Список самонаводящихся сайтов разрезания эндонуклеаз - List of homing endonuclease cutting sites

Легенда о азотистые основания
КодНуклеотид представлен
ААденин (А)
CЦитозин (С)
граммГуанин (ГРАММ)
ТТимин (Т)
NA, C, G или T
MА или С
рA или G
WА или Т
YC или T
SC или G
KG или T
ЧАСA, C или T
BC, G или T
VA, C или G
DA, G или T

Самонаводящиеся эндонуклеазы представляют собой особый тип рестрикционные ферменты закодировано интроны или же интеины. Они действуют на сотовые ДНК клетки, которая их синтезирует; если быть точным, наоборот аллель из ген которые их кодируют.[1]

Дальнейшая информация: Самонаводящаяся эндонуклеаза.

Самонаводящиеся эндонуклеазы

В список включены некоторые из наиболее изученных примеров. Были подробно описаны следующие концепции:

ФерментSFКод PDBИсточникDSCLПоследовательность распознаванияРезать
И-АНИИ[2]H11П8К​Aspergillus nidulansEмито 5 'TTGAGGAGGTTTCTCTGTAAATAA
3 'AACTCCTCCAAAGAGACATTTATT 		5 '--- TTGAGGAGGTTTC   TCTGTAAATAA --- 3 '
3 '--- AACTCCTCC   AAAGAGACATTTATT --- 5 '
I-CeuI[3][4][5][6]H12EX5​Chlamydomonas eugametosEхлор 5 'TAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGA
3 'ATTGATATTGCCAGGATTCCATCGCT 		5 '--- TAACTATAACGGTCCTAA   GGTAGCGA --- 3 '
3 '--- ATTGATATTGCCAG   GATTCCATCGCT --- 5 '
И-Чуй[7][8]H1Q32001Chlamydomonas humicolaEхлор 5 'GAAGGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATC
3 'CTTCCAAACCGTGGAGCTACAGCCGAGTAG		 5 '--- GAAGGTTTGGCACCTCG   ATGTCGGCTCATC --- 3 '
3 '--- CTTCCAAACCGTG   GAGCTACAGCCGAGTAG --- 5 '
I-CpaI[8][9]H1Q39562Хламидомонада паллидостигматнаяEхлор 5 'CGATCCTAAGGTAGCGAAATTCA
3 'GCTAGGATTCCATCGCTTTAAGT 		5 '--- CGATCCTAAGGTAGCGAA   ATTCA --- 3 '
3 '--- GCTAGGATTCCATC   GCTTTAAGT --- 5 '
I-CpaII[10]H1Q39559Хламидомонада паллидостигматнаяEхлор 5 'CCCGGCTAACTCTGTGCCAG
3 'GGGCCGATTGAGACACGGTC 		5 '--- CCCGGCTAACTC   TGTGCCAG --- 3 '
5 '--- GGGCCGAT   TGAGACACGGTC --- 3 '
I-CreI[11]H11BP7​Chlamydomonas reinhardtiiEхлор 5 'CTGGGTTCAAAACGTCGTGAGACAGTTTGG
3 'GACCCAAGTTTTGCAGCACTCTGTCAAACC 		5 '--- CTGGGTTCAAAACGTCGTGA   GACAGTTTGG --- 3 '
3 '--- GACCCAAGTTTTGCAG   CACTCTGTCAAACC --- 5 '
I-DmoIH11B24​Desulfurococcus mobilisАchrm 5 'ATGCCTTGCCGGGTAAGTTCCGGCGCGCAT
3 'TACGGAACGGCCCATTCAAGGCCGCGCGTA 		5 '--- ATGCCTTGCCGGGTAA   GTTCCGGCGCGCAT --- 3 '
3 '--- TACGGAACGGCC   CATTCAAGGCCGCGCGTA --- 5 '
H-DreI[12]H11MOW​Гибрид: I-DmoI и I-CreIАE 5 'CAAAACGTCGTAAGTTCCGGCGCG
3 'GTTTTGCAGCATTCAAGGCCGCGC 		5 '--- CAAAACGTCGTAA   GTTCCGGCGCG --- 3 '
3 '--- GTTTTGCAG   CATTCAAGGCCGCGC --- 5 '
I-HmuI[13][14]H31U3E​Bacillus subtilis фаг SP01Bфаг 5 'AGTAATGAGCCTAACGCTCAGCAA
3 'TCATTACTCGGATTGCGAGTCGTT		  Никелевая эндонуклеаза: *
  3 '--- TCATTACTCGGATTGC   GAGTCGTT --- 5 '
I-HmuII[14][15]H3Q38137Bacillus subtilis фаг SP82Bфаг 5 'AGTAATGAGCCTAACGCTCAACAA
3 'TCATTACTCGGATTGCGAGTTGTT		  Никелевая эндонуклеаза: *
  3 '--- TCATTACTCGGATTGCGAGTTGTTN35   NNNN --- 5 '
I-LlaI[16][17]H3P0A3U1Lactococcus lactisBchrm 5 'CACATCCATAACCATATCATTTTT
3 'GTGTAGGTATTGGTATAGTAAAAA 		5 '--- CACATCCATAA   CCATATCATTTTT --- 3 '
3 '--- GTGTAGGTATTGGTATAGTAA   AAA --- 5 '
I-MsoIH11M5X​Мономастикс sp.E 5 'CTGGGTTCAAAACGTCGTGAGACAGTTTGG
3 'GACCCAAGTTTTGCAGCACTCTGTCAAACC 		5 '--- CTGGGTTCAAAACGTCGTGA   GACAGTTTGG --- 3 '
3 '--- GACCCAAGTTTTGCAG   CACTCTGTCAAACC --- 5 '
PI-PfuIH11DQ3​Pyrococcus furiosus Vc1А 5 'GAAGATGGGAGGAGGGACCGGACTCAACTT
3 'CTTCTACCCTCCTCCCTGGCCTGAGTTGAA 		5 '--- GAAGATGGGAGGAGGG   ACCGGACTCAACTT --- 3 '
3 '--- CTTCTACCCTCC   TCCCTGGCCTGAGTTGAA --- 5 '
ПИ-ПкоИИH12CW7​Pyrococcus kodakarensis БАД-918А 5 'CAGTACTACGGTTAC
3 'GTCATGATGCCAATG 		5 '--- CAGTACTACG  GTTAC --- 3 '
3 '--- GTCATG  ATGCCAATG --- 5 '
I-PorI[18][19]H3Pyrobaculum organotrophumАchrm 5 'GCGAGCCCGTAAGGGTGTGTACGGG
3 'CGCTCGGGCATTCCCACACATGCCC 		5 '--- GCGAGCCCGTAAGGGT   GTGTACGGG --- 3 '
3 '--- CGCTCGGGCATT   CCCACACATGCCC --- 5 '
I-PpoIH41EVX​Physarum polycephalumEплазмида 5 'TAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAAT
3 'ATTGATACTGAGAGAATTCCATCGGTTTA		 5 '--- TAACTATGACTCTCTTAA   GGTAGCCAAAT --- 3 '
3 '--- ATTGATACTGAGAG   AATTCCATCGGTTTA --- 5 '
PI-PspIH1Q51334Пирококк sp.Аchrm 5 'TGGCAAACAGCTATTATGGGTATTATGGGT
3 'ACCGTTTGTCGATAATACCCATAATACCCA 		5 '--- TGGCAAACAGCTATTAT   GGGTATTATGGGT --- 3 '
3 '--- ACCGTTTGTCGAT   AATACCCATAATACCCA --- 5 '
I-ScaI[20][21]H1P03873Saccharomyces capensisEмито 5 'TGTCACATTGAGGTGCACTAGTTATTAC
3 'ACAGTGTAACTCCACGTGATCAATAATG 		5 '--- TGTCACATTGAGGTGCACT   АГТТАТТАК --- 3 '
3 '--- ACAGTGTAACTCCAC   GTGATCAATAATG --- 5 '
I-SceI[4][5]H11R7M​Saccharomyces cerevisiaeEмито 5 'AGTTACGCTAGGGATAACAGGGTAATATAG
3 'TCAATGCGATCCCTATTGTCCCATTATATC 		5 '--- AGTTACGCTAGGGATAA   CAGGGTAATATAG --- 3 '
3 '--- TCAATGCGATCCC   TATTGTCCCATTATATC --- 5 '
PI-SceI[22][23]H11VDE​Saccharomyces cerevisiaeE 5 'ATCTATGTCGGGTGCGGAGAAAGAGGTAATGAAATGGCA
3 'TAGATACAGCCCACGCCTCTTTCTCCATTACTTTACCGT 		5 '--- ATCTATGTCGGGTGC   GGAGAAAGAGGTAATGAAATGGCA --- 3 '
3 '--- TAGATACAGCC   CACGCCTCTTTCTCCATTACTTTACCGT --- 5 '
I-Сцена II[24][25][26]H1Saccharomyces cerevisiaeEмито 5 'TTTTGATTCTTTGGTCACCCTGAAGTATA
3 'AAAACTAAGAAACCAGTGGGACTTCATAT 		5 '--- TTTTGATTCTTTGGTCACCC   ТГААГТАТА --- 3 '
3 '--- AAAACTAAGAAACCAG   TGGGACTTCATAT --- 5 '
I-SecIII[24][27][28]H1Saccharomyces cerevisiaeEмито 5 'ATTGGAGGTTTTGGTAACTATTTATTACC
3 'TAACCTCCAAAACCATTGATAAATAATGG 		5 '--- ATTGGAGGTTTTGGTAAC   TATTTATTACC --- 3 '
3 '--- TAACCTCCAAAACC   ATTGATAAATAATGG --- 5 '
I-SceIV[24][29][30]H1Saccharomyces cerevisiaeEмито 5 'TCTTTTCTCTTGATTAGCCCTAATCTACG
3 'AGAAAAGAGAACTAATCGGGATTAGATGC 		5 '--- TCTTTTCTCTTGATTA   GCCCTAATCTACG --- 3 '
3 '--- AGAAAAGAGAAC   TAATCGGGATTAGATGC --- 5 '
I-SceV[24][31]H3Saccharomyces cerevisiaeEмито 5 'AATAATTTTCTTCTTAGTAATGCC
3 'TTATTAAAAGAAGAATCATTACGG 		5 '--- AATAATTTTCT   TCTTAGTAATGCC --- 3 '
3 '--- TTATTAAAAGAAGAATCATTA   CGG --- 5 '
I-SceVI[24][32]H3Saccharomyces cerevisiaeEмито 5 'GTTATTTAATGTTTTAGTAGTTGG
3 'CAATAAATTACAAAATCATCAACC 		5 '--- GTTATTTAATG   TTTTAGTAGTTGG --- 3 '
3 '--- CAATAAATTACAAAATCATCA   АКК --- 5 '
I-сценаVII[20]H1Saccharomyces cerevisiaeEмито 5 'TGTCACATTGAGGTGCACTAGTTATTAC
3 'ACAGTGTAACTCCACGTGATCAATAATG		  Неизвестный **
I-Ssp6803IH52OST​Synechocystis sp. PCC 6803B 5 'GTCGGGCTCATAACCCGAA
3 'CAGCCCGAGTATTGGGCTT 		5 '--- GTCGGGCT   CATAACCCGAA --- 3 '
3 '--- CAGCCCGAGTA   TTGGGCTT --- 5 '
I-TevI[33][34][35]H21I3J​кишечная палочка фаг Т4Bфаг 5 'AGTGGTATCAACGCTCAGTAGATG
3 'TCACCATAGT TGCGAGTCATCTAC 		5 '--- AGTGGTATCAAC   GCTCAGTAGATG --- 3 '
3 '--- TCACCATAGT   TGCGAGTCATCTAC --- 5 '
I-TevII[33][36]H2кишечная палочка фаг Т4Bфаг 5 'GCTTATGAGTATGAAGTGAACACGTTATTC
3 'CGAATACTCATACTTCACTTGTGCAATAAG 		5 '--- GCTTATGAGTATGAAGTGAACACGT   TATTC --- 3 '
3 '--- CGAATACTCATACTTCACTTGTG   CAATAAG --- 5 '
I-TevIII[37]H3кишечная палочка фаг RB3Bфаг 5 'TATGTATCTTTTGCGTGTACCTTTAACTTC
3 'ATACATAGAAAACGCACATGGAAATTGAAG 		5 '--- т   ATGTATCTTTTGCGTGTACCTTTAACTTC --- 3 '
3 '--- В   ACATAGAAAACGCACATGGAAATTGAAG --- 5 '
PI-TliI[38][39]H1Термококк литоралисАchrm 5 'TAYGCNGAYACNGACGGYTTYT
3 'ATRCGNCTRTGNCTGCCTAARA 		5 '--- TAYGCNGAYACNGACGG   YTTYT --- 3 '
3 '--- ATRCGNCTRTGNC   TGCCTAARA --- 5 '
PI-TliII[22][39][40]H1Термококк литоралисАchrm 5 'AAATTGCTTGCAAACAGCTATTACGGCTAT
3 'TTTAACGAACGTTTGTCGATAATGCCGATA		  Неизвестный **
I-Tsp061IH12DCH​Термопротеус sp. IC-061А 5 'CTTCAGTATGCCCCGAAAC
3 'GAAGTCATACGGGGCTTTG 		5 '--- CTTCAGTAT   GCCCCGAAAC --- 3 '
3 '--- GAAGT   CATACGGGGCTTTG --- 5 '
I-Vdi141IH13Э54​Vulcanisaeta Distributa IC-141А 5 'CCTGACTCTCTTAAGGTAGCCAAA
3 'GGACTGAGAGAATTCCATCGGTTT 		5 '--- CCTGACTCTCTTAA   GGTAGCCAAA --- 3 '
3 '--- GGACTGAG   AGAATTCCATCGGTTT --- 5 '

*: Никелевая эндонуклеаза: Эти ферменты разрезают только одну цепь ДНК, не затрагивая другую.
**: Неизвестный участок резки: Исследователи еще не смогли определить точное место разрезания этих ферментов.

Смотрите также

Источники информации

Базы данных и списки рестрикционных ферментов:

  • Очень обширная база данных рестрикционных ферментов, поддерживаемая New England Biolabs ©. Он включает в себя всю биологическую, структурную, кинетическую и коммерческую информацию о тысячах ферментов. Также включает соответствующую литературу по каждой молекуле: Робертс Р.Дж., Винце Т., Посфаи Дж., Маселис Д. "REBASE". Получено 2010-01-07. База данных рестрикционных ферментов.
  • База данных интеинов, размещенная в New England Biolabs ©. Perler FB. "InBase". Архивировано из оригинал на 2010-08-02. Получено 2010-02-05. База данных и реестр Intein.[41]
  • Подробная информация для биохимических экспериментов: «Поиск ферментов». Архивировано из оригинал на 2010-01-08. Получено 2010-01-07. New England Biolabs © средство поиска ферментов.
  • Алфавитный список ферментов и сайтов их рестрикции: «Веб-страница GenScript © Restriction Enzyme». Архивировано из оригинал на 2009-07-04. Получено 2010-01-07.
  • Общая информация о сайтах рестрикции и биохимических условиях рестрикционных реакций: «Ресурс рестрикционных ферментов». Архивировано из оригинал на 2002-02-03. Получено 2010-01-07. Веб-страница рестрикционных ферментов Promega ©.

Базы данных белков:

  • База данных белковых структур, решенная с атомным разрешением: «PDB». Исследовательское сотрудничество по структурной биоинформатике (RCSB). Архивировано из оригинал на 2015-04-07. Получено 2010-01-25. Банк данных белков RCSB.
  • Базы данных белков: Швейцарский институт биоинформатики (SIB); Европейский институт биоинформатики (EBI). "UniProtKB / Swiss-Prot & TrEMBL". Получено 2010-01-25. Swiss-Prot - это тщательно подобранная база данных последовательностей белков, которая стремится обеспечить высокий уровень аннотации (например, описание функции белка, его доменной структуры, посттрансляционные модификации, варианты и т. д.), минимальный уровень избыточности и высокий уровень интеграции с другими базами данных. TrEMBL - это компьютерно-аннотированное приложение Swiss-Prot, которое содержит все переводы EMBL записи нуклеотидных последовательностей еще не интегрированы в Swiss-Prot.

Примечания и ссылки

  1. ^ Ламбовиц AM, Белфорт М (1993). «Интроны как мобильные генетические элементы». Анну Рев Биохим. 62: 587–622. Дои:10.1146 / annurev.bi.62.070193.003103. PMID  8352597.
  2. ^ Наито Т., Кусано К., Кобаяши И. (февраль 1995 г.). «Эгоистичное поведение систем ограничения-модификации». Наука. 267 (5199): 897–99. Bibcode:1995Научный ... 267..897N. Дои:10.1126 / science.7846533. PMID  7846533.
  3. ^ Жакье А., Дужон Б. (июнь 1985 г.). «Белок, кодируемый интроном, активен в процессе преобразования гена, который распространяет интрон в митохондриальный ген». Клетка. 41 (2): 383–94. Дои:10.1016 / S0092-8674 (85) 80011-8. PMID  3886163.
  4. ^ а б Готье А., Турмель М., Лемье С. (январь 1991 г.). «Интрон группы I в гене рРНК большой субъединицы хлоропласта Chlamydomonas eugametos кодирует двухцепочечную эндонуклеазу, которая расщепляет хоминг-сайт этого интрона». Курр Жене. 19 (1): 43–47. Дои:10.1007 / BF00362086. PMID  2036685.
  5. ^ а б Маршалл П., Лемье С. (август 1991 г.). «Паттерн расщепления самонаводящейся эндонуклеазы, кодируемой пятым интроном в гене, кодирующем рРНК большой субъединицы хлоропласта Chlamydomonas eugametos». Ген. 104 (2): 241–5. Дои:10.1016 / 0378-1119 (91) 90256-Б. PMID  1916294.
  6. ^ Turmel M, Boulanger J, Schnare MN, Gray MW, Lemieux C (март 1991 г.). «Шесть интронов группы I и три внутренних транскрибируемых спейсера в гене большой субъединицы рибосомной РНК хлоропласта зеленой водоросли Chlamydomonas eugametos». Дж Мол Биол. 218 (2): 293–311. Дои:10.1016 / 0022-2836 (91) 90713-Г. PMID  1849178.
  7. ^ Côté V, Mercier JP, Lemieux C, Turmel M (июль 1993 г.). «Единственный интрон группы I в гене rrnL хлоропласта Chlamydomonas humicola кодирует сайт-специфичную эндонуклеазу ДНК (I-ChuI)». Ген. 129 (1): 69–76. Дои:10.1016/0378-1119(93)90697-2. PMID  8335261.
  8. ^ а б Turmel M, Gutell RR, Mercier JP, Otis C, Lemieux C (июль 1993 г.). «Анализ гена рибосомной РНК большой субъединицы хлоропласта из 17 таксонов Chlamydomonas. Три внутренних транскрибируемых спейсера и 12 сайтов вставки интронов группы I». Дж Мол Биол. 232 (2): 446–67. Дои:10.1006 / jmbi.1993.1402. PMID  8393936.
  9. ^ Turmel M, Côté V, Otis C, Mercier JP, Gray MW, Lonergan KM, Lemieux C (июль 1995 г.). «Эволюционный перенос интронов группы I, содержащих ORF, между различными субклеточными компартментами (хлоропластом и митохондрией)». Мол Биол Эвол. 12 (4): 533–45. Дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a040234. PMID  7659010.
  10. ^ Turmel M, Mercier JP, Côté V, Otis C, Lemieux C (июль 1995 г.). «Сайт-специфическая ДНК-эндонуклеаза, кодируемая интроном группы I в гене малой субъединицы рРНК хлоропласта Chlamydomonas pallidostigmatica, вводит однонитевой разрыв при низких концентрациях Mg2 +». Нуклеиновые кислоты Res. 23 (13): 2519–25. Дои:10.1093 / nar / 23.13.2519. ЧВК  307060. PMID  7630730.
  11. ^ Юрица М.С., Моннат Р.Дж., Стоддард Б.Л. (октябрь 1998 г.). «Распознавание и расщепление ДНК эндонуклеазой LAGLIDADG самонаводящейся I-CreI». Мол. Клетка. 2 (4): 469–76. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80146-X. PMID  9809068.
  12. ^ Chevalier BS, Kortemme T, Chadsey MS, Baker D, Monnat RJ, Stoddard BL (октябрь 2002 г.). «Дизайн, активность и структура высокоспецифической искусственной эндонуклеазы». Мол. Клетка. 10 (4): 895–905. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00690-1. PMID  12419232.
  13. ^ Goodrich-Blair H, Scarlato V, Gott JM, Xu M, Shub DA (октябрь 1990 г.). «Самосплайсинговый интрон группы I в гене ДНК-полимеразы бактериофага Bacillus subtilis SPO1». Клетка. 63 (2): 417–24. Дои:10.1016 / 0092-8674 (90) 90174-Д. PMID  2119891.
  14. ^ а б Гудрич-Блэр Х., Шуб Д.А. (январь 1996 г.). «За пределами хоминга: конкуренция между интронными эндонуклеазами дает селективное преимущество фланкирующим генетическим маркерам». Клетка. 84 (2): 211–21. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80976-9. PMID  8565067.
  15. ^ Гудрич-Блэр Х., Шуб Д.А. (сентябрь 1994 г.). «Гены ДНК-полимеразы нескольких HMU-бактериофагов имеют аналогичные интроны группы I с сильно расходящимися открытыми рамками считывания». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (18): 3715–21. Дои:10.1093 / nar / 22.18.3715. ЧВК  308352. PMID  7937082.
  16. ^ Ширман С., Годон Дж. Дж., Гассон М. (июль 1996 г.). «Сплайсинг интрона группы II в гене функционального переноса Lactococcus lactis». Мол Микробиол. 21 (1): 45–53. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1996.00610.x. PMID  8843433.
  17. ^ Миллс Д.А., Маккей Л.Л., Данни Г.М. (июнь 1996 г.). «Сплайсинг интрона группы II, участвующего в конъюгативном переносе pRS01 в ​​лактококки». J Бактериол. 178 (12): 3531–8. Дои:10.1128 / jb.178.12.3531-3538.1996. ЧВК  178122. PMID  8655550.
  18. ^ Ликке-Андерсен Дж., Ти-Нгок Х.П., Гаррет Р.А. (ноябрь 1994 г.). «ДНК-субстратная специфичность и кинетика расщепления эндонуклеазы типа« хоминг »архей из Pyrobaculum organotrophum». Нуклеиновые кислоты Res. 22 (22): 4583–90. Дои:10.1093 / nar / 22.22.4583. ЧВК  308504. PMID  7984405.
  19. ^ Далгаард Дж. З., Гаррет Р. А. (ноябрь 1992 г.). «Кодирующие белок интроны из гена, кодирующего 23S рРНК, образуют стабильные круги в гипертермофильной архее Pyrobaculum organotrophum». Ген. 121 (1): 103–10. Дои:10.1016 / 0378-1119 (92) 90167-Н. PMID  1427083.
  20. ^ а б Щепанек Т., Лазовска Дж. (Июль 1996 г.). «Замена двух несмежных аминокислот в кодируемой интроном S.cerevisiae bi2 РНК maturase достаточна для достижения активности хоминг-эндонуклеаз». EMBO J. 15 (14): 3758–67. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00746.x. ЧВК  452048. PMID  8670880.
  21. ^ Lazowska J, Szczepanek T, Macadre C, Dokova M (1992). «Два гомологичных митохондриальных интрона от близкородственных видов Saccharomyces отличаются лишь несколькими аминокислотными заменами в их открытых рамках чтения: один подвижен, другой - нет». C. R. Acad. Sci. Париж. 315 (2): 37–41. PMID  1330224.
  22. ^ а б Кейн PM, Ямаширо CT, Wolczyk DF, Neff N, Goebl M, Stevens TH (ноябрь 1990). «Белковый сплайсинг превращает дрожжевой продукт гена TFP1 в 69-кДа субъединицу вакуолярной H (+) - аденозинтрифосфатазы». Наука. 250 (4981): 651–7. Bibcode:1990Научный ... 250..651K. Дои:10.1126 / science.2146742. PMID  2146742.
  23. ^ Гимбл Ф.С., Торнер Дж. (Май 1992 г.). "Направление гена эндонуклеазы ДНК путем преобразования мейотического гена в Saccharomyces cerevisiae". Природа. 357 (6376): 301–6. Bibcode:1992Натура.357..301Г. Дои:10.1038 / 357301a0. PMID  1534148.
  24. ^ а б c d е Бонитц С.Г., Коруцци Г., Таленфельд Б.Е., Цаголофф А., Мачино Г. (декабрь 1980 г.). «Сборка митохондриальной мембранной системы. Структура и нуклеотидная последовательность гена, кодирующего субъединицу 1 цитохромоксидазы дрожжей». J Biol Chem. 255 (24): 11927–41. PMID  6254986.
  25. ^ Хэнсон Д.К., Лэмб М.Р., Малер Х.Р., Перлман П.С. (март 1982 г.). «Доказательства транслированных промежуточных последовательностей в митохондриальном геноме Saccharomyces cerevisiae». J Biol Chem. 257 (6): 3218–24. PMID  6277926.
  26. ^ Делаходде А., Гогуэль В., Бекам А.М., Крезо Ф., Переа Дж., Банрокес Дж., Жак С. (февраль 1989 г.). «Сайт-специфическая ДНК-эндонуклеаза и активность матуразной РНК двух гомологичных кодируемых интронами белков из митохондрий дрожжей». Клетка. 56 (3): 431–41. Дои:10.1016/0092-8674(89)90246-8. PMID  2536593.
  27. ^ Саргей Б., Делаходде А., Хатат Д., Тиан Г.Л., Лазовска Дж., Жак С. (февраль 1991 г.). «Новая специфическая ДНК-эндонуклеазная активность в митохондриях дрожжей». Мол Джен Генет. 225 (2): 340–1. Дои:10.1007 / BF00269867. PMID  1848651.
  28. ^ Переа Дж., Десдуэ С., Шаприя М., Жак С. (январь 1993 г.). «I-Sce III: новая кодируемая интронами эндонуклеаза группы I из митохондрий дрожжей». Нуклеиновые кислоты Res. 21 (2): 358. Дои:10.1093 / nar / 21.2.358. ЧВК  309119. PMID  8441645.
  29. ^ Moran JV, Wernette CM, Mecklenburg KL, Butow RA, Perlman PS (август 1992 г.). «Интрон 5 альфа гена COXI митохондриальной ДНК дрожжей представляет собой мобильный интрон группы I.. Нуклеиновые кислоты Res. 20 (15): 4069–76. Дои:10.1093 / nar / 20.15.4069. ЧВК  334089. PMID  1324475.
  30. ^ Серафин Б., Фэй Дж., Хатат Д., Жак С. (апрель 1992 г.). "Дрожжевой митохондриальный интрон aI5 альфа: ассоциированная эндонуклеазная активность и подвижность in vivo". Ген. 113 (1): 1–8. Дои:10.1016 / 0378-1119 (92) 90663-А. PMID  1314207.
  31. ^ Лян Ф., Романиенко П.Дж., Уивер Д.Т., Джегго П.А., Джасин М. (август 1996 г.). «Ремонт двухцепочечных хромосомных разрывов в Ku80-дефицитных клетках». PNAS. 93 (17): 8929–33. Bibcode:1996PNAS ... 93.8929L. Дои:10.1073 / пнас.93.17.8929. ЧВК  38571. PMID  8799130.
  32. ^ Ян Дж., Циммерли С., Перлман П.С., Ламбовиц А.М. (май 1996 г.). «Эффективная интеграция интронной РНК в двухцепочечную ДНК путем обратного сплайсинга». Природа. 381 (6580): 332–5. Bibcode:1996Натура.381..332Y. Дои:10.1038 / 381332a0. PMID  8692273.
  33. ^ а б Белл-Педерсен Д., Куирк С., Клайман Дж., Белфорт М. (июль 1990 г.). «Подвижность интронов в фаге Т4 зависит от особого класса эндонуклеаз и не зависит от последовательностей ДНК, кодирующих ядро ​​интрона: механистические и эволюционные последствия». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (13): 3763–70. Дои:10.1093 / nar / 18.13.3763. ЧВК  331075. PMID  2165250.
  34. ^ Чу Ф.К., Мэйли Дж., Педерсен-Лейн Дж., Ван А.М., Мэйли Ф. (май 1990 г.). «Характеристика сайта рестрикции прокариотической эндонуклеазы, кодируемой интроном». PNAS. 87 (9): 3574–8. Bibcode:1990PNAS ... 87.3574C. Дои:10.1073 / pnas.87.9.3574. ЧВК  53944. PMID  2159153.
  35. ^ Белл-Педерсен Д., Куирк С.М., Обри М., Белфорт М. (октябрь 1989 г.). «Сайт-специфическая эндонуклеаза и совместная конверсия фланкирующих экзонов, связанных с мобильным интроном td фага Т4». Ген. 82 (1): 119–26. Дои:10.1016 / 0378-1119 (89) 90036-Х. PMID  2555262.
  36. ^ Шуб Д.А., Готт Дж.М., Сюй М.К., Ланг Б.Ф., Мишель Ф., Томашевски Дж., Педерсен-Лейн Дж., Белфорт М. (февраль 1988 г.). «Структурная консервация среди трех гомологичных интронов бактериофага Т4 и интронов группы I эукариот». PNAS. 85 (4): 1151–5. Bibcode:1988ПНАС ... 85.1151С. Дои:10.1073 / pnas.85.4.1151. ЧВК  279724. PMID  3422485.
  37. ^ Эдди С.Р., Голд Л. (июнь 1991 г.). «Интрон nrdB фага T4: делеционный мутант версии, найденной в дикой природе». Genes Dev. 5 (6): 1032–41. Дои:10.1101 / gad.5.6.1032. PMID  2044951.
  38. ^ Сюй М., Саутворт М.В., Мерша Ф. Б., Хорнстра Л. Дж., Перлер Ф. Б. (декабрь 1993 г.). «Сплайсинг очищенного предшественника белка in vitro и идентификация разветвленного промежуточного продукта». Клетка. 75 (7): 1371–7. Дои:10.1016 / 0092-8674 (93) 90623-Х. PMID  8269515.
  39. ^ а б Perler FB, Comb DG, Jack WE, Moran LS, Qiang B, Kucera RB, Benner J, Slatko BE, Nwankwo DO, Hempstead SK, Carlow CK, Jannasch H (июнь 1992 г.). «Промежуточные последовательности в гене ДНК-полимеразы архей». PNAS. 89 (12): 5577–81. Bibcode:1992ПНАС ... 89.5577П. Дои:10.1073 / пнас.89.12.5577. ЧВК  49335. PMID  1608969.
  40. ^ Хирата Р., Осумк Ю., Накано А., Кавасаки Н., Сузуки К., Анраку Ю. (апрель 1990 г.). «Молекулярная структура гена VMA1, кодирующего каталитическую субъединицу H (+) - транслокации аденозинтрифосфатазы из вакуолярных мембран Saccharomyces cerevisiae». J Biol Chem. 265 (12): 6726–33. PMID  2139027.
  41. ^ Perler FB (январь 2002 г.). «InBase: база данных Intein». Нуклеиновые кислоты Res. 30 (1): 383–4. Дои:10.1093 / nar / 30.1.383. ЧВК  99080. PMID  11752343.