MUPCDH - MUPCDH

CDHR5
Идентификаторы
Псевдонимы	CDHR5, MU-PCDH, MUCDHL, MUPCDH, MLPCDH, член семейства 5, связанный с кадгерином
Внешние идентификаторы	OMIM: 606839 MGI: 1919290 ГомолоГен: 69345 Генные карты: CDHR5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11p15.5 Начинать 616,577 бп[1] Конец 626,078 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F5 Начинать 141,269,083 бп[2] Конец 141,276,786 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • связывание бета-катенина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание молекул клеточной адгезии Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • покрывающий компонент плазматической мембраны • щеточная мембрана • яма, покрытая клатрином • клеточная мембрана • внеклеточная экзосома • мембрана • проекция клетки • мембрана микроворсинок • апикальная плазматическая мембрана Биологический процесс • клеточная адгезия • регулировка длины микроворсинок • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны • межмикровиллярная адгезия • дифференциация клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	53841	72040
Ансамбль	ENSG00000099834 ENSG00000273572	ENSMUSG00000025497
UniProt	Q9HBB8	Q8VHF2
RefSeq (мРНК)	NM_001171968 NM_017717 NM_021924 NM_031264 NM_031265	NM_001114322 NM_028069
RefSeq (белок)	NP_001165439 NP_068743 NP_112554	NP_001107794 NP_082345
Расположение (UCSC)	Chr 11: 0,62 - 0,63 Мб	Chr 7: 141.27 - 141.28 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Муцин и кадгерин-подобный белок это белок что у людей кодируется MUPCDH ген.^[5][6][7]

Этот ген представляет собой новый муциноподобный ген, который является членом суперсемейства кадгеринов. Кодируя неполиморфные тандемные повторы, богатые пролином, серином и треонином, аналогичные белкам муцина, ген также содержит последовательность, кодирующую кальций-связывающие мотивы, обнаруженные во всех кадгеринах. Роль гибридной внеклеточной области и специфическая функция этого белка еще не определены. Был идентифицирован альтернативный сплайсинг с наблюдаемыми вариациями, приводящими к наличию или отсутствию доменов. Кроме того, сплайсинг происходит в 5'-UTR, но транскрипты, включающие эти варианты, полностью не описаны.^[7]

Рекомендации

1. ENSG00000273572 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000099834, ENSG00000273572 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000025497 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пэрис MJ, Williams BR (январь 2001 г.). «Характеристика контига размером 500 т.п.н., охватывающего область между c-Ha-Ras и MUC2 на хромосоме 11p15.5». Геномика. 69 (2): 196–202. Дои:10.1006 / geno.2000.6339. PMID  11031102.
6. Голдберг М., Пешковский С., Шифтех А., Аль-Авкати К. (сентябрь 2000 г.). «mu-Protocadherin, новый протокадгерин, регулируемый в процессе развития, с муциноподобными доменами». J Biol Chem. 275 (32): 24622–9. Дои:10.1074 / jbc.M000234200. PMID  10801787. S2CID  42493271.
7. «Энтрез Ген: муцин MUCDHL и подобный кадгерину».

дальнейшее чтение

• Яги Т., Такейчи М. (2000). «Гены суперсемейства кадгеринов: функции, геномная организация и неврологическое разнообразие». Genes Dev. 14 (10): 1169–80. Дои:10.1101 / gad.14.10.1169 (неактивно 11.10.2020). PMID  10817752.
• Голдберг М., Вэй М., Тайко Б. и др. (2002). «Идентификация и анализ экспрессии гена мю-протокадгерина человека в почках плода и взрослого человека». Являюсь. J. Physiol. Почечная физиология. 283 (3): F454–63. Дои:10.1152 / айпренал.00012.2002. PMID  12167596. S2CID  615952.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Голдберг М., Вэй М., Юань Л. и др. (2003). «Двуаллельная экспрессия HRAS и MUCDHL у человека и мыши». Гм. Genet. 112 (4): 334–42. Дои:10.1007 / s00439-003-0907-7. PMID  12589428. S2CID  1143721.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабное усилие по идентификации новых секретируемых человеком и трансмембранных белков: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039. S2CID  21903526.
• Лю Т., Цянь В.Дж., Гриценко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии». J. Proteome Res. 4 (6): 2070–80. Дои:10.1021 / pr0502065. ЧВК  1850943. PMID  16335952.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.