RAP1B - RAP1B

RAP1B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3BRW, 3CF6, 4DXA, 4HDO, 4HDQ, 4М8Н, 4MGI, 4МГК, 4МГГ, 4МГЗ, 4MH0
Идентификаторы
Псевдонимы	RAP1B, K-REV, RAL1B, член семейства онкогенов RAS
Внешние идентификаторы	OMIM: 179530 MGI: 894315 ГомолоГен: 68719 Генные карты: RAP1B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q15 Начинать 68,610,855 бп[1] Конец 68,671,901 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 D2 Начинать 117,813,871 бп[2] Конец 117,846,035 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Привязка к ВВП • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса • Связывание GTP • GO: 0001948 связывание с белками • ГТФазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • межклеточное соединение • клеточная мембрана • липидная капля • внутриклеточный • соединение клеток • мембранный плот • внеклеточная экзосома • мембрана азурофильных гранул Биологический процесс • установление эндотелиального барьера • сборка микроворсинок • регулировка сборки узловых соединений • Передача сигнала Rap-белка • регулирование установления полярности клеток • клеточный ответ на цАМФ • преобразование сигнала • дегрануляция нейтрофилов • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-12 • передача сигнала, опосредованная малой GTPase • клеточная пролиферация • ответ на углевод • клеточный ответ на лекарство • отрицательная регуляция кальций-зависимого экзоцитоза • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • клеточный ответ на гонадотропин-рилизинг гормон • отрицательная регуляция экзоцитоза синаптических везикул Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5908	215449
Ансамбль	ENSG00000127314	ENSMUSG00000052681
UniProt	P61224	Q99JI6
RefSeq (мРНК)	NM_015646 NM_001010942 NM_001251917 NM_001251918 NM_001251921 NM_001251922	NM_024457
RefSeq (белок)	NP_001010942 NP_001238846 NP_001238847 NP_001238850 NP_001238851 NP_056461 NP_001010942.1 NP_056461.1	NP_077777
Расположение (UCSC)	Chr 12: 68.61 - 68.67 Мб	Chr 10: 117,81 - 117,85 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Связанный с Ras белок Rap-1b, также известный как GTP-связывающий белок smg p21B, это белок что у людей кодируется RAP1B ген.^[5][6][7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000127314 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052681 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Джин: RAP1B».
6. Pizon V, Lerosey I, Chardin P, Tavitian A (август 1988 г.). «Нуклеотидная последовательность кДНК человека, кодирующая ras-родственный белок (rap1B)». Нуклеиновые кислоты Res. 16 (15): 7719. Дои:10.1093 / nar / 16.15.7719. ЧВК  338441. PMID  3137530.
7. Мацуи Ю., Кикучи А., Кавата М., Кондо Дж., Тераниши Ю., Такай Ю. (январь 1990 г.). «Молекулярное клонирование smg p21B и идентификация smg p21, очищенного из бычьего мозга и тромбоцитов человека, как smg p21B». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 166 (2): 1010–6. Дои:10.1016 / 0006-291X (90) 90911-6. PMID  2105724.
8. Руссо-Мерк М.Ф., Пизон В., Тавитиан А., Бергер Р. (1990). «Хромосомное картирование человеческих генов RAP1A, RAP1B и RAP2, связанных с RAS, в хромосомы 1p12 ---- p13, 12q14 и 13q34, соответственно». Cytogenet. Cell Genet. 53 (1): 2–4. Дои:10.1159/000132883. PMID  2108841.

дальнейшее чтение

• Реманн Х., Ариас-Паломо Э., Хаддерс М.А. и др. (2008). «Структура Epac2 в комплексе с циклическим аналогом AMP и RAP1B». Природа. 455 (7209): 124–7. Bibcode:2008Натура.455..124R. Дои:10.1038 / природа07187. PMID  18660803. S2CID  4393652.
• Гиан Э., Фрю М., Боуэн Д. и др. (2005). «Мутация в RAP1 - редкое явление при миелодиспластических синдромах». Лейкемия. 19 (9): 1678–80. Дои:10.1038 / sj.leu.2403882. PMID  16118622.
• Schwamborn JC, Müller M, Becker AH, Püschel AW (2007). «Убиквитинирование GTPase Rap1B убиквитинлигазой Smurf2 необходимо для установления нейрональной полярности». EMBO J. 26 (5): 1410–22. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601580. ЧВК  1817628. PMID  17318188.
• Кармона Г., Гёттиг С., Орланди А. и др. (2009). «Роль малой GTPase Rap1 в регуляции активности интегрина в эндотелиальных клетках и ангиогенезе». Кровь. 113 (2): 488–97. Дои:10.1182 / кровь-2008-02-138438. PMID  18805968.
• Шаттил SJ (2005). «Интегрины и Src: динамический дуэт сигнализации адгезии». Тенденции Cell Biol. 15 (8): 399–403. Дои:10.1016 / j.tcb.2005.06.005. PMID  16005629.
• Малчинхуу Э., Сато К., Маэхама Т. и др. (2009). «Роль Rap1B и опухолевого супрессора PTEN в негативной регуляции миграции изопротеренола, вызванной лизофосфатидной кислотой, в клетках глиомы». Мол. Биол. Клетка. 20 (24): 5156–65. Дои:10.1091 / mbc.E09-08-0692. ЧВК  2793292. PMID  19864456.
• Даумке О., Вейанд М., Чакрабарти П.П. и др. (2004). «Белок Rap1GAP, активирующий ГТФазу, использует каталитический аспарагин». Природа. 429 (6988): 197–201. Bibcode:2004Натура.429..197D. Дои:10.1038 / природа02505. PMID  15141215. S2CID  4426744.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Эдрейра М.М., Ли С., Хохбаум Д. и др. (2009). «Конформационные изменения, вызванные фосфорилированием в Rap1b: аллостерические эффекты на домены переключения и эффекторную петлю». J. Biol. Chem. 284 (40): 27480–6. Дои:10.1074 / jbc.M109.011312. ЧВК  2785677. PMID  19651783.
• Scrima A, Thomas C, Deaconescu D, Wittinghofer A (2008). «Комплекс Rap-RapGAP: гидролиз GTP без каталитических остатков глютамина и аргинина». EMBO J. 27 (7): 1145–53. Дои:10.1038 / emboj.2008.30. ЧВК  2265111. PMID  18309292.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Проблема с базой данных): D415-8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Canobbio I, Trionfini P, Guidetti GF и др. (2008). «Нацеливание малой GTPase Rap2b, но не Rap1b, на липидные рафты стимулируется пальмитоилированием по Cys176 и Cys177 и требуется для эффективной активации белка в тромбоцитах человека». Клетка. Сигнал. 20 (9): 1662–70. Дои:10.1016 / j.cellsig.2008.05.016. PMID  18582561.
• Бернарди Б., Гвидетти Г.Ф., кампус F и др. (2006). «Малая ГТФаза Rap1b регулирует перекрестный обмен между интегрином альфа2бета1 тромбоцитов и интегрином альфаIIbbeta3». Кровь. 107 (7): 2728–35. Дои:10.1182 / кровь-2005-07-3023. ЧВК  1895386. PMID  16357324.
• Мацусе М., Мицутаке Н., Рогонович Т. и др. (2009). «Мутационный анализ гена RAP1 при папиллярных карциномах щитовидной железы». Endocr. J. 56 (1): 161–4. Дои:10.1507 / endocrj.k08e-244. PMID  18948674.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Ли YH, Вернер H, Püschel AW (2008). «Rheb и mTOR регулируют полярность нейронов через Rap1B». J. Biol. Chem. 283 (48): 33784–92. Дои:10.1074 / jbc.M802431200. ЧВК  2662285. PMID  18842593.
• Лова П., Кампус F, Ломбарди Р. и др. (2004). «Вклад активированных протеазой рецепторов 1 и 4 и гликопротеина Ib-IX-V в G (i) -зависимую активацию тромбоцитов Rap1B тромбином». J. Biol. Chem. 279 (24): 25299–306. Дои:10.1074 / jbc.M313199200. PMID  15078882.
• Ян Дж, Ли Ф, Инграм Д.А., Куиллиам Л.А. (2008). «Rap1a является ключевым регулятором ангиогенеза, индуцированного фактором роста фибробластов 2, и вместе с Rap1b контролирует функции эндотелиальных клеток человека». Мол. Клетка. Биол. 28 (18): 5803–10. Дои:10.1128 / MCB.00393-08. ЧВК  2546931. PMID  18625726.
• Кампус F, Лова П., Бертони А. и др. (2005). «Тромбопоэтин дополняет G (i) - но не G (q) -зависимые пути активации интегрина {альфа} (IIb) {бета} (3) и агрегации тромбоцитов». J. Biol. Chem. 280 (26): 24386–95. Дои:10.1074 / jbc.M501174200. PMID  15863506.
• Дефилиппи П., Ди Стефано П., Кабоди С. (2006). «p130Cas: универсальная платформа в сетях сигнализации». Тенденции Cell Biol. 16 (5): 257–63. Дои:10.1016 / j.tcb.2006.03.003. PMID  16581250.