MICAL1 - MICAL1

MICAL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WYL, 2CO8
Идентификаторы
Псевдонимы	MICAL1, MICAL, MICAL-1, NICAL, монооксигеназа, ассоциированная с микротрубочками, кальпонин и домен LIM, содержащий 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607129 MGI: 2385847 ГомолоГен: 11246 Генные карты: MICAL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q21 Начинать 109,444,062 бп[1] Конец 109,465,968 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B2 Начинать 41,476,314 бп[2] Конец 41,487,032 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Привязка домена SH3 • оксидоредуктазная активность • связывание актина • оксидоредуктазная активность, действующая на парные доноры, с включением или восстановлением молекулярного кислорода, НАД (Ф) Н в качестве одного донора и включением одного атома кислорода • Привязка FAD • Связывание Rab GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание протеинкиназы • монооксигеназная активность • НАД (Ф) Н оксидазная активность • связывание актиновой нити Сотовый компонент • цитоплазма • цитоскелет • промежуточная нить • расширение мшистых волокон гиппокампа • цитозоль • середина тела • межклеточный мостик • клеточная мембрана • актиновый цитоскелет Биологический процесс • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • деполимеризация актиновых филаментов • окисление серы • отрицательная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • отрицательная регуляция апоптотического процесса • окислительно-восстановительный процесс • организация цитоскелета • преобразование сигнала • регуляция регулируемого секреторного пути • коагуляция крови Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64780	171580
Ансамбль	ENSG00000135596	ENSMUSG00000019823
UniProt	Q8TDZ2	Q8VDP3
RefSeq (мРНК)	NM_022765 NM_001159291 NM_001286613	NM_001164433 NM_138315 NM_001358838 NM_001358839
RefSeq (белок)	NP_001152763 NP_001273542 NP_073602	NP_001157905 NP_612188 NP_001345767 NP_001345768
Расположение (UCSC)	Chr 6: 109.44 - 109.47 Мб	Chr 10: 41.48 - 41.49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

NEDD9-взаимодействующий белок с гомологией кальпонина и LIM-доменами это белок что у людей кодируется MICAL1 ген.^[5][6]

Взаимодействия

MICAL1 был показан взаимодействовать с NEDD9^[5] и RAB1A.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135596 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019823 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Сузуки Т., Накамото Т., Огава С., Со С., Мацумура Т., Татибана К., Моримото С., Хираи Х. (апрель 2002 г.). «MICAL, новая взаимодействующая молекула CasL, связывается с виментином». J Biol Chem. 277 (17): 14933–41. Дои:10.1074 / jbc.M111842200. PMID  11827972.
6. «Ген Entrez: моноксигеназа, связанная с микротрубочками MICAL1, кальпонин и LIM-домен, содержащий 1».
7. Вайде, Томас; Тойбер Юлия; Байер Майкл; Барнеков Анжелика (июнь 2003 г.). «Изоформы MICAL-1, новые взаимодействующие с rab1 белки». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. Соединенные Штаты. 306 (1): 79–86. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00918-5. ISSN  0006-291X. PMID  12788069.

дальнейшее чтение

• Ивата С., Охаши Ю., Камигучи К., Моримото С. (2000). «Бета-1-интегрин-опосредованная передача сигналов в Т-лимфоцитах». J. Dermatol. Наука. 23 (2): 75–86. Дои:10.1016 / S0923-1811 (99) 00096-1. PMID  10808124.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хаттори А., Окумура К., Нагасе Т. и др. (2001). «Характеристика длинных клонов кДНК из селезенки взрослого человека». ДНК Res. 7 (6): 357–66. Дои:10.1093 / dnares / 7.6.357. PMID  11214971.
• Терман Дж. Р., Мао Т., Пастеркамп Р. Дж. И др. (2002). «MICAL, семейство консервативных флавопротеин-оксидоредуктаз, функционируют в опосредованном плексином отталкивании аксонов». Клетка. 109 (7): 887–900. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00794-8. PMID  12110185.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Вайде Т., Тойбер Дж, Байер М., Барнеков А. (2003). «Изоформы MICAL-1, новые взаимодействующие с rab1 белки». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 306 (1): 79–86. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00918-5. PMID  12788069.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Фишер Дж, Вайде Т., Барнеков А. (2005). «Белки MICAL и rab1: возможная связь с цитоскелетом?». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 328 (2): 415–23. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.12.182. PMID  15694364.
• Байер М., Фишер Дж., Кремерскотен Дж. И др. (2006). «Идентификация и характеристика ипорина как нового партнера по взаимодействию для rab1». BMC Cell Biol. 6 (1): 15. Дои:10.1186/1471-2121-6-15. ЧВК  1079803. PMID  15796781.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Джин Х, Чжан Дж, Дай Х и др. (2007). «Исследование четырех кооперативных разворачивающихся единиц, существующих в домене MICAL-1 CH». Биофиз. Chem. 129 (2–3): 269–78. Дои:10.1016 / j.bpc.2007.06.008. PMID  17662518.