RARS (ген) - RARS (gene)

RARS1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4 квартал 2 года, 4Q2X, 4 квартал 2 года, 4R3Z, 4ZAJ
Идентификаторы
Псевдонимы	RARS1, ArgRS, DALRD1, HLD9, аргинил-тРНК синтетаза, аргинил-тРНК синтетаза 1, RARS
Внешние идентификаторы	OMIM: 107820 MGI: 1914297 ГомолоГен: 68281 Генные карты: RARS1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q34 Начните 168,486,451 бп[1] Конец 168,519,301 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 A4 Начните 35,808,381 бп[2] Конец 35,834,506 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • аминоацил-тРНК лигазная активность • связывание нуклеотидов • связывание тРНК • связывание аргинина • активность лигазы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • связывание кадгерина • активность аргинин-тРНК лигазы Сотовый компонент • мембрана • нуклеоплазма • митохондрия • внеклеточная экзосома • ядро клетки • цитоплазма • мультиферментный комплекс аминоацил-тРНК синтетазы • цитозоль Биологический процесс • биосинтез белка • аминоацилирование тРНК для трансляции белков • аминоацилирование аргинил-тРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5917	104458
Ансамбль	ENSG00000113643	ENSMUSG00000018848
UniProt	P54136	Q9D0I9
RefSeq (мРНК)	NM_002887	NM_025936
RefSeq (белок)	NP_002878	NP_080212
Расположение (UCSC)	Chr 5: 168,49 - 168,52 Мб	Chr 11: 35,81 - 35,83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Аргинил-тРНК синтетаза, цитоплазматическая является фермент что у людей кодируется РАРС ген.^[5][6]

Аминоацил-тРНК-синтетазы катализируют аминоацилирование тРНК своей родственной аминокислотой. Из-за своей центральной роли в связывании аминокислот с триплетами нуклеотидов, содержащихся в тРНК, аминоацил-тРНК синтетазы считаются одними из первых белков, появившихся в процессе эволюции. Аргинил-тРНК-синтетаза принадлежит к семейству аминоацил-тРНК-синтетаз класса I.^[6]

Генетика

Мутации в RARS вызывают гипомиелинизация.^[7]

Взаимодействия

RARS (ген) показал взаимодействовать с участием QARS.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113643 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018848 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Гирджес А.А., Хобсон К., Чен П., Лавин М.Ф. (октябрь 1995 г.). «Клонирование и характеристика кДНК, кодирующей аргинил-тРНК синтетазу человека». Ген. 164 (2): 347–50. Дои:10.1016 / 0378-1119 (95) 00502-В. PMID  7590355.
6. «Энтрез Ген: аргинил-тРНК синтетаза RARS».
7. Вольф Н.И., Саломонс Г.С., Роденбург Р.Дж., Поуэлс П.Дж., Шивинг Дж.Х., Деркс Т.Г., Фок Дж.М., Рамп П., ван Бик Д.М., ван дер Кнаап М.С., Вайсфис К. (июль 2014 г.). «Мутации в RARS вызывают гипомиелинизацию». Анналы неврологии. 76 (1): 134–9. Дои:10.1002 / ana.24167. PMID  24777941. S2CID  27717491.
8. Ким Т., Пак С.Г., Ким Дж. Э., Соль В., Ко Ю. Г., Ким С. (июль 2000 г.). «Каталитический пептид человеческой глутамил-тРНК-синтетазы необходим для его сборки в комплекс аминоацил-тРНК-синтетазы». Журнал биологической химии. 275 (28): 21768–72. Дои:10.1074 / jbc.M002404200. PMID  10801842.

дальнейшее чтение

• МакКьюн С.А., Ю. П.Л., Нэнси В.Е. (1977). «Генетическое исследование активности аргинин-тРНК синтетазы эритроцитов у человека». Acta Geneticae Medicae et Gemellologiae. 26 (1): 21–7. Дои:10.1017 / S0001566000010151. PMID  562050.
• Norcum MT (август 1991 г.). «Структурный анализ высокомолекулярного комплекса аминоацил-тРНК синтетазы. Действие нейтральных солей и детергентов». Журнал биологической химии. 266 (23): 15398–405. PMID  1651330.
• Ван Х.Й., Пан Ф. (1985). «Кинетический механизм аргинил-тРНК синтетазы из плаценты человека». Международный журнал биохимии. 16 (12): 1379–85. Дои:10.1016 / 0020-711X (84) 90244-1. PMID  6530022.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ро С.Б., Ли Дж.С., Чон Э.Дж., Ким К.С., Ким Ю.Г., Ким С. (май 1998 г.). «Многофункциональный повторяющийся мотив присутствует в бифункциональной тРНК синтетазе человека». Журнал биологической химии. 273 (18): 11267–73. Дои:10.1074 / jbc.273.18.11267. PMID  9556618.
• Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E, Siatecka M, Mirande M (январь 1999 г.). «Сборка макромолекул аминоацил-тРНК синтетаз: идентификация белок-белковых взаимодействий и характеристика основного белка». Журнал молекулярной биологии. 285 (1): 183–95. Дои:10.1006 / jmbi.1998.2316. PMID  9878398.
• Пак С.Г., Юнг К.Х., Ли Дж.С., Чо Й.Дж., Мотеги Х., Ким С., Шиба К. (июнь 1999 г.). «Предшественник проапоптотического цитокина модулирует активность аминоацилирования тРНК синтетазы». Журнал биологической химии. 274 (24): 16673–6. Дои:10.1074 / jbc.274.24.16673. PMID  10358004.
• Ким Т., Пак С.Г., Ким Дж. Э., Соль В., Ко Ю. Г., Ким С. (июль 2000 г.). «Каталитический пептид человеческой глутамил-тРНК-синтетазы необходим для его сборки в комплекс аминоацил-тРНК-синтетазы». Журнал биологической химии. 275 (28): 21768–72. Дои:10.1074 / jbc.M002404200. PMID  10801842.
• Кан Дж., Ким Т., Ко Ю.Г., Ро С.Б., Пак С.Г., Ким М.Дж., Квон Х.Д., Ким С. (октябрь 2000 г.). «Белок теплового шока 90 опосредует белок-белковые взаимодействия между аминоацил-тРНК синтетазами человека». Журнал биологической химии. 275 (41): 31682–8. Дои:10.1074 / jbc.M909965199. PMID  10913161.
• Геваерт К., Гётальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (Май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природа Биотехнологии. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Лин Ц, Яо Ю., Чжэн Ю. Г., Вэй Х, Ван Л., Ву ХФ, Ван Э. Д. (октябрь 2005 г.). «С-концевой присоединенный домен цитозольной лейцил-тРНК-синтетазы человека незаменим во взаимодействии с аргинил-тРНК-синтетазой в комплексе мульти-тРНК-синтетазы». Журнал биологической химии. 280 (41): 34755–63. Дои:10.1074 / jbc.M413511200. PMID  16055448.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки И., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кусида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Боттони А., Виньяли С., Пиччин Д., Тальати Ф., Лучин А., Зателли М.С., Uberti EC (август 2007 г.). «Протеасомы и RARS модулируют секрецию AIMP1 / EMAP II в линиях раковых клеток человека». Журнал клеточной физиологии. 212 (2): 293–7. Дои:10.1002 / jcp.21083. PMID  17443684. S2CID  27371659.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P54136 (Аргинин человека - тРНК-лигаза, цитоплазматическая) на PDBe-KB.