POLR2I - POLR2I

POLR2I
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5IYD, 5IY8, 5IY6, 5IYA, 5IYC, 5IY7, 5IY9, 5IYB
Идентификаторы
Псевдонимы	POLR2I, RPB9, hRPB14.5, субъединица I полимеразы (РНК) II, субъединица I РНК-полимеразы II
Внешние идентификаторы	OMIM: 180662 MGI: 1917170 ГомолоГен: 4541 Генные карты: POLR2I
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.12 Начинать 36,113,709 бп[1] Конец 36,115,213 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты • ДНК-направленная активность 5'-3 'РНК-полимеразы Сотовый компонент • ядрышко • ДНК-направленная РНК-полимераза II, основной комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Кеппинг мРНК 7-метилгуанозина • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II • сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов • расщепление мРНК • Метаболический процесс РНК • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • поддержание точности транскрипции во время удлинения транскрипции с использованием ДНК-шаблона с промотора РНК-полимеразы II • транскрипционно-связанная эксцизионная репарация нуклеотидов • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • поддержание популяции соматических стволовых клеток • положительная регуляция вирусной транскрипции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5438	69920
Ансамбль	ENSG00000105258	ENSMUSG00000019738
UniProt	P36954	P60898
RefSeq (мРНК)	NM_006233	NM_027259
RefSeq (белок)	NP_006224	NP_081535
Расположение (UCSC)	Chr 19: 36.11 - 36.12 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-направленная субъединица РНК-полимеразы II RPB9 является фермент что у людей кодируется POLR2I ген.^[4]

Этот ген кодирует субъединицу РНК-полимераза II, то полимераза отвечает за синтез РНК-мессенджера в эукариоты. Эта субъединица в сочетании с двумя другими субъединицами полимеразы образует ДНК-связывающий домен полимеразы, бороздку, в которой ДНК шаблон транскрибируется в РНК. Продукт этого гена имеет два мотива цинковых пальцев с консервативными цистеины и субъединица действительно обладает активностью связывания цинка.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105258 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Акер Дж., Маттей М.Г., Винцерит М., Рокель Н., Депетрис Д., Виньерон М., Кединджер С. (август 1994 г.). «Хромосомная локализация генов субъединиц РНК-полимеразы II человека». Геномика. 20 (3): 496–9. Дои:10.1006 / geno.1994.1208. PMID  8034326.
5. «Ген Entrez: полипептид I полимеразы (РНК) II (ДНК-направленный) POLR2I, 14,5 кДа».

дальнейшее чтение

• Джанг К.Т. (1998). «Tat, Tat-ассоциированная киназа и транскрипция». J. Biomed. Наука. 5 (1): 24–7. Дои:10.1007 / BF02253352. PMID  9570510.
• Янкулов К, Бентли Д (1998). «Транскрипционный контроль: кофакторы Tat и удлинение транскрипции». Curr. Биол. 8 (13): R447–9. Дои:10.1016 / S0960-9822 (98) 70289-1. PMID  9651670. S2CID  15480646.
• Романо Дж., Кастен М., Де Фалько Дж. И др. (2000). «Регуляторные функции Cdk9 и циклина T1 в экспрессии гена пути трансактивации tat ВИЧ». J. Cell. Биохим. 75 (3): 357–68. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4644 (19991201) 75: 3 <357 :: AID-JCB1> 3.0.CO; 2-K. PMID  10536359.
• Марчелло А., Зоппе М., Джакка М. (2002). «Множественные способы регуляции транскрипции трансактиватором HIV-1 Tat». IUBMB Life. 51 (3): 175–81. Дои:10.1080/152165401753544241. PMID  11547919. S2CID  10931640.
• Стивенс М., Де Клерк Э., Бальзарини Дж. (2007). «Регуляция транскрипции ВИЧ-1: молекулярные мишени для химиотерапевтического вмешательства». Med Res Rev. 26 (5): 595–625. Дои:10.1002 / med.20081. ЧВК  7168390. PMID  16838299.
• Харрич Д., Макмиллан Н., Муньос Л. и др. (2007). «Приведут ли разнообразные взаимодействия Tat к новым мишеням для антиретровирусных препаратов?». Текущие цели в отношении лекарств. 7 (12): 1595–606. Дои:10.2174/138945006779025338. PMID  17168834.
• Като Х., Сумимото Х., Погнонек П. и др. (1992). «ВИЧ-1 Tat действует как фактор процессивности in vitro в сочетании с факторами клеточного удлинения». Genes Dev. 6 (4): 655–66. Дои:10.1101 / gad.6.4.655. PMID  1559613.
• Саутгейт С., Запп М.Л., Грин М.Р. (1990). «Активация транскрипции с помощью белка Tat ВИЧ-1, связанного с формирующейся РНК через другой белок». Природа. 345 (6276): 640–2. Bibcode:1990Натура.345..640С. Дои:10.1038 / 345640a0. PMID  2190099. S2CID  4233742.
• Ву-Баер Ф, Сигман Д., Гейнор РБ (1995). «Специфическое связывание РНК-полимеразы II с РНК трансактивирующей области вируса иммунодефицита человека регулируется клеточными кофакторами и Tat». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (16): 7153–7. Bibcode:1995PNAS ... 92.7153W. Дои:10.1073 / пнас.92.16.7153. ЧВК  41297. PMID  7638159.
• Herrmann CH, Rice AP (1995). «Белки Tat лентивируса специфически связываются с клеточной протеинкиназой TAK, которая гиперфосфорилирует карбоксиконцевой домен большой субъединицы РНК-полимеразы II: кандидат в кофактор Tat». Дж. Вирол. 69 (3): 1612–20. Дои:10.1128 / JVI.69.3.1612-1620.1995. ЧВК  188757. PMID  7853496.
• Акер Дж., Винцерит М, Виннерон М, Кединджер С. (1994). «Структура гена, кодирующего субъединицу 14,5 кДа РНК-полимеразы II человека». Нуклеиновые кислоты Res. 21 (23): 5345–50. Дои:10.1093 / nar / 21.23.5345. ЧВК  310569. PMID  8265347.
• Кин Нью-Джерси, Гейт MJ, Карн Дж (1996). «Вирус иммунодефицита человека типа 1 Tat является неотъемлемым компонентом активированного комплекса транскрипции-элонгации». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (6): 2505–10. Bibcode:1996PNAS ... 93.2505K. Дои:10.1073 / пнас.93.6.2505. ЧВК  39827. PMID  8637904.
• Ян X, Herrmann CH, Rice AP (1996). «Белки Tat вируса иммунодефицита человека специфически связываются с TAK in vivo и требуют для функционирования карбоксиконцевого домена РНК-полимеразы II». Дж. Вирол. 70 (7): 4576–84. Дои:10.1128 / JVI.70.7.4576-4584.1996. ЧВК  190394. PMID  8676484.
• Агостини I, Наварро Дж. М., Рей Ф. и др. (1996). «Трансактиватор Vpr вируса иммунодефицита человека типа 1: взаимодействие с активаторными доменами, связанными с промотором, и связывание с TFIIB». J. Mol. Биол. 261 (5): 599–606. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0485. PMID  8800208.
• Чжоу Q, Шарп PA (1996). «Tat-SF1: кофактор для стимуляции элонгации транскрипции с помощью Tat ВИЧ-1». Наука. 274 (5287): 605–10. Bibcode:1996Sci ... 274..605Z. Дои:10.1126 / science.274.5287.605. PMID  8849451. S2CID  13266489.
• Окамото Х., Шелин С.Т., Корден Дж.Л. и др. (1996). «Для трансактивации белком Tat вируса иммунодефицита человека требуется С-концевой домен РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (21): 11575–9. Bibcode:1996PNAS ... 9311575O. Дои:10.1073 / пнас.93.21.11575. ЧВК  38099. PMID  8876177.
• Чун РФ, Чжан К.Т. (1996). «Требования к карбоксиконцевому домену РНК-полимеразы II для активированной транскрипции ретровирусов человека, лимфотропного вируса I Т-клеток человека и ВИЧ-1». J. Biol. Chem. 271 (44): 27888–94. Дои:10.1074 / jbc.271.44.27888. PMID  8910388.
• Parada CA, Roeder RG (1996). «Повышенная процессивность РНК-полимеразы II, вызванная Tat-индуцированным фосфорилированием ее карбоксиконцевого домена». Природа. 384 (6607): 375–8. Bibcode:1996Натура.384..375P. Дои:10.1038 / 384375a0. PMID  8934526. S2CID  4278432.
• Гарсиа-Мартинес Л.Ф., Иванов Д., Гейнор РБ (1997). «Ассоциация Tat с очищенными комплексами преинициации транскрипции ВИЧ-1 и ВИЧ-2». J. Biol. Chem. 272 (11): 6951–8. Дои:10.1074 / jbc.272.11.6951. PMID  9054383.