RAB5C - RAB5C

RAB5C
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4KYI
Идентификаторы
Псевдонимы	RAB5C, L1880, RAB5CL, RAB5L, RABL, член семейства онкогенов RAS
Внешние идентификаторы	OMIM: 604037 MGI: 105306 ГомолоГен: 55533 Генные карты: RAB5C
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.2 Начинать 42,124,976 бп[1] Конец 42,155,044 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 D | 11 63,54 см Начинать 100,715,009 бп[2] Конец 100,738,215 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • Связывание GTP • GO: 0001948 связывание с белками • Привязка к ВВП • ГТФазная активность Сотовый компонент • меланосома • лизосомальная мембрана • эндосома • липидная капля • эндоцитарный пузырек • ранняя эндосома • внеклеточная экзосома • мембрана • клеточная мембрана • мембрана ранней эндосомы • мембрана азурофильных гранул • цитоплазматический пузырек • закрепленный компонент мембраны синаптического пузырька • внутриклеточный Биологический процесс • транспорт белка • регуляция эндоцитоза • плазматическая мембрана к транспорту эндосом • дегрануляция нейтрофилов • транспорт • внутриклеточный транспорт белка • Передача сигнала белка Rab • передача сигнала, опосредованная малой GTPase Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5878	19345
Ансамбль	ENSG00000108774	ENSMUSG00000019173
UniProt	P51148	P35278
RefSeq (мРНК)	NM_001252039 NM_004583 NM_201434	NM_024456 NM_001305003
RefSeq (белок)	NP_001238968 NP_004574 NP_958842	NP_001291932 NP_077776
Расположение (UCSC)	Chr 17: 42.12 - 42.16 Мб	Chr 11: 100,72 - 100,74 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Связанный с Ras белок Rab-5C это белок что у людей кодируется RAB5C ген.^[5][6] RAB5C принадлежит Ras-родственный белок семья.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108774 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019173 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хан Х.Дж., Судо К., Инадзава Дж., Накамура Й. (июль 1996 г.). «Выделение и картирование гена человека (RABL), кодирующего небольшой GTP-связывающий белок, гомологичный Ras-связанному гену RAB». Cytogenet Cell Genet. 73 (1–2): 137–9. Дои:10.1159/000134325. PMID  8646882.
6. «Ген Entrez: RAB5C RAB5C, член семейства онкогенов RAS».

дальнейшее чтение

• Альбертсен Х.М., Смит С.А., Мазойер С. и др. (1994). «Физическая карта и гены-кандидаты в области BRCA1 на хромосоме 17q12-21». Nat. Genet. 7 (4): 472–9. Дои:10.1038 / ng0894-472. PMID  7951316. S2CID  11075629.
• Альварес-Домингес C, Шталь PD (1999). «Интерферон-гамма избирательно индуцирует синтез и процессинг Rab5a в мононуклеарных клетках». J. Biol. Chem. 273 (51): 33901–4. Дои:10.1074 / jbc.273.51.33901. PMID  9852039.
• Буччи С., Кьяриелло М., Латтеро Д. и др. (1999). «Клонирование взаимодействия и характеристика кДНК, кодирующей пренилированный человеческий акцептор Rab (PRA1)». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 258 (3): 657–62. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0651. PMID  10329441.
• Клеменс Д.Л., Ли Б.А., Хорвиц М.А. (2000). «Девиантная экспрессия Rab5 на фагосомах, содержащих внутриклеточные патогены Mycobacterium tuberculosis и Legionella pneumophila, связана с измененной судьбой фагосом». Заразить. Иммунная. 68 (5): 2671–84. Дои:10.1128 / IAI.68.5.2671-2684.2000. ЧВК  97474. PMID  10768959.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Меритью Э., Стоун С., Итирадж С., Ламбрайт Д.Г. (2003). «Детерминанты взаимодействия Rab5 с N-концом раннего эндосомного антигена 1». J. Biol. Chem. 278 (10): 8494–500. Дои:10.1074 / jbc.M211514200. PMID  12493736.
• Каджихо Х., Сайто К., Цудзита К. и др. (2004). «RIN3: новый Rab5 GEF, взаимодействующий с амфифизином II, участвующим в раннем пути эндоцитоза». J. Cell Sci. 116 (Pt 20): 4159–68. Дои:10.1242 / jcs.00718. PMID  12972505.
• Chi A, Valencia JC, Hu ZZ и др. (2007). «Протеомная и биоинформатическая характеристика биогенеза и функции меланосом». J. Proteome Res. 5 (11): 3135–44. Дои:10.1021 / pr060363j. PMID  17081065.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.