RACGAP1 - RACGAP1

RACGAP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2OVJ, 3W6R, 3WPQ, 3WPS, 4B6D, 5C2J, 5C2K
Идентификаторы
Псевдонимы	RACGAP1, CYK4, HsCYK-4, ID-GAP, MgcRacGAP, белок 1, активирующий ГТФазу Rac
Внешние идентификаторы	OMIM: 604980 MGI: 1349423 ГомолоГен: 8077 Генные карты: RACGAP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.12 Начинать 49,976,923 бп[1] Конец 50,033,136 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 F1 Начинать 99,620,496 бп[2] Конец 99,651,656 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание микротрубочек • связывание альфа-тубулина • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание бета-тубулина • связывание гамма-тубулина • связывание протеинкиназы • связывание фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфата • связывание липидов • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • центральношпиндлинный комплекс • мембрана • внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны • клеточная мембрана • шпиндель • нуклеоплазма • Акросома • средняя зона шпинделя • борозда декольте • митотическое веретено • микротрубочки • внеклеточная экзосома • цитоскелет • ядро клетки • цитоплазматический пузырек • середина тела • Тело Флемминга Биологический процесс • дифференциация клеток • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • сборка средней зоны митотического веретена • сульфатный транспорт • митотический цитокинез • ионный транспорт • деление клеток • положительная регуляция цитокинеза • развитие многоклеточного организма • движение на основе микротрубочек • актомиозиновое сократительное кольцо в сборе • сперматогенез • пролиферация нейробластов • клеточный цикл • регуляция прикрепления микротрубочек веретена к кинетохоре • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • преобразование сигнала • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • ретроградный везикулярный транспорт, Гольджи в ER • регуляция эмбрионального развития • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	29127	26934
Ансамбль	ENSG00000161800	ENSMUSG00000023015
UniProt	Q9H0H5	Q9WVM1
RefSeq (мРНК)	NM_001126103 NM_001126104 NM_013277 NM_001319999 NM_001320000 NM_001320001 NM_001320002 NM_001320003 NM_001320004 NM_001320005 NM_001320006 NM_001320007	NM_001253808 NM_001253809 NM_012025
RefSeq (белок)	NP_001119575 NP_001119576 NP_001306928 NP_001306929 NP_001306930 NP_001306931 NP_001306932 NP_001306933 NP_001306934 NP_001306935 NP_001306936 NP_037409	NP_001240737 NP_001240738 NP_036155
Расположение (UCSC)	Chr 12: 49.98 - 50.03 Мб	Chr 15: 99,62 - 99,65 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Rac GTPase-активирующий белок 1 является фермент что у людей кодируется RACGAP1 ген.^[5]

Функция

Rho GTPases контролируют множество клеточных процессов. В суперсемействе Ras малых G-белков есть 3 подтипа Rho GTPases: RHO (см. MIM 165370), RAC (см. RAC1; MIM 602048) и CDC42 (MIM 116952). Белки, активирующие GTPase (GAP), связывают активированные формы Rho GTPases и стимулируют гидролиз GTP. Благодаря этой каталитической функции Rho GAP отрицательно регулируют Rho-опосредованные сигналы. GAP также могут служить эффекторными молекулами и играть роль в передаче сигналов ниже Rho и других Ras-подобных GTPases. [Поставляется OMIM]^[6]

Взаимодействия

RACGAP1 был показан взаимодействовать с Rnd2^[7] и SLC26A8.^[8]

Было показано, что во время цитокинеза RACGAP1 взаимодействует с KIF23 сформировать центральный шпиндлин сложный.^[9] Этот комплекс необходим для формирования центрального веретена. RACGAP1 также взаимодействует с PRC1 для стабилизации и поддержания центрального веретена во время анафазы.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000161800 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023015 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Туре А., Дорсей О., Морин Л., Тиммонс П., Жегу Б., Рейбель Л., Гакон Дж. (Март 1998 г.). «MgcRacGAP, новый человеческий белок, активирующий ГТФазу для Rac и Cdc42, подобный продукту гена Drosophila rotundRacGAP, экспрессируется в мужских половых клетках». Журнал биологической химии. 273 (11): 6019–23. Дои:10.1074 / jbc.273.11.6019. PMID  9497316.
6. «Ген Entrez: белок 1, активирующий RACGAP1 Rac GTPase».
7. Naud N, Touré A, Liu J, Pineau C, Morin L, Dorseuil O, Escalier D, Chardin P, Gacon G (май 2003 г.). «ГТФаза Rnd2 семейства Rho взаимодействует и совместно локализуется с MgcRacGAP в мужских половых клетках». Биохимический журнал. 372 (Pt 1): 105–12. Дои:10.1042 / BJ20021652. ЧВК  1223378. PMID  12590651.
8. Туре А., Морин Л., Пино С., Бек Ф., Дорсей О., Гакон Дж. (Июнь 2001 г.). «Tat1, новый переносчик сульфатов, специфически экспрессируемый в мужских половых клетках человека и потенциально связанный с передачей сигналов rhogtpase». Журнал биологической химии. 276 (23): 20309–15. Дои:10.1074 / jbc.M011740200. PMID  11278976.
9. Glotzer M (февраль 2013 г.). «Цитокинез: центральный шпиндлин подрабатывает мембранным якорем». Текущая биология. 23 (4): R145–7. Дои:10.1016 / j.cub.2013.01.006. PMID  23428321.
10. Ли К.Ю., Эсмаили Б., Зилли Б., Мишима М. (2015). «Прямое взаимодействие между центральным шпинделем и PRC1 усиливает механическую устойчивость центрального шпинделя». Nature Communications. 6: 7290. Дои:10.1038 / ncomms8290. ЧВК  4557309. PMID  26088160.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Гервинс П., Бланк Дж. Л., Джонсон Г. Л. (март 1997 г.). «Клонирование новой митоген-активируемой киназы киназы протеинкиназы, MEKK4, которая избирательно регулирует путь аминоконцевой киназы c-Jun». Журнал биологической химии. 272 (13): 8288–95. Дои:10.1074 / jbc.272.13.8288. PMID  9079650.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Нагата Ки, Пульс А., Футтер С., Аспенстром П., Шефер Э., Наката Т., Хирокава Н., зал A (январь 1998 г.). «MAP-киназа-киназа-киназа MLK2 совместно локализуется с активированным JNK вдоль микротрубочек и ассоциируется с моторным KIF3 суперсемейства кинезинов». Журнал EMBO. 17 (1): 149–58. Дои:10.1093 / emboj / 17.1.149. ЧВК  1170366. PMID  9427749.
• Tapon N, Nagata K, Lamarche N, Hall A (март 1998 г.). «Новый rac-мишень POSH представляет собой SH3-содержащий каркасный белок, участвующий в сигнальных путях JNK и NF-kappaB». Журнал EMBO. 17 (5): 1395–404. Дои:10.1093 / emboj / 17.5.1395. ЧВК  1170487. PMID  9482736.
• Abo A, Qu J, Cammarano MS, Dan C, Fritsch A, Baud V, Belisle B, Minden A (ноябрь 1998 г.). «PAK4, новый эффектор для Cdc42Hs, участвует в реорганизации актинового цитоскелета и в образовании филоподий». Журнал EMBO. 17 (22): 6527–40. Дои:10.1093 / emboj / 17.22.6527. ЧВК  1171000. PMID  9822598.
• Зубер Дж., Черница О.И., Хинцманн Б., Шмитц А.С., Грипс М., Хеллригель М., Серс С., Розенталь А., Шефер Р. (февраль 2000 г.). «Полногеномный обзор мишеней трансформации RAS». Природа Генетика. 24 (2): 144–52. Дои:10.1038/72799. PMID  10655059. S2CID  21887748.
• Дас Б., Шу X, Дэй Г.Дж., Хан Дж., Кришна У.М., Фальк-младший, Брок Д. (май 2000 г.). «Контроль внутримолекулярных взаимодействий между доменами гомологии плекстрина и Dbl Vav и Sos1 регулирует связывание Rac». Журнал биологической химии. 275 (20): 15074–81. Дои:10.1074 / jbc.M907269199. PMID  10748082.
• Нагасе Т., Кикуно Р., Исикава К., Хиросава М., Охара О. (апрель 2000 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК исследования. 7 (2): 143–50. Дои:10.1093 / dnares / 7.2.143. PMID  10819331.
• Кавасима Т., Хиросе К., Сато Т., Канеко А., Икеда Ю., Казиро Ю., Носака Т., Китамура Т. (сентябрь 2000 г.). «MgcRacGAP участвует в контроле роста и дифференцировки гемопоэтических клеток». Кровь. 96 (6): 2116–24. Дои:10.1182 / blood.V96.6.2116. PMID  10979956.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Хиросе К., Кавасима Т., Ивамото И., Носака Т., Китамура Т. (февраль 2001 г.). «MgcRacGAP участвует в цитокинезе, связываясь с митотическим веретеном и средним телом». Журнал биологической химии. 276 (8): 5821–8. Дои:10.1074 / jbc.M007252200. PMID  11085985.
• Caloca MJ, Wang H, Delemos A, Wang S, Kazanietz MG (май 2001 г.). «Сложные эфиры форбола и родственные аналоги регулируют субклеточную локализацию бета 2-химерина, рецептора сложного эфира форбола, не являющегося протеинкиназой C». Журнал биологической химии. 276 (21): 18303–12. Дои:10.1074 / jbc.M011368200. PMID  11278894.
• Туре А., Морин Л., Пино С., Бек Ф., Дорсей О, Гакон Дж. (Июнь 2001 г.). «Tat1, новый переносчик сульфатов, специфически экспрессируемый в мужских половых клетках человека и потенциально связанный с передачей сигналов rhogtpase». Журнал биологической химии. 276 (23): 20309–15. Дои:10.1074 / jbc.M011740200. PMID  11278976.
• Mishima M, Kaitna S, Glotzer M (январь 2002 г.). «Сборка центрального веретена и цитокинез требуют комплекса кинезин-подобный белок / RhoGAP с активностью связывания микротрубочек». Клетка развития. 2 (1): 41–54. Дои:10.1016 / S1534-5807 (01) 00110-1. PMID  11782313.
• Викис Х.Г., Ли В., Гуань К.Л. (апрель 2002 г.). «Взаимодействие плексин-B1 / Rac ингибирует активацию PAK и усиливает связывание лиганда Sema4D». Гены и развитие. 16 (7): 836–45. Дои:10.1101 / gad.966402. ЧВК  186329. PMID  11937491.
• Китамура Т., Кавасима Т., Миносима Ю., Тонозука Ю., Хиросе К., Носака Т. (декабрь 2001 г.). «Роль MgcRacGAP / Cyk4 как регулятора малого семейства GTPase Rho в цитокинезе и дифференцировке клеток». Структура и функции клеток. 26 (6): 645–51. Дои:10.1247 / csf.26.645. PMID  11942621.
• Côté JF, Vuori K (декабрь 2002 г.). «Идентификация эволюционно консервативного суперсемейства белков, родственных DOCK180, с активностью обмена гуаниновых нуклеотидов». Журнал клеточной науки. 115 (Пт 24): 4901–13. Дои:10.1242 / jcs.00219. PMID  12432077.
• Янч-Плунгер В., Генци П., Романо А., Шнабель Х., Хэмилл Д., Шнабель Р., Хайман А.А., Глотцер М. (июнь 2000 г.). «CYK-4: белок, активирующий gtpase семейства Rho (GAP), необходимый для формирования центрального веретена и цитокинеза». Журнал клеточной биологии. 149 (7): 1391–404. Дои:10.1083 / jcb.149.7.1391. ЧВК  2175131. PMID  10871280.