Максудул Алам - Maqsudul Alam

Максудул Алам
Maqsudul.jpg
Родился(1954-12-14)14 декабря 1954 г.
Мадарипур, Восточная Бенгалия, Доминион Пакистана
Умер20 декабря 2014 г.(2014-12-20) (в возрасте 60 лет)
Гавайи, Соединенные Штаты
Место отдыхаГавайский генеральный парк, США
НациональностьБангладешско-американский
Альма-матерМосковский Государственный Университет
Институт биохимии Макса Планка
ИзвестенСеквенирование генома папайи, каучука и джута
Научная карьера
УчрежденияГавайский университет в Маноа

Максудул Алам (14 декабря 1954 - 20 декабря 2014) родился в Бангладеш наука о жизни ученый[1][2] кто известен своей работой над секвенирование генома. Его работа над секвенирование генома началось с бактерий Idiomarina loihiensis в 2003 г.[3] Он оказался в центре внимания бангладешцев после своей работы над секвенирование генома из тоша джута (Corchorus olitorius O4) в 2010 г.,[4] белый джут (Corchorus Capsularis CVL1) в 2013 г.[5] и грибок, поражающий джут (Макрофомина фазеолина ) в 2012.[6]

Алам также работал над секвенирование генома трансгенной папайи (Карика папайя Линней) в 2007 г.,[7] каучуковое дерево (Hevea brasiliensis ) в 2009,[8] бактерии Метилацидифилум инфернорум в 2007,[9] Methylocella silvestris BL2 в 2009 г.,[10] Saprospira grandis ул. Левин в 2011 году,[11] Geobacillus thermoleovorans CCB_US3_UF5 в 2011 г.,[12] Thermus sp. штамм CCB_US3_UF1 в 2011 г.,[13][14] Salmonella enterica subsp. Enterica Серовар Typhi P-stx-12 в 2011 г.,[15] Thermomyces lanuginosus Штамм SSBP[16] и Пантоя антофила в 2014.[17]

Ранние годы

Алам родился в Мадарипур, Восточный Пакистан. Его родителями были Далил Уддин Ахмед, мученик Освободительной войны 1971 года и служащий Восточно-пакистанских стрелков; и Лириан Ахмед, учитель и социальный работник.[1]

Личная жизнь

Алам женился на Ирине Анатольевне во время пребывания в России. Алам был докторантом, а Анатольевна тогда была студенткой-медиком. У пары родилась дочь по имени Лилиана Максудуловна Алам (1986-2019).[18] В 1992 году семья переехала в США. Пара развелась в 1997 году.[19]

Максудул с дочерью Лилианой

Позже Алам женился на Рафии Хасине в 2009 году.

Образование

Алам закончил среднее и высшее среднее образование от г. Государственная лаборатория средней школы и Колледж Дакки соответственно. Он получил степень магистра в Микробиология от Московский Государственный Университет в 1979 г .; и получил свою первую степень доктора философии в Микробиология из того же университета в 1982 году. Он получил свою вторую докторскую степень в Биохимия от Институт биохимии Макса Планка в 1987 г.[1][2]

Академическая карьера

С 1988–1990 гг. Алам был старшим научным сотрудником Института биоорганической химии Российской академии наук. Затем он был приглашенным научным сотрудником кафедры биохимии и биофизики в Университете штата Вашингтон с 1990–1992 гг. Алам был помощником директора Инженерного центра морских биопродуктов (MarBEC) при Гавайском университете.

В 1992 году Алам перешел на кафедру микробиологии в Гавайский университет, Маноа как доцент. В 1997 году получил звание доцента. Алам стал профессором в 2001 году и занимал эту должность до своей смерти. Он также был директором перспективных исследований в области геномики, протеомики и биоинформатики в Гавайском университете в Маноа с 2003 года до своей смерти.[1][2]

Алам был директором Центра химической биологии в Университете Сайнс Малайзии с 2009 по 2012 год.[2] В 2011 году Алам стал членом консультативного совета при Университет науки и технологий Шахджалал (SUST), Силхет.

Алам (верхний ряд, 6-й справа), Мухаммед Зафар Икбал, Ясмин Хак и другие учителя в SUST Шахид Минар, Силхет.

Научная карьера

В 2003 году Алам основал Расширенные исследования в области геномики, протеомики и биоинформатики (ASGPB) в Гавайский университет в Маноа. Объединив структуру секвенирования ДНК ASGPB с биоинформатическими активами в Центре высокопроизводительных вычислений Мауи (MHPCC), он запустил программу вычислительной протеомики, которая варьировалась от лабораторных исследований до in silico информатика.[2] Алам и его команда завершили секвенирование генома Idiomarina loihiensis,[3] древний организм, обнаруженный в гидротермальных жерлах Лоихи во время экспедиции Гавайского университета в 2003 году.[20]

В 2007 году Алам работал в Гавайском проекте «Геном папайи», целью которого было секвенировать полный геном трансгенного «SunUp». папайя. Папайя SunUp была генетически модифицирована, чтобы придать устойчивость к Вирус кольцевой пятнистости папайи, но гавайские фермеры не могли продавать трансгенную папайю в Японии; Алам и его команда секвенировали трансгенную папайю, чтобы помочь фермерам пройти через процесс регулирования.[7][21]

Алам основал Центр химической биологии в Universiti Sains Malaysia в 2009 году. Там он создал исследовательскую базу, исследовательские программы и работал над секвенированием генома каучукового дерева (Hevea brasiliensis ).[8]

Бангладешский проект генома джута

премьер-министр Шейх Хасина и Алам (2-й справа) на пресс-конференции (2010 г.), объявившей о завершении секвенирования генома джута.

В 2009 году Алам присоединился к проекту фундаментальных и прикладных исследований джута Исследовательского института джута, Бангладеш, в качестве главного исследователя. Он надеялся, что секвенирование генома товарный урожай любить джут поможет Бангладеш экономически, потому что джут можно производить устойчивый к болезням если известна последовательность генома. Команда Алама работала над секвенированием генома тосса джута (Corchorus olitorius O4)[4] а в 2010 году премьер-министр Шейх Хасина публично объявили, что геном джута расшифрован и будет подано несколько патентных заявок.[22][23] Команда Алама продолжила работу над секвенированием атакующего джута грибка (Макрофомина фазеолина )[6] в 2012 году и белый джут (Corchorus Capsularis CVL1)[5] в 2013.[1]

Смерть

20 декабря 2014 года Алам скончался в медицинском центре Королевы в Гонолулу, Гавайи. Он страдал циррозом печени. 23 декабря 2014 года он был похоронен на кладбище в Мемориальном парке Гавайев по его желанию.[24][25]

Награды

Алам был удостоен награды за выдающиеся достижения в области исследований Гавайского университета в 2001 году, премии NIH Shannon в 1997 году, научного сотрудника Гумбольдта в 1987 году Немецкого научного фонда.[1] В 2016 году Алам был награжден Премия Дня Независимости посмертно Правительство Бангладеш.[26]

«Фонд премии за исследования высших учебных заведений Максудул Алама» был создан Фондом Гавайского университета для поддержки обучения аспирантов и в честь Алама.[2]

Публикации

Главы книги

  • Синтения и коллинеарность в геномах растений (2008).[27]
  • Протоглобин и сенсоры, связанные с глобином (2008).[28]

использованная литература

  1. ^ а б c d е ж "О профессоре Максудул Аламе". Фундаментальные и прикладные исследования по проекту джута (BARJ), Бангладш.
  2. ^ а б c d е ж «ФОНД ВЫПУСКНИКОВ МАКСУДУЛ АЛАМА ИССЛЕДОВАНИЙ». УНИВЕРСИТЕТ ФОНДА ГАВАИ.
  3. ^ а б Хоу, Шаобинь; Пила, Джимми Х .; Ли, Кит Шан; Freitas, Tracey A .; Белисль, Клод; Каварабаяси, Ютака; Доначи, Стюарт П .; Пикина, Алла; Гальперин, Михаил Юрьевич (2004-12-28). «Последовательность генома глубоководной γ-протеобактерии Idiomarina loihiensis показывает, что ферментация аминокислот является источником углерода и энергии». Труды Национальной академии наук. 101 (52): 18036–18041. Bibcode:2004PNAS..10118036H. Дои:10.1073 / pnas.0407638102. ЧВК  539801. PMID  15596722.
  4. ^ а б «Расшифровка генома джута». The Daily Star. 17 июня 2010 г.
  5. ^ а б «Максудул Алам объявляет последовательность генома деши джута». Новости Somoy TV.
  6. ^ а б Ислам, Мд Шахидул; Haque, Md Samiul; Ислам, Мохаммад Мойнул; Эмдад, Эмдадул Маннан; Халим, Абдул; Хоссен, Quazi Md Mosaddeque; Hossain, Md Zakir; Ахмед, Борхан; Рахим, Сифатур (19 сентября 2012 г.). «Инструменты для уничтожения: геном одного из самых разрушительных патогенных грибов растений Macrophomina phaseolina». BMC Genomics. 13 (1): 493. Дои:10.1186/1471-2164-13-493. ISSN  1471-2164. ЧВК  3477038. PMID  22992219.
  7. ^ а б Мин, Рэй; Хоу, Шаобинь; Фэн, Юнь; Юй Цинъи; Дионн-Ляпорт, Александр; Пила, Джимми Х .; Сенин, Павел; Ван, Вэй; Ли, Бенджамин В. (апрель 2008 г.). «Проект генома трансгенного тропического фруктового дерева папайи (Carica papaya Linnaeus)». Природа. 452 (7190): 991–996. Bibcode:2008Натура.452..991М. Дои:10.1038 / природа06856. ISSN  0028-0836. ЧВК  2836516. PMID  18432245.
  8. ^ а б Рахман, Ахмад Ямин Абдул; Usharraj, Abhilash O .; Misra, Biswapriya B .; Thottathil, Gincy P .; Джаясекаран, Кандакумар; Фэн, Юнь; Хоу, Шаобинь; Онг, Су Йен; Нг, Фуй Линг (2 февраля 2013 г.). «Проект последовательности генома каучукового дерева Hevea brasiliensis». BMC Genomics. 14 (1): 75. Дои:10.1186/1471-2164-14-75. ISSN  1471-2164. ЧВК  3575267. PMID  23375136.
  9. ^ Хоу, Шаобинь; Макарова, Кира С .; Пила, Джимми HW; Сенин, Павел; Ly, Benjamin V .; Чжоу, Жэминь; Рен, Ян; Ван, Цзяньмэй; Гальперин, Михаил Юрьевич (01.07.2008). «Полная последовательность генома чрезвычайно ацидофильного изолята метанотрофа V4, Methylacidiphilum infernorum, представителя бактериального типа Verrucomicrobia». Биология Директ. 3 (1): 26. Дои:10.1186/1745-6150-3-26. ISSN  1745-6150. ЧВК  2474590. PMID  18593465.
  10. ^ Чен, Инь; Кромби, Эндрю; Рахман, М. Танвир; Дедыш, Светлана Н .; Лизак, Вернер; Стотт, Мэтью Б.; Алам, Максудул; Theisen, Andreas R .; Мюррелл, Дж. Колин (15.07.2010). «Полная последовательность генома аэробного факультативного метанотрофа Methylocella silvestris BL2». Журнал бактериологии. 192 (14): 3840–3841. Дои:10.1128 / JB.00506-10. ISSN  0021-9193. ЧВК  2897342. PMID  20472789.
  11. ^ Пила, Джимми Х. У .; Юрьев, Антон; Канбе, Масаоми; Хоу, Шаобинь; Янг, Аарон Дж .; Айзава, Син-Ити; Алам, Максудул (19 марта 2012 г.). «Полное секвенирование и анализ генома Saprospira grandis str. Lewin, хищной морской бактерии». Стандарты геномных наук. 6 (1): 84–93. Дои:10.4056 / sigs.2445005. ISSN  1944-3277. ЧВК  3368406. PMID  22675601.
  12. ^ Сакафф, Мухд Хайрул Лукман Мухд; Рахман, Ахмад Ямин Абдул; Сайто, Дженнифер А .; Хоу, Шаобинь; Алам, Максудул (01.03.2012). «Полная последовательность генома термофильной бактерии Geobacillus thermoleovorans CCB_US3_UF5». Журнал бактериологии. 194 (5): 1239. Дои:10.1128 / JB.06580-11. ISSN  0021-9193. ЧВК  3294819. PMID  22328744.
  13. ^ Тех, Бенг Сун; Рахман, Ахмад Ямин Абдул; Сайто, Дженнифер А .; Хоу, Шаобинь; Алам, Максудул (01.03.2012). «Полная последовательность генома термофильной бактерии Thermus sp. Штамм CCB_US3_UF1». Журнал бактериологии. 194 (5): 1240. Дои:10.1128 / JB.06589-11. ISSN  0021-9193. ЧВК  3294796. PMID  22328745.
  14. ^ Тех, Бенг Сун; Лау, Ниок-Шон; Нг, Фуй Линг; Абдул Рахман, Ахмад Ямин; Ван, Сюэхуа; Сайто, Дженнифер А .; Хоу, Шаобинь; Тех, Айк-Хонг; Наджимудин, Назалан (2015-10-08). «Полная последовательность генома термофильного Thermus sp. CCB_US3_UF1 из горячего источника в Малайзии». Стандарты геномных наук. 10 (1): 76. Дои:10.1186 / s40793-015-0053-6. ISSN  1944-3277. ЧВК  4599208. PMID  26457128.
  15. ^ Онг, Су Йен; Пратап, Чандра Бхан; Ван, Сюэхуа; Хоу, Шаобинь; Рахман, Ахмад Ямин Абдул; Сайто, Дженнифер А .; Натх, Гопал; Алам, Максудул (15 апреля 2012 г.). «Полная последовательность генома Salmonella enterica subsp. Enterica Serovar Typhi P-stx-12». Журнал бактериологии. 194 (8): 2115–2116. Дои:10.1128 / JB.00121-12. ISSN  0021-9193. ЧВК  3318496. PMID  22461552.
  16. ^ Мчуну, Нокутхула Мир; Пермоул, Куген; Рахман, Ахмад Ямин Абдул; Сайто, Дженнифер А .; Сингх, Сурен; Алам, Максудул (27.06.2013). «Суперпродуцент ксиланазы: последовательность генома термофильного грибка, любящего компост, штамм SSBP Thermomyces lanuginosus». Анонсы генома. 1 (3): e00388–13. Дои:10.1128 / геномA.00388-13. ISSN  2169-8287. ЧВК  3707600. PMID  23788551.
  17. ^ Ван, Сюэхуа; Хоу, Шаобинь; Фан, Нолвенн; Мосс, Дженнифер С. Мэлоун; Доначи, Стюарт П .; Алам, Максудул (25.06.2015). «Проект последовательности генома штамма Pantoea anthophila 11-2 из гиперсоленого озера Лайсан, Гавайи». Анонсы генома. 3 (3): e00321–15. Дои:10.1128 / геномA.00321-15. ISSN  2169-8287. ЧВК  4432323. PMID  25977417.
  18. ^ Вейленман, Донна Бет (19 июня 2019 г.). «Женщина, идущая по железной дороге, сбита, убита поездом». Martinez News-Gazette.
  19. ^ "Биография-Лилиана". Сайты Google.
  20. ^ «Маленькая команда разработчиков UH-генов добивается большого успеха». Звездный бюллетень. 2003.
  21. ^ Боррелл, Брендан (23 апреля 2008 г.). «Проект генома папайи приносит свои плоды». Природа. Дои:10.1038 / новости.2008.772. ISSN  0028-0836.
  22. ^ «Раскрыта последовательность генома джута». Бангладешская лига Авами.
  23. ^ «Последовательность генома джута, расшифрованная бангладешскими учеными». Hindustan Times.
  24. ^ "Ученый Максудул Алам скончался". Протом-Ало. 21 декабря 2014 г.
  25. ^ "Декодер джутового генома Максудул Алам скончался". Daily Star. 20 декабря 2014 г.. Получено 21 декабря, 2014.
  26. ^ «Премия Дня Независимости» (PDF). Правительство Бангладеш. Получено 23 сентября 2016.
  27. ^ Тан, Хайбао; Бауэрс, Джон Э .; Ван, Сиюнь; Мин, Рэй; Алам, Максудул; Патерсон, Эндрю Х. (25 апреля 2008 г.). «Синтения и коллинеарность в геномах растений». Наука. 320 (5875): 486–488. Bibcode:2008Научный ... 320..486T. Дои:10.1126 / science.1153917. ISSN  0036-8075. PMID  18436778.
  28. ^ Freitas, Tracey Allen K .; Сайто, Дженнифер А .; Ван, Сюэхуа; Хоу, Шаобинь; Алам, Максудул (2008), "Протоглобин и сенсоры, связанные с глобином", Наименьшие биомолекулы: диатомия и их взаимодействие с гемовыми белками, Elsevier, стр. 175–202, Дои:10.1016 / b978-044452839-1.50008-5, ISBN  9780444528391