Белок G - Protein G

Не путать с G протеин.

Белок G является иммуноглобулин переплет белок выражены в группах C и G Стрептококковый бактерии очень похожи на Белок А но с различной специфичностью связывания. Это 65 кДа (белок G G148) и 58 кДа (белок G C40).[1] белок клеточной поверхности, который нашел применение в очистке антител за счет его связывания с Fab и Fc область, край. Нативная молекула также связывает альбумин, но поскольку сывороточный альбумин является основным загрязнителем источников антител, сайт связывания альбумина был удален из рекомбинантный формы белка G. Этот рекомбинантный белок G, меченный флуорофором или одноцепочечной цепью ДНК, использовали в качестве замены вторичных антител при иммунофлуоресценции и визуализации сверхвысокого разрешения.[2].

Другие связывающие антитела белки

В дополнение к белку G, другие иммуноглобулин-связывающие бактериальные белки, такие как Белок А, Белок A / G и Белок L все они обычно используются для очистки, иммобилизации или обнаружения иммуноглобулинов. Каждый из этих связывающих иммуноглобулин белков имеет различный профиль связывания антитела с точки зрения распознаваемой части антитела, а также вида и типа антител, которые он будет связывать.

Сворачивание белка G, домена B1

An ab initio симуляция домена белка G B1 демонстрирует, что, как предполагали более ранние результаты, этот белок инициирует сворачивание через зарождение событие в гидрофобный ядро остатки с последующими небольшими корректировками.[3] События сворачивания следующие:

  1. а β-шпилька образуется, стабилизируется остатками W43, Y45 и F52.
  2. Остаточные контакты между остатком F30 в α-спираль, а β-шпилька укрепляется.
  3. Зарождение β-лист начинается с остатков L5 и F52.
  4. Последний остаток нуклеации, Y3, помогает формировать центральную часть β-слоя, что приводит к образованию глобулярный белок.

Домен белка G B1 (он же GB1) часто используется как часть гибридный белок чтобы другие области оставались в растворе во время экспериментов в растворе (например, ЯМР ). Многие ранее нерастворимые домены стали растворимыми в результате слияния домена GB1.[4] Домен имеет длину 56 остатков (примерно 8 кДа). На SDS-СТРАНИЦА gels домен GB1 работает примерно с 13,5 кДа, несмотря на то, что он составляет всего 8 кДа.[5]

использованная литература

  1. ^ Шджобринг У., Бьорк Л., Кастерн В. и др. (1991). «Стрептококковый белок G. Структура гена и свойства связывания с белками». J Biol Chem. 266 (1): 399–405. PMID  1985908.
  2. ^ Schlichthaerle, Thomas; Ганджи, Махипал; Ауэр, Александр; Уэйд, Орсоля Кимбу; Юнгманн, Ральф (2018). «Связующие антитела бактериального происхождения как небольшие адаптеры для микроскопии DNA-PAINT». ChemBioChem. 0 (ja): 1032–1038. Дои:10.1002 / cbic.201800743. ISSN  1439-7633. PMID  30589198.
  3. ^ Kmiecik S, Kolinski A (февраль 2008 г.). «Путь сворачивания домена b1 белка G исследован с помощью многомасштабного моделирования». Biophys J. 94 (3): 726–36. Bibcode:2008BpJ .... 94..726K. Дои:10.1529 / biophysj.107.116095. ЧВК  2186257. PMID  17890394.
  4. ^ Юань Ченг, Диншоу Дж. Патель, Эффективная система для экспрессии и рефолдинга малых белков, Сообщения биохимических и биофизических исследований, том 317, выпуск 2, 30 апреля 2004 г., страницы 401-405
  5. ^ Хартл MJ, Mayr F, Rethwilm A, Wöhrl BM (2010). «Биофизические и ферментативные свойства обратной транскриптазы обезьян и прототипа пенистого вируса». Ретровирология. 7: 5. Дои:10.1186/1742-4690-7-5. ЧВК  2835651. PMID  20113504.CS1 maint: несколько имен: список авторов (ссылка на сайт)