224040.
• Инохара Н., Косеки Т., дель Песо Л. и др. (1999). «Nod1, Apaf-1-подобный активатор каспазы-9 и ядерного фактора-kappaB». J. Biol. Chem. 274 (21): 14560–7. Дои:10.1074 / jbc.274.21.14560. PMID  10329646.
• Навас Т.А., Болдуин Д.Т., Стюарт Т.А. (1999). «RIP2 представляет собой Raf1-активируемую митоген-активированную протеинкиназу киназу». J. Biol. Chem. 274 (47): 33684–90. Дои:10.1074 / jbc.274.47.33684. PMID  10559258.
• Инохара Н., Косеки Т., Лин Дж. И др. (2000). «Модель индуцированной близости для активации NF-каппа B в путях передачи сигналов Nod1 / RICK и RIP». J. Biol. Chem. 275 (36): 27823–31. Дои:10.1074 / jbc.M003415200. PMID  10880512.
• Огура Ю., Инохара Н., Бенито А. и др. (2001). «Nod2, член семейства Nod1 / Apaf-1, который ограничен моноцитами и активирует NF-kappaB». J. Biol. Chem. 276 (7): 4812–8. Дои:10.1074 / jbc.M008072200. PMID  11087742.
• Ли SH, Stehlik C, Reed JC (2001). «Cop, белок, содержащий домен рекрутирования каспазы, и ингибитор процессинга активации каспазы-1». J. Biol. Chem. 276 (37): 34495–500. Дои:10.1074 / jbc.M101415200. PMID  11432859.
• Хурсигара Дж., Бертин Дж., Яно Х. и др. (2001). «Функция выживания для домена смерти рецептора p75, опосредованная через белок 2, взаимодействующий с рецептором домена рекрутирования каспазы». J. Neurosci. 21 (16): 5854–63. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.21-16-05854.2001. ЧВК  6763175. PMID  11487608.
• Андерссон Л., Шарин Тан М. (2015). «Rip2 изменяет VEGF-индуцированную передачу сигналов и сосудистую проницаемость при ишемии миокарда». Кардиоваск. Res. 107 (4): 478–86. Дои:10.1093 / cvr / cvv186. PMID  26130752.
• Друилхе А., Сринивасула С.М., Размара М. и др. (2001). «Регулирование генерации IL-1beta с помощью Pseudo-ICE и ICEBERG, двух доминантных белков домена рекрутирования отрицательных каспаз». Разница в гибели клеток. 8 (6): 649–57. Дои:10.1038 / sj.cdd.4400881. PMID  11536016.
• Чин А.И., Демпси П.В., Брюн К. и др. (2002). «Участие взаимодействующего с рецептором белка 2 в врожденных и адаптивных иммунных ответах». Природа. 416 (6877): 190–4. Bibcode:2002Натура 416..190C. Дои:10.1038 / 416190a. PMID  11894097. S2CID  4405035.
• Кобаяши К., Инохара Н., Эрнандес Л.Д. и др. (2002). «RICK / Rip2 / CARDIAK опосредует передачу сигналов для рецепторов врожденной и адаптивной иммунной систем» (PDF). Природа. 416 (6877): 194–9. Bibcode:2002Натура.416..194K. Дои:10.1038 / 416194a. HDL:2027.42/62842. PMID  11894098. S2CID  4363636.
• Munz B, Hildt E, Springer ML, Blau HM (2002). «RIP2, контрольный пункт в миогенной дифференцировке». Мол. Клетка. Биол. 22 (16): 5879–86. Дои:10.1128 / MCB.22.16.5879-5886.2002. ЧВК  133983. PMID  12138198.
• Ю Нью-Джерси, Пак В.С., Ким С.И. и др. (2003). «Nod1, белок CARD, усиливает процессинг про-интерлейкина-1бета за счет взаимодействия с прокаспазой-1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 299 (4): 652–8. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02714-6. PMID  12459189.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чен Ю. Р., Кларк А. С. (2003). «Равновесие и кинетическая укладка альфа-спирального греческого ключевого белкового домена: домен рекрутирования каспазы (CARD) RICK». Биохимия. 42 (20): 6310–20. Дои:10.1021 / bi0340752. PMID  12755636.