Псевдоузлы дальнего действия - Long range pseudoknots

Псевдоузел дальнего действия
Вторичная структура дальнего псевдоузла
Идентификаторы
Рфам	RF01086
Прочие данные
РНК тип	Снг
Домен (ы)	Эукариот Прокариот
PDB структуры	PDBe

А псевдоузел дальнего действия это псевдоузел содержащий область длинной петли, и может быть механизмом управления трансляцией.

Считается, что псевдоузел с большим радиусом действия негативно регулирует трансляцию оперона IF3-L35-L20 в Кишечная палочка. Этот оперон кодирует фактор инициации трансляции IF-3 и рибосомные белки L35 и L20. В этом примере взаимодействие РНК-РНК происходит между нуклеотиды разделены областью петли из 300 нуклеотидов.^[1]

Считается также, что псевдоузел дальнего действия необходим для активности Нейроспора ПРОТИВ рибозим.^[2]

Рекомендации

1. Кьяруттини С., Милет М., Спрингер М. (август 1996 г.). «Дальнодействующее взаимодействие РНК-РНК образует псевдоузел, необходимый для контроля трансляции оперона рибосомного белка IF3-L35-L20 в Escherichia coli». Журнал EMBO. 15 (16): 4402–4413. ЧВК  452164. PMID  8861967.
2. Растоги Т., Битти Т.Л., Олив Дж. Э., Коллинз Р.А. (июнь 1996 г.). «Для активности рибозима Neurospora VS необходим псевдоузел дальнего действия». Журнал EMBO. 15 (11): 2820–2825. ЧВК  450219. PMID  8654379.

внешняя ссылка

• Запись rfam для псевдоузлов дальнего действия^{[постоянная мертвая ссылка ]}