POLR3F - POLR3F

POLR3F
Белок POLR3F PDB 2dk5.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPOLR3F, RPC39, RPC6, субъединица F полимеразы (РНК) III, субъединица F РНК-полимеразы III, C34
Внешние идентификаторыOMIM: 617455 MGI: 1924086 ГомолоГен: 4722 Генные карты: POLR3F
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение POLR3F
Геномное расположение POLR3F
Группа20p11.23Начинать18,467,389 бп[1]
Конец18,484,646 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE POLR3F 205218 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001282526
NM_006466

NM_029763

RefSeq (белок)

NP_001269455
NP_006457

NP_084039

Расположение (UCSC)Chr 20: 18.47 - 18.48 МбChr 2: 144,53 - 144,54 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

ДНК-направленная субъединица РНК-полимеразы III RPC6 является фермент что у людей кодируется POLR3F ген.[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является одной из более чем дюжины субъединиц, образующих эукариотическую РНК-полимеразу III (РНК Pol III), которая транскрибирует гены 5S рибосомной РНК и тРНК. Было показано, что этот белок связывает как TFIIIB90, так и TBP, две субъединицы фактора инициации транскрипции РНК-полимеразы III IIIB (TFIIIB). В отличие от большинства других субъединиц Pol III РНК, кодируемый белок является уникальным для этой полимеразы.[6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции POLR3F. Условный нокаутирующая мышь линия называется Polr3ftm1a (EUCOMM) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[7] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[8] для определения последствий удаления.[9][10][11][12] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000132664 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027427 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ван З., Рёдер Р.Г. (май 1997 г.). «Три субъединицы, специфичные для РНК-полимеразы III человека, образуют субкомплекс с селективной функцией в специфической инициации транскрипции». Гены и развитие. 11 (10): 1315–26. Дои:10.1101 / gad.11.10.1315. PMID  9171375.
  6. ^ а б "Ген Entrez: полипептид F полимеразы (РНК) III (ДНК-направленный) POLR3F, 39 кДа".
  7. ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  8. ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
  9. ^ Скарнес В.С., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  10. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  11. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  12. ^ Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс Н. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
  13. ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

дальнейшее чтение