МРНК псевдомонады - Pseudomonas sRNA

Псевдомонады мРНК находятся некодирующие РНК (нкРНК), которые были предсказаны биоинформатический программа SRNApredict2. Эта программа определяет предполагаемые мРНК путем поиска совместной локализации генетических особенностей, обычно связанных с генами, кодирующими мРНК, и выражение предсказанных мРНК впоследствии было подтверждено Нозерн-блот анализ. Было показано, что эти мРНК являются консервированный через несколько псевдомонады видов, но их функции еще предстоит определить.^[1] Использование генетического подхода Tet-Trap РНАТ были идентифицированы гены, посттранскрипционно регулируемые при повышении температуры: ptxS (участвует в вирулентности) и PA5194.^[2]

Смотрите также

Рекомендации

^ Livny, J .; Brencic, A .; Lory, S .; Уолдор, К. (2006). «Идентификация 17 мРНК Pseudomonas aeruginosa и прогнозирование генов, кодирующих мРНК у 10 различных патогенов, с использованием биоинформатического инструмента sRNAPredict2» (Бесплатный полный текст). Исследования нуклеиновых кислот. 34 (12): 3484–3493. Дои:10.1093 / нар / gkl453. ISSN 0305-1048. ЧВК 1524904. PMID 16870723.^{[постоянная мертвая ссылка ]}
^ Дельвиллани, Франческо; Sciandrone, Барбара; Пеано, Клелия; Петити, Лука; Беренс, Кристиан; Георгий, Кристиана; Феррара, Сильвия; Бертони, Джованни; Пазини, Мария Энрика (декабрь 2014 г.). «Tet-Trap, генетический подход к идентификации бактериальных РНК-термометров: приложение к Pseudomonas aeruginosa». РНК. 20 (12): 1963–1976. Дои:10.1261 / rna.044354.114. ISSN 1469-9001. ЧВК 4238360. PMID 25336583.

[pmid16870723-1] Livny, J .; Brencic, A .; Lory, S .; Уолдор, К. (2006). «Идентификация 17 мРНК Pseudomonas aeruginosa и прогнозирование генов, кодирующих мРНК у 10 различных патогенов, с использованием биоинформатического инструмента sRNAPredict2» (Бесплатный полный текст). Исследования нуклеиновых кислот. 34 (12): 3484–3493. Дои:10.1093 / нар / gkl453. ISSN 0305-1048. ЧВК 1524904. PMID 16870723.^{[постоянная мертвая ссылка ]}

[2] Дельвиллани, Франческо; Sciandrone, Барбара; Пеано, Клелия; Петити, Лука; Беренс, Кристиан; Георгий, Кристиана; Феррара, Сильвия; Бертони, Джованни; Пазини, Мария Энрика (декабрь 2014 г.). «Tet-Trap, генетический подход к идентификации бактериальных РНК-термометров: приложение к Pseudomonas aeruginosa». РНК. 20 (12): 1963–1976. Дои:10.1261 / rna.044354.114. ISSN 1469-9001. ЧВК 4238360. PMID 25336583.

[1]

[2]