NEIL2 - NEIL2

NEIL2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ВЗП
Идентификаторы
Псевдонимы	NEIL2, NEH2, NEI2, nei-подобная ДНК-гликозилаза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 608933 MGI: 2686058 ГомолоГен: 17032 Генные карты: NEIL2
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[1] Группа 14 | 14 D1 Начните 63,182,443 бп[1] Конец 63,193,856 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание микротрубочек • связывание ионов цинка • гидролазная активность, гидролизующие N-гликозильные соединения • связывание ионов металлов • гидролазная активность, действующая на гликозильные связи • повреждение связывания ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • каталитическая активность • лиазная активность • связывание нуклеиновой кислоты • ДНК- (апуриновый или апиримидиновый сайт) лиазная активность • гидролазная активность • Активность ДНК N-гликозилазы • класс I ДНК- (апуриновый или апиримидиновый сайт) лиазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитоскелет микротрубочек • микротрубочка веретена • ядро клетки • нуклеоплазма • внутриклеточная мембраносвязанная органелла Биологический процесс • эксцизионная репарация нуклеотидов • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • депиримидинация • метаболизм • эксцизионная пластика основания • Ремонт ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	252969	382913
Ансамбль	ENSG00000154328	ENSMUSG00000035121
UniProt	Q969S2	Q6R2P8
RefSeq (мРНК)	NM_001135746 NM_001135747 NM_001135748 NM_145043	NM_201610
RefSeq (белок)	NP_001129218 NP_001129219 NP_001129220 NP_659480 NP_001336368 NP_001336369 NP_001336370 NP_001336371	NP_963904
Расположение (UCSC)	н / д	Chr 14: 63.18 - 63.19 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Эндонуклеаза VIII-подобная 2 является фермент что у людей кодируется NEIL2 ген.^[4][5][6]

NEIL2 принадлежит к классу ДНК-гликозилаз, гомологичных бактериальному семейству Fpg / Nei. Эти гликозилазы инициируют первую стадию эксцизионной репарации оснований, расщепляя основания, поврежденные активными формами кислорода, и вводя разрыв цепи ДНК посредством связанной лиазной реакции (Bandaru et al., 2002) [предоставлено OMIM]^[6]

использованная литература

1. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035121 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Хазра Т.К., Ков Ю.В., Хатахет З., Имхофф Б., Болдог И., Моккапати С.К., Митра С., Изуми Т. (август 2002 г.). «Идентификация и характеристика новой ДНК-гликозилазы человека для репарации повреждений, вызванных цитозином». J Biol Chem. 277 (34): 30417–20. Дои:10.1074 / jbc.C200355200. PMID  12097317.
5. Дас С., Чаттопадхьяй Р., Бхакат К.К., Болдог И., Коно К., Прасад Р., Уилсон С.Х., Хазра Т.К. (сентябрь 2007 г.). «Стимуляция опосредованной NEIL2 эксцизионной репарации окисленного основания посредством взаимодействия YB-1 во время окислительного стресса». J Biol Chem. 282 (39): 28474–84. Дои:10.1074 / jbc.M704672200. ЧВК  2679419. PMID  17686777.
6. «Энтрез Ген: NEIL2 nei like 2 (E. coli)».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Такао М., Канно С., Кобаяши К. и др. (2003). «Резервная гликозилаза у мышей с нокаутом Nth1 является функциональным гомологом Nei (эндонуклеазы VIII)». J. Biol. Chem. 277 (44): 42205–13. Дои:10.1074 / jbc.M206884200. PMID  12200441.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Бандару В., Сункара С., Уоллес С.С., Бонд JP (2003). «Новая человеческая ДНК-гликозилаза, которая устраняет окислительные повреждения ДНК и гомологична эндонуклеазе VIII Escherichia coli». Ремонт ДНК (Amst.). 1 (7): 517–29. Дои:10.1016 / S1568-7864 (02) 00036-8. PMID  12509226.
• Доу Х., Митра С., Хазра Т.К. (2004). «Ремонт окисленных оснований в пузырьковых структурах ДНК человеческими ДНК-гликозилазами NEIL1 и NEIL2». J. Biol. Chem. 278 (50): 49679–84. Дои:10.1074 / jbc.M308658200. PMID  14522990.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Катафучи А., Накано Т., Масаока А. и др. (2004). «Дифференциальная специфичность гомологов III и VIII эндонуклеаз человека и Escherichia coli в отношении повреждений окислительных оснований». J. Biol. Chem. 279 (14): 14464–71. Дои:10.1074 / jbc.M400393200. PMID  14734554.
• Бхакат К.К., Хазра Т.К., Митра С. (2004). «Ацетилирование ДНК-гликозилазы человека NEIL2 и ингибирование ее активности». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (10): 3033–9. Дои:10.1093 / нар / гх632. ЧВК  434438. PMID  15175427.
• Дас А., Раджагопалан Л., Матхура В.С. и др. (2004). «Идентификация домена цинкового пальца в человеческом белке NEIL2 (Nei-like-2)». J. Biol. Chem. 279 (45): 47132–8. Дои:10.1074 / jbc.M406224200. PMID  15339932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Das A, Wiederhold L, Leppard JB и др. (2007). «NEIL2-инициированная, APE-независимая репарация окисленных оснований в ДНК: свидетельства репарационного комплекса в клетках человека». Ремонт ДНК (Amst.). 5 (12): 1439–48. Дои:10.1016 / днареп.2006.07.003. ЧВК  2805168. PMID  16982218.
• Бродерик П., Багратуни Т., Виджаякришнан Дж. И др. (2006). «Оценка генов NTHL1, NEIL1, NEIL2, MPG, TDG, UNG и SMUG1 при предрасположенности к семейному колоректальному раку». BMC Рак. 6: 243. Дои:10.1186/1471-2407-6-243. ЧВК  1624846. PMID  17029639.
• Катафучи А., Мацубара М., Терато Н. и др. (2007). «Специфичность повреждения ДНК-гликозилаз человека для окислительных пиримидиновых повреждений». Нуклеиновые кислоты Symp Ser (Oxf). 48 (48): 175–6. Дои:10.1093 / nass / 48.1.175. PMID  17150535.