PICK1 - PICK1

PICK1
Протеин PICK1 PDB 2gzv.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыPICK1, PICK, PRKCABP, белок, взаимодействующий с PRKCA 1
Внешние идентификаторыOMIM: 605926 MGI: 894645 ГомолоГен: 7470 Генные карты: PICK1
Расположение гена (человек)
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человек)[1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение PICK1
Геномное расположение PICK1
Группа22q13.1Начните38,056,311 бп[1]
Конец38,075,701 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE PICK1 204746 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001039583
NM_001039584
NM_012407

NM_001045558
NM_008837

RefSeq (белок)

н / д

Расположение (UCSC)Chr 22: 38.06 - 38.08 МбChr 15: 79.23 - 79.25 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок, взаимодействующий с С-киназой - 1 это белок что у людей кодируется PICK1 ген.[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, содержит домен PDZ, через который он взаимодействует с протеинкиназой C, альфа (PRKCA ). Этот белок может функционировать как адаптер, который связывает и организует субклеточную локализацию множества мембранных белков. Было показано, что он взаимодействует с множеством подтипов рецепторов глутамата, моноаминовыми переносчиками плазматической мембраны, а также с натриевыми каналами, не управляемыми напряжением, и может нацеливать PRKCA на эти мембранные белки и, таким образом, регулировать их распределение и функцию. Также было обнаружено, что этот белок действует как закрепляющий белок, который специфически нацеливает PRKCA на митохондрии лиганд-специфическим образом. Для этого гена были обнаружены три варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.[7]

Взаимодействия

PICK1 был показан взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100151 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068206 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Дев К.К., Нисимуне А., Хенли Дж. М., Наканиши С. (июль 1999 г.). «Альфа-связывающий протеинкиназа С протеин PICK1 взаимодействует с короткими, но не длинными формами альтернативных вариантов сплайсинга субъединиц рецептора AMPA». Нейрофармакология. 38 (5): 635–44. Дои:10.1016 / S0028-3908 (98) 00230-5. PMID  10340301.
  6. ^ Данхэм I, Симидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Беар Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (декабрь 1999 г.). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
  7. ^ «Ген Entrez: белок PICK1, взаимодействующий с PRKCA 1».
  8. ^ Леонард А.С., Ермолаева О., Хруска-Хагеман А., Асквит С.К., Прайс М.П., ​​Wemmie JA, Welsh MJ (февраль 2003 г.). «цАМФ-зависимое фосфорилирование протеинкиназы кислоточувствительного ионного канала-1 регулирует его связывание с белком, взаимодействующим с С-киназой-1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (4): 2029–34. Дои:10.1073 / pnas.252782799. ЧВК  149953. PMID  12578970.
  9. ^ а б Hruska-Hageman AM, Wemmie JA, Price MP, Welsh MJ (февраль 2002 г.). «Взаимодействие синаптического белка PICK1 (белок, взаимодействующий с C-киназой 1) с натриевыми каналами, не управляемыми напряжением, BNC1 (мозговой Na + канал 1) и ASIC (кислоточувствительный ионный канал)». Biochem. J. 361 (Pt 3): 443–50. Дои:10.1042/0264-6021:3610443. ЧВК  1222326. PMID  11802773.
  10. ^ Торрес Г.Е., Яо В.Д., Мон А.Р., Куан Х., Ким К.М., Леви А.И., Штаудингер Дж., Карон М.Г. (апрель 2001 г.). «Функциональное взаимодействие между моноаминовыми переносчиками плазматической мембраны и синаптическим PDZ-доменом-содержащим белком PICK1». Нейрон. 30 (1): 121–34. Дои:10.1016 / s0896-6273 (01) 00267-7. PMID  11343649.
  11. ^ а б c d е Хирбек Х., Перестенко О., Нишимуне А., Мейер Г., Наканиши С., Хенли Дж. М., Дев К. К. (май 2002 г.). «Белки PDZ PICK1, GRIP и синтенин связывают несколько подтипов рецепторов глутамата. Анализ мотивов связывания PDZ». J. Biol. Chem. 277 (18): 15221–4. Дои:10.1074 / jbc.C200112200. PMID  11891216.
  12. ^ а б Хирбек Х., Фрэнсис Дж. К., Лаури С. Е., Брейтуэйт С. П., Куссен Ф., Малле С., Дев К. К., Кутиньо В., Мейер Дж., Исаак Дж. Т., Коллингридж Г. Л., Хенли Дж. М., Кутино В. (февраль 2003 г.). «Быстрая и дифференциальная регуляция AMPA и каинатных рецепторов в синапсах гиппокампа, покрытых мхом, с помощью PICK1 и GRIP». Нейрон. 37 (4): 625–38. Дои:10.1016 / s0896-6273 (02) 01191-1. ЧВК  3314502. PMID  12597860.
  13. ^ Жаулин-Бастард Ф., Сайто Х., Ле Бивик А., Оллендорф В., Маркетто С., Бирнбаум Д., Борг Дж. П. (май 2001 г.). «Рецептор ERBB2 / HER2 по-разному взаимодействует с белками домена ERBIN и PICK1 PSD-95 / DLG / ZO-1». J. Biol. Chem. 276 (18): 15256–63. Дои:10.1074 / jbc.M010032200. PMID  11278603.
  14. ^ Дев К.К., Накадзима Ю., Китано Дж., Брейтуэйт С.П., Хенли Дж. М., Наканиши С. (октябрь 2000 г.). «PICK1 взаимодействует и регулирует фосфорилирование PKC mGLUR7». J. Neurosci. 20 (19): 7252–7. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.20-19-07252.2000. ЧВК  6772771. PMID  11007882.

дальнейшее чтение

внешние ссылки