MYLIP - MYLIP

MYLIP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2YHN, 2YHO
Идентификаторы
Псевдонимы	MYLIP, IDOL, MIR, белок, взаимодействующий с регуляторной легкой цепью миозина
Внешние идентификаторы	OMIM: 610082 MGI: 2388271 ГомолоГен: 8309 Генные карты: MYLIP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.3 Начинать 16,129,086 бп[1] Конец 16,148,248 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A5 Начинать 45,389,742 бп[2] Конец 45,412,022 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • связывание с белками цитоскелета • GO: 0001948 связывание с белками • активность убиквитин-протеинтрансферазы • структурная составляющая цитоскелета • трансферазная активность • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • клеточная мембрана • внутриклеточный • цитозоль • цитоскелет Биологический процесс • положительное регулирование катаболического процесса белков • отрицательная регуляция клиренса частиц липопротеинов низкой плотности • регуляция катаболического процесса рецепторов липопротеиновых частиц низкой плотности • развитие нервной системы • дестабилизация белков • убиквитинирование белков • гомеостаз холестерина • полиубиквитинирование белков • организация структуры актомиозина • катаболический процесс рецептора частиц липопротеинов низкой плотности • негативная регуляция развития проекции нейронов • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • организация цитоскелета Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	29116	218203
Ансамбль	ENSG00000007944	ENSMUSG00000038175
UniProt	Q8WY64	Q8BM54
RefSeq (мРНК)	NM_013262	NM_153789
RefSeq (белок)	NP_037394	NP_722484
Расположение (UCSC)	Chr 6: 16.13 - 16.15 Мб	Chr 13: 45.39 - 45.41 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, взаимодействующий с регулирующей легкой цепью миозина, также известный как MYLIP, это белок что у людей кодируется MYLIP ген.^[5]

MYLIP также известен как IDOL «Индуцибельный деградиатор рецептора ЛПНП» на основании его участия в регуляции холестерина.^[6][7] Экспрессия IDOL индуцируется стерол-активированным Х-рецептор печени.

Повышенная деградация рецепторного белка ЛПНП (IDOL) представляет собой убиквитинлигазу, которая убихинирует рецепторы ЛПНП в эндосомах и направляет рецепторы в лизосомный компартмент для деградации. IDOL транскрипционно активируется с помощью LXR / RXR в ответ на увеличение внутриклеточного холестерина.^[8] Фармакологическое ингибирование IDOL может снизить уровень холестерина ЛПНП в плазме за счет увеличения плотности рецепторов ЛПНП в плазме.

Функция

В Семейство белков ERM члены Эзрин, радиксин, и Moesin находятся цитоскелет эффекторные белки, связывающие актин с мембраносвязанными белками на поверхности клетки. Белок, взаимодействующий с регуляторной легкой цепью миозина (MYLIP), представляет собой новый ERM-подобный белок, который взаимодействует с регуляторной легкой цепью миозина и ингибирует нейрит нарост.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000007944 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038175 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: белок, взаимодействующий с регуляторной легкой цепью миозина MYLIP».
6. Зелцер Н., Хонг С., Бояджян Р., Тонтоноз П. (июль 2009 г.). "LXR регулирует поглощение холестерина посредством идол-зависимого убиквитинирования рецептора ЛПНП". Наука. 325 (5936): 100–4. Bibcode:2009Научный ... 325..100Z. Дои:10.1126 / science.1168974. ЧВК  2777523. PMID  19520913.
7. Линдхольм Д., Борнхаузер BC, Корхонен Л. (ноябрь 2009 г.). «Mylip превращает идол в регуляцию рецептора ЛПНП». Клетка. Мол. Life Sci. 66 (21): 3399–402. Дои:10.1007 / s00018-009-0127-у. PMID  19688294. S2CID  34153384.
8. Савамура, Т. (2009). "Новый идол для снижения холестерина?". Clin. Chem. 55 (12): 2082–2084. Дои:10.1373 / Clinchem.2009.134023. PMID  19833835.

дальнейшее чтение

• Olsson PA, Korhonen L, Mercer EA, Lindholm D (2000). «MIR - это новый ERM-подобный белок, который взаимодействует с регуляторной легкой цепью миозина и ингибирует рост нейритов». J. Biol. Chem. 274 (51): 36288–92. Дои:10.1074 / jbc.274.51.36288. PMID  10593918.
• Чжан К.Х., Е М., Ву XY и др. (2001). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Olsson PA, Bornhauser BC, Korhonen L, Lindholm D (2001). «Нейрональная экспрессия ERM-подобного белка MIR в головном мозге крысы и его локализация в хромосоме 6 человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 279 (3): 879–83. Дои:10.1006 / bbrc.2000.4028. PMID  11162443.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Борнхаузер BC, Olsson PA, Lindholm D (2003). «MSAP - это новый белок, взаимодействующий с MIR, который усиливает рост нейритов и увеличивает регуляторную легкую цепь миозина». J. Biol. Chem. 278 (37): 35412–20. Дои:10.1074 / jbc.M306271200. PMID  12826659.
• Борнхаузер BC, Йоханссон C, Линдхольм D (2003). «Функциональная активность и клеточная локализация доменов эзрина, радиксина, моэзина (ERM) и RING цинковых пальцев в MIR». FEBS Lett. 553 (1–2): 195–9. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 01010-X. PMID  14550572. S2CID  25599548.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ван Д., Гонг И, Цинь В. и др. (2004). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (44): 15724–9. Bibcode:2004PNAS..10115724W. Дои:10.1073 / pnas.0404089101. ЧВК  524842. PMID  15498874.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Омура-Хосино М., Мацуки Ю., Аоки М. и др. (2006). «Ингибирование экспрессии MHC класса II и иммунных ответов c-MIR». J. Immunol. 177 (1): 341–54. Дои:10.4049 / jimmunol.177.1.341. PMID  16785530.