НИПБЛ - NIPBL
Nipped-B-подобный белок (НИПБЛ), также известный как SCC2 или же деланжин это белок что у людей кодируется НИПБЛ ген.[5] NIPBL требуется для ассоциации когезин с ДНК и является основной субъединицей загрузочного комплекса когезина.[6] Гетерозиготные мутации в НИПБЛ составляют примерно 60% случаев Синдром Корнелии де Ланге.[7]
Структура и взаимодействие
NIPBL - это большой белок в форме крючка, содержащий ТЕПЛО повторяется.[8] NIPBL образует комплекс с MAU2 (Scc4 у почкующихся дрожжей), известный как комплекс загрузки когезина.[9] Как следует из этого названия, NIPBL и MAU2 необходимы для начальной ассоциации когезина с ДНК.
Считается, что Cohesin является посредником энхансер-промоторные взаимодействия и генерировать Топологически связанный домен. Наряду с опосредованием сцепления и регуляции архитектуры ДНК, когезиновый комплекс необходим для восстановления ДНК посредством гомологичная рекомбинация. Учитывая, что NIPBL необходим для ассоциации когезина с ДНК, считается, что NIPBL также необходим для всех этих процессов. Соответственно, инактивация Nipbl приводит к потере топологически связанных доменов.[10] и сплоченность.[11]
NIPBL динамически связывается с хроматин в основном через ассоциацию с когезин.[12] Движение NIPBL внутри хроматина согласуется с механизмом, включающим прыжки между хромосомный когезиновые кольца. Независимая от когезина функция в регуляции экспрессии генов также была продемонстрирована для NIPBL.[13][14]
Клиническое значение
Мутации в этом гене приводят к Синдром Корнелии де Ланге (CdLS), расстройство, характеризующееся дисморфическими чертами лица, задержкой роста, дефектами сокращения конечностей и умственной отсталостью.[5] Поскольку эти мутации обычно гетерозиготный, CdLS вызвана сокращением численности Nipbl, а не полной потерей. Эксперименты на клетках пациентов и мышей показывают, что снижение составляет менее половины.[15] Неизвестно, почему снижение экспрессии Nipbl приводит к CdLS.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164190 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022141 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б «Ген Entrez: гомолог Nipped-B (Drosophila)».
- ^ Ciosk R, Shirayama M, Shevchenko A, Tanaka T, Toth A, Shevchenko A, Nasmyth K (2000). «Связывание когезина с хромосомами зависит от отдельного комплекса, состоящего из белков Scc2 и Scc4». Молекулярная клетка. 5 (2): 243–54. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80420-7. PMID 10882066.
- ^ Рохатги С., Кларк Д., Клайн А.Д., Джексон Л.Г., Пай Дж., Сиу В., Рамос Ф.Д., Кранц И.Д., Дирдорф М.А. (июль 2010 г.). «Лицевая диагностика легкой и вариантной CdLS: выводы обследования дисморфолога». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 152A (7): 1641–53. Дои:10.1002 / ajmg.a.33441. ЧВК 4133091. PMID 20583156.
- ^ Kikuchi S, Borek DM, Otwinowski Z, Tomchick DR, Yu H (ноябрь 2016 г.). «Кристаллическая структура загрузчика когезина Scc2 и понимание когезинопатии». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 113 (44): 12444–12449. Дои:10.1073 / pnas.1611333113. ЧВК 5098657. PMID 27791135.
- ^ Нэсмит К. (октябрь 2011 г.). «Cohesin: цепочка с отдельными входными и выходными воротами?». Природа клеточной биологии. 13 (10): 1170–7. Дои:10.1038 / ncb2349. PMID 21968990. S2CID 25382204.
- ^ Шварцер В., Абденнур Н., Голобородько А., Пековска А., Фуденберг Г., Ло-Ми Ю., Фонсека Н. А., Хубер В., Херинг К., Мирный Л., Шпиц Ф (15 декабря 2016 г.). «Два независимых способа организации хромосом выявляются при удалении когезина». п. 094185. bioRxiv 10.1101/094185.
- ^ Ciosk R, Shirayama M, Shevchenko A, Tanaka T, Toth A, Shevchenko A, Nasmyth K (февраль 2000 г.). «Связывание когезина с хромосомами зависит от отдельного комплекса, состоящего из белков Scc2 и Scc4». Молекулярная клетка. 5 (2): 243–54. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80420-7. PMID 10882066.
- ^ Родос Дж., Мазза Д., Нэсмит К., Упхофф С. (2017). «Scc2 / Nipbl скачки между хромосомными кольцами когезина после загрузки». eLife. 6. Дои:10.7554 / eLife.30000. ЧВК 5621834. PMID 28914604.
- ^ Zuin J, Franke V, van Ijcken WF, van der Sloot A, Krantz ID, van der Reijden MI, Nakato R, Lenhard B, Wendt KS (февраль 2014 г.). «Независимая от когезинов роль NIPBL в промоутерах обеспечивает понимание CdLS». PLOS Genetics. 10 (2): e1004153. Дои:10.1371 / journal.pgen.1004153. ЧВК 3923681. PMID 24550742.
- ^ ван ден Берг Д.Л., Аззарелли Р., Оиши К., Мартынога Б., Урбан Н., Деккерс Д.Х., Деммерс Д.А., Гиллемот Ф. (январь 2017 г.). «Nipbl взаимодействует с Zfp609 и комплексом интеграторов для регулирования миграции кортикальных нейронов». Нейрон. 93 (2): 348–361. Дои:10.1016 / j.neuron.2016.11.047. ЧВК 5263256. PMID 28041881.
- ^ Kawauchi S, Calof AL, Santos R, Lopez-Burks ME, Young CM, Hoang MP, Chua A, Lao T., Lechner MS, Daniel JA, Nussenzweig A, Kitzes L, Yokomori K, Hallgrimsson B, Lander AD (сентябрь 2009 г.) . «Множественные дефекты системы органов и нарушение регуляции транскрипции у мышей Nipbl (+/-), модель синдрома Корнелии де Ланге». PLOS Genetics. 5 (9): e1000650. Дои:10.1371 / journal.pgen.1000650. ЧВК 2730539. PMID 19763162.
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 5 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |