Ортологичная матрица - Orthologous MAtrix
 | |
|---|---|
| Содержание | |
| Описание | ортология вывод среди 1000 полных геномов. |
| Контакт | |
| Лаборатория | ETH Цюрих |
| Авторы | Кристоф Дессимо Адриан Шнайдер Адриан Альтенхофф Гастон Х. Гонне |
| Основное цитирование | Альтенхофф и др.[1] |
| Дата выхода | 2004 |
| Доступ | |
| Интернет сайт | обозреватель |
| Скачать URL | http://omabrowser.org/All/download.html |
| веб-сервис URL | WSDL |
| Разное | |
| Выпуск данных частота | 2 релиза в год |
OMA (Ортологичная матрица) - это база данных ортологи извлечено из доступного полного геномы.[1][2] Ортологические предсказания OMA доступны в нескольких формах:
- Пары OMA: для данного ген, список прогнозируемых ортологи в другом разновидность предоставлен.
- Группы OMA: набор генов в разных разновидность которые все ортологичный.
- Иерархические группы OMA: набор всех генов, которые произошли от одного предкового гена в данном таксономический классифицировать.
- Представление пар генома OMA: список всех предсказанных ортологи между двумя разновидность.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б Альтенхофф, Адриан М; Шнайдер Адриан; Гонне Гастон Н; Дессимоз Кристоф (январь 2011 г.). «OMA 2011: вывод ортологии среди 1000 полных геномов». Нуклеиновые кислоты Res. Англия. 39 (Выпуск базы данных): D289-94. Дои:10.1093 / nar / gkq1238. ЧВК 3013747. PMID 21113020.
- ^ Альтенхофф, Адриан М; Гловер, Наташа М; Поезд, Клеман-Мари; Калеб, Клара; Уорвик Вестроци, Алекс; Дилус, Дэвид; де Фариас, Tarcisio M; Зиле, Карина; Стивенсон, Чарльз; Лонг, Цзяо; Редестиг, Хеннинг; Gonnet, Gaston H; Дессимоз, Кристоф (2018). «База данных ортологии OMA в 2018 году: поиск эволюционных взаимосвязей между всеми сферами жизни с помощью более богатых веб-интерфейсов и программных интерфейсов». Исследования нуклеиновых кислот. 46 (D1): D477 – D485. Дои:10.1093 / нар / gkx1019. ISSN 0305-1048. ЧВК 5753216. PMID 29106550.
 | Этот Биологическая база данных -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |