RBM17 - RBM17

RBM17
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2PE8, 2PEH
Идентификаторы
Псевдонимы	RBM17, SPF45, РНК-связывающий белок 17
Внешние идентификаторы	OMIM: 606935 MGI: 1924188 ГомолоГен: 13162 Генные карты: RBM17
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10п15.1 Начинать 6,089,034 бп[1] Конец 6,117,457 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 A1 Начинать 11,585,437 бп[2] Конец 11,604,153 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание нуклеиновой кислоты Сотовый компонент • сплайсосомальный комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • обработка мРНК • альтернативный сплайсинг мРНК через сплайсосомы • Сплайсинг РНК • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • Ремонт ДНК • регуляция сплайсинга РНК • регуляция альтернативного сплайсинга мРНК через сплайсосомы Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	84991	76938
Ансамбль	ENSG00000134453	ENSMUSG00000037197
UniProt	Q96I25	Q8JZX4
RefSeq (мРНК)	NM_032905 NM_001145547	NM_152824
RefSeq (белок)	NP_001139019 NP_116294	NP_690037
Расположение (UCSC)	Chr 10: 6.09 - 6.12 Мб	Chr 2: 11.59 - 11.6 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор сварки 45 это белок что у людей кодируется RBM17 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000134453 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037197 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нойбауэр Г., Кинг А., Раппсилбер Дж., Кальвио С., Уотсон М., Аджу П., Слиман Дж., Ламонд А., Манн М. (октябрь 1998 г.). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Нат Жене. 20 (1): 46–50. Дои:10.1038/1700. PMID  9731529. S2CID  585778.
6. «Ген Entrez: белок 17 РНК-связывающего мотива RBM17».

дальнейшее чтение

• Грейвли BR (2002). «Секс, ловкость и регулирование альтернативного сращивания». Клетка. 109 (4): 409–12. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00750-X. PMID  12086596. S2CID  15031931.
• Лаллена М.Дж., Чалмерс К.Дж., Лламазарес С. и др. (2002). «Регуляция сплайсинга на втором каталитическом этапе с помощью Sex-lethal включает распознавание 3'-сайта сплайсинга с помощью SPF45». Клетка. 109 (3): 285–96. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00730-4. PMID  12015979. S2CID  15734142.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Сампатх Дж., Лонг П.Р., Шепард Р.Л. и др. (2003). «Человеческий SPF45, фактор сплайсинга, имеет ограниченную экспрессию в нормальных тканях, сверхэкспрессируется во многих опухолях и может придавать клеткам фенотип множественной лекарственной устойчивости». Являюсь. Дж. Патол. 163 (5): 1781–90. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63538-9. ЧВК  1892446. PMID  14578179.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Перри В.Л., Шепард Р.Л., Сампат Дж. И др. (2005). «Человеческий фактор сплайсинга SPF45 (RBM17) при сверхэкспрессии придает широкую множественную лекарственную устойчивость к противоопухолевым препаратам - фенотип, частично обращенный селективными модуляторами рецепторов эстрогена». Рак Res. 65 (15): 6593–600. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-03-3675. PMID  16061639.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Chaouki AS, Salz HK (2007). «Drosophila SPF45: бифункциональный белок, играющий роль как в сплайсинге, так и в репарации ДНК». PLOS Genet. 2 (12): e178. Дои:10.1371 / journal.pgen.0020178. ЧВК  1687153. PMID  17154718.
• Корсини Л., Боннал С., Бонна С. и др. (2007). «Взаимодействия мотивов гомологии U2AF необходимы для альтернативной регуляции сплайсинга с помощью SPF45». Nat. Struct. Мол. Биол. 14 (7): 620–9. Дои:10.1038 / nsmb1260. PMID  17589525. S2CID  22784521.