Просапозин - Prosaposin

PSAP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1М12, 1N69, 1СН6, 2DOB, 2GTG, 2QYP, 2R0R, 2R1Q, 2RB3, 2Z9A, 3BQP, 3BQQ, 4DDJ, 4UEX, 4V2O
Идентификаторы
Псевдонимы	PSAP, GLBA, SAP1, просапозин, SAP2
Внешние идентификаторы	OMIM: 176801 MGI: 97783 ГомолоГен: 37680 Генные карты: PSAP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q22.1 Начинать 71,816,298 бп[1] Конец 71,851,325 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 B4 | 10 30,02 см Начинать 60,277,627 бп[2] Конец 60,302,597 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание с рецептором, сопряженным с G-белком • GO: 0001948 связывание с белками • связывание липидов • GO: 0010577 активность активатора фермента • бета-галактозидазная активность • связывание фосфолипидов • активность гомодимеризации белков • связывание ганглиозида GM1 • связывание ганглиозида GM2 • связывание ганглиозидов GM3 • связывание ганглиозидов GT1b • связывание ганглиозида GP1c • идентичное связывание с белками • связывание протеазы Сотовый компонент • лизосомальная мембрана • неотъемлемый компонент мембраны • митохондрия • просвет лизосомы • внеклеточная экзосома • внеклеточный • лизосома • клеточная мембрана • мембрана азурофильных гранул • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • внеклеточный матрикс • внеклеточная область • цитоплазма • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс • поздняя эндосома Биологический процесс • липидный обмен • липидный транспорт • дифференцировка эпителиальных клеток, участвующих в развитии предстательной железы • регулирование каскада МАПК • метаболический процесс гликосфинголипидов • развитие • Путь передачи сигналов рецептора, ингибирующего аденилатциклазу, сопряженного с G-белком • регулирование аутофагии • положительное регулирование каскада МАПК • клеточный ответ на органическое вещество • отрицательная регуляция гибели клеток, вызванной перекисью водорода • регуляция липидного обмена • рост предстательной железы • дегрануляция тромбоцитов • сфинголипидный метаболический процесс • GO: 0048554 положительное регулирование каталитической активности • дегрануляция нейтрофилов • транспорт ганглиозида GM1 на мембрану • развитие корнеоцитов • катаболический процесс галактозилцерамида • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • чувственное восприятие звука • миелинизация • нервно-мышечный процесс, контролирующий баланс • положительная регуляция активности гидролаз • мочеиспускание • развитие улитки • поведение при ходьбе • сборка ороговевшего конверта • лизосомальный транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5660	19156
Ансамбль	ENSG00000197746	ENSMUSG00000004207
UniProt	P07602 Q5BJH1	Q61207
RefSeq (мРНК)	NM_002778 NM_001042465 NM_001042466	NM_001146120 NM_001146121 NM_001146122 NM_001146123 NM_001146124 NM_011179
RefSeq (белок)	NP_001035930 NP_001035931 NP_002769 NP_002769.1	NP_001139592 NP_001139593 NP_001139594 NP_001139595 NP_001139596 NP_035309
Расположение (UCSC)	Chr 10: 71,82 - 71,85 Мб	Chr 10: 60.28 - 60.3 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Просапозин, также известный как PSAP, это белок который у человека кодируется PSAP ген.^[5]

Этот очень консервативный гликопротеин является предшественником 4 продуктов расщепления: сапозины A, B, C и D. Сапозин - это аббревиатура от Sфинголипид Аактиватор прО[S] teВс.^[6] Каждый домен белка-предшественника имеет длину примерно 80 аминокислотных остатков с почти идентичным расположением остатков цистеина и сайтов гликозилирования. Сапозины A-D локализуются преимущественно в лизосомный отсек, где они способствуют катаболизму гликосфинголипиды с коротким олигосахарид группы. Белок-предшественник существует как в виде секреторного белка, так и в виде интегрального мембранного белка и имеет нейротрофический виды деятельности.^[5]

Сапозины A – D необходимы для гидролиза определенных сфинголипидов определенными лизосомальными гидролазами.^[7]

Члены семьи

• Сапозин А был идентифицирован как N-концевой домен в кДНК просапозина до его выделения. Известно, что он стимулирует ферментативный гидролиз 4-метилумбеллиферил-β-глюкозида, глюкоцереброзида и галактоцереброзида.^[8]
• Сапозин B был первым, который был обнаружен, и было обнаружено, что он необходим в качестве термостабильного фактора для гидролиза сульфатидов арилсульфатазой A. Он известен под множеством разных названий, таких как белок-активатор сфинголипидов-1 (SAP-1), активатор сульфатидов белок, ГМ₁ активатор ганглиозидов, диспергирующий и неспецифический.^[9] Было замечено, что именно этот сапозин активирует многие ферменты посредством взаимодействия с субстратами, а не с самими ферментами.
• Сапозин С был вторым обнаруженным сапозином, который стимулирует гидролиз гликозилцереброзида гликозилцерамидазой и галактоцереброзида галактозилцерамидазой.
• Сапозин D не очень хорошо известно из-за отсутствия расследования на данный момент. Это было предсказано на основе последовательности кДНК просапозина, такого как сапозин А. Ферментативная стимуляция очень специфична для этого конкретного гликопротеина и до конца не изучена.^[7]
• GM2A (Активатор ганглиозидов GM2) рассматривался как член семейства SAP и получил название SAP-3 (белок-активатор сфинголипидов 3).^[10]

Кристаллические структуры сапозинов человека A-D

• 

  Сапозин А (PDB: 2DOB​).^[11]

• 

  Сапозин B (PDB: 1N69​).^[12]

• 

  Димер сапозина С в открытой конформации (PDB: 2QYP​).^[13]

• 

  Сапозин D (PDB: 2RB3​).^[13]

Структура

Каждый сапозин содержит около 80 аминокислотных остатков и шесть равнорасположенных цистеинов, два пролина и сайт гликозилирования (два в сапозине A, по одному в сапозинах B, C и D).^[7] Поскольку сапозины обладают высокой термостойкостью, наличием дисульфидных связей и устойчивостью к большинству протеаз, предполагается, что они являются чрезвычайно компактными и жестко связанными дисульфидными связями молекулами. Каждый сапозин имеет α-спиральную структуру, которая рассматривается как важная для стимуляции, потому что эта структура максимальна при pH 4,5; что оптимально для многих лизосомальных гидролаз.^[7] Эта спиральная структура наблюдается во всех (особенно в первой области), но было предсказано, что сапозин имеет конфигурацию β-складок из-за первых 24 аминокислот на N-конце.^[9]

Функция

Они, вероятно, действуют, изолируя липидный субстрат от окружения мембраны, делая его более доступным для растворимых деградирующие ферменты. который содержит четыре Сапозин-B домены, давая активные сапозины после протеолитического расщепления, и два Сапозин-А домены которые удаляются в реакции активации. Домены сапозина-B также встречаются в других белках, многие из которых активны в лизисе мембран.^[14][15]

Клиническое значение

Мутации в этом гене были связаны с Болезнь Гоше, Болезнь Тея – Сакса, и метахроматическая лейкодистрофия.^[6]

Смотрите также

• Белковый домен сапозина

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197746 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000004207 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: просапозин PSAP (вариант болезни Гоше и вариант метахроматической лейкодистрофии)».
6. Моримото С., Ямамото Ю., О'Брайен Дж. С., Кисимото Ю. (май 1990 г.). «Распределение белков сапозина (белков-активаторов сфинголипидов) в лизосомных накоплениях и других заболеваниях». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (9): 3493–7. Дои:10.1073 / pnas.87.9.3493. ЧВК  53927. PMID  2110365.
7. Кишимото Ю., Хираива М., О'Брайен Дж. С. (сентябрь 1992 г.). «Сапозины: структура, функции, распределение и молекулярная генетика». J. Lipid Res. 33 (9): 1255–67. PMID  1402395.
8. Моримото С., Мартин Б.М., Ямамото Ю., Крец К.А., О'Брайен Дж. С., Кишимото Ю. (май 1989 г.). «Сапозин А: второй белок-активатор цереброзидазы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (9): 3389–93. Дои:10.1073 / пнас.86.9.3389. ЧВК  287138. PMID  2717620.
9. О'Брайен Дж. С., Кисимото Ю. (март 1991 г.). «Белки сапозина: структура, функция и роль в лизосомных нарушениях накопления человека». FASEB J. 5 (3): 301–8. Дои:10.1096 / fasebj.5.3.2001789. PMID  2001789. S2CID  40251569.
10. Комитет по номенклатуре генов HUGO, «GM2A», База данных HGNC, получено 2016-03-13.
11. Ан В.Е., Лейко П., Алаттия Дж. Р., Чен Л., Привэ Г. Г. (август 2006 г.). «Кристаллические структуры сапозинов А и С». Белковая наука. 15 (8): 1849–57. Дои:10.1110 / пс 062256606. ЧВК  2242594. PMID  16823039.
12. Ан В. Е., Фаулл К. Ф., Уайтлегдж Дж. П., Флухарти А. Л., Привэ Г. Г. (январь 2003 г.). «Кристаллическая структура сапозина B показывает димерную оболочку для связывания липидов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (1): 38–43. Дои:10.1073 / pnas.0136947100. ЧВК  140876. PMID  12518053.
13. Россманн М., Шульц-Хайенброк Р., Бельке Дж., Реммель Н., Алингс К., Сандхофф К., Зенгер В., Майер Т. (май 2008 г.). «Кристаллические структуры сапозинов человека C и D: значение для распознавания липидов и мембранных взаимодействий». Структура. 16 (5): 809–17. Дои:10.1016 / j.str.2008.02.016. PMID  18462685.
14. Понтинг CP (1994). «Кислая сфингомиелиназа обладает доменом, гомологичным ее белкам-активаторам: сапозинам B и D». Белковая наука. 3 (2): 359–361. Дои:10.1002 / pro.5560030219. ЧВК  2142785. PMID  8003971.
15. Хофманн К., Чопп Дж. (1996). «Цитотоксические Т-клетки: больше оружия для новых целей?». Тенденции Microbiol. 4 (3): 91–94. Дои:10.1016 / 0966-842X (96) 81522-8. PMID  8868085.

дальнейшее чтение

• Гизельманн В., Злотогора Дж., Харрис А. и др. (1995). «Молекулярная генетика метахроматической лейкодистрофии». Гм. Мутат. 4 (4): 233–42. Дои:10.1002 / humu.1380040402. PMID  7866401. S2CID  23519007.
• Шнабель Д., Шредер М., Фюрст В. и др. (1992). «Одновременный дефицит белков-активаторов сфинголипидов 1 и 2 вызван мутацией в кодоне инициации их общего гена». J. Biol. Chem. 267 (5): 3312–5. PMID  1371116.
• Хираива М., Соеда С., Кисимото Ю., О'Брайен Дж. С. (1993). «Связывание и транспорт ганглиозидов просапозином». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (23): 11254–8. Дои:10.1073 / пнас.89.23.11254. ЧВК  50528. PMID  1454804.
• Рорман EG, Scheinker V, Grabowski GA (1992). «Структура и эволюция хромосомного гена просапозина человека». Геномика. 13 (2): 312–8. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90247-П. PMID  1612590.
• Кондо К., Хинено Т., Сано А., Какимото Ю. (1992). «Выделение и характеристика просапозина из грудного молока». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 181 (1): 286–92. Дои:10.1016 / S0006-291X (05) 81415-9. PMID  1958198.
• Holtschmidt H, Sandhoff K, Fürst W. и др. (1991). «Организация гена белка-активатора сульфата цереброзида человека». FEBS Lett. 280 (2): 267–70. Дои:10.1016 / 0014-5793 (91) 80308-П. PMID  2013321. S2CID  38952277.
• Holtschmidt H, Sandhoff K, Kwon HY и др. (1991). «Белок-активатор сульфатидов. Альтернативный сплайсинг, который генерирует три мРНК и недавно обнаруженную мутацию, ответственную за клиническое заболевание». J. Biol. Chem. 266 (12): 7556–60. PMID  2019586.
• Хинено Т., Сано А., Кондо К. и др. (1991). «Секреция предшественника активатора сфинголипидгидролазы, просапозина». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 176 (2): 668–74. Дои:10.1016 / S0006-291X (05) 80236-0. PMID  2025281.
• Шнабель Д., Шредер М., Сандхофф К. (1991). «Мутация в белке-активаторе сфинголипидов 2 у пациента с вариантом болезни Гоше». FEBS Lett. 284 (1): 57–9. Дои:10.1016 / 0014-5793 (91) 80760-Z. PMID  2060627. S2CID  42681055.
• Чжан XL, Рафи М.А., ДеГала Г., Венгер Д.А. (1991). «Механизм встраивания 33 нуклеотидов в мРНК, вызывающий дефицитную метахроматическую лейкодистрофию белка-активатора сфинголипидов (SAP-1)». Гм. Genet. 87 (2): 211–5. Дои:10.1007 / BF00204185. PMID  2066109. S2CID  23791396.
• Fürst W., Schubert J, Machleidt W. и др. (1990). «Полные аминокислотные последовательности белка-активатора ганглиозида GM2 человека и белка-активатора цереброзид-сульфата». Евро. J. Biochem. 192 (3): 709–14. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1990.tb19280.x. PMID  2209618.
• Рафи М.А., Чжан XL, ДеГала Г., Венгер Д.А. (1990). «Обнаружение точечной мутации в мРНК белка-активатора сфинголипидов-1 у пациентов с вариантной формой метахроматической лейкодистрофии». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 166 (2): 1017–23. Дои:10.1016 / 0006-291X (90) 90912-7. PMID  2302219.
• Крец К.А., Карсон Г.С., Моримото С. и др. (1990). «Характеристика мутации в семье с дефицитом сапозина B: дефект сайта гликозилирования». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (7): 2541–4. Дои:10.1073 / pnas.87.7.2541. ЧВК  53725. PMID  2320574.
• Накано Т., Сандхофф К., Штюмпер Дж. И др. (1989). «Структура полноразмерной кДНК, кодирующей активатор сульфатида, Co-бета-глюкозидазу и два других гомологичных белка: две альтернативные формы активатора сульфатида». J. Biochem. 105 (2): 152–4. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a122629. PMID  2498298.
• Рорман Э.Г., Грабовски Г.А. (1990). «Молекулярное клонирование кДНК человеческой ко-бета-глюкозидазы: свидетельство того, что четыре белка-активатора сфинголипидгидролазы кодируются отдельными генами у людей и крыс». Геномика. 5 (3): 486–92. Дои:10.1016/0888-7543(89)90014-1. PMID  2515150.
• Моримото С., Мартин Б.М., Ямамото Ю. и др. (1989). «Сапозин А: второй белок-активатор цереброзидазы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (9): 3389–93. Дои:10.1073 / пнас.86.9.3389. ЧВК  287138. PMID  2717620.
• Девджи Н.Н., Венгер Д.А., О'Брайен Дж. С. (1988). «Нуклеотидная последовательность клонированной кДНК для предшественника белка 1 активатора сфинголипидов человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 84 (23): 8652–6. Дои:10.1073 / пнас.84.23.8652. ЧВК  299604. PMID  2825202.
• О'Брайен Дж. С., Крец К. А., Девджи Н. и др. (1988). «Кодирование двух белков-активаторов сфинголипидов (SAP-1 и SAP-2) одним и тем же генетическим локусом». Наука. 241 (4869): 1098–101. Дои:10.1126 / science.2842863. PMID  2842863.
• Моримото С., Мартин Б.М., Кишимото Ю., О'Брайен Дж. С. (1988). «Сапозин D: активатор сфингомиелиназы». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 156 (1): 403–10. Дои:10.1016 / S0006-291X (88) 80855-6. PMID  2845979.
• Девджи Н., Венгер Д., Фуджибаяши С. и др. (1986). «Молекулярное клонирование белка-активатора сфинголипидов-1 (SAP-1), активатора сульфатидсульфатазы». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 134 (2): 989–94. Дои:10.1016 / S0006-291X (86) 80518-6. PMID  2868718.

внешняя ссылка

• Сапозины в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)