LIMS2 - LIMS2

LIMS2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3IXE
Идентификаторы
Псевдонимы	LIMS2, PINCH-2, PINCH2, LGMD2W, LIM домен цинкового пальца, содержащий 2, MDRCMTT
Внешние идентификаторы	OMIM: 607908 MGI: 2385067 ГомолоГен: 41214 Генные карты: LIMS2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q14.3 Начинать 127,638,381 бп[1] Конец 127,681,786 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 18 (мышь)[2] Группа 18 | 18 B1 Начинать 31,922,290 бп[2] Конец 31,958,619 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов Сотовый компонент • цитозоль • соединение клеток • клеточная мембрана • мембрана • ядро клетки • очаговая адгезия • цитоплазма • межклеточное соединение Биологический процесс • положительная регуляция интегрин-опосредованного сигнального пути • отрицательная регуляция пролиферации нервных клеток-предшественников • организация межклеточного перехода • отрицательная регуляция апоптотического процесса • отрицательная регуляция пролиферации гепатоцитов • узел соединения ячеек • отрицательная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • межклеточная адгезия • положительная регуляция распространения клеток, зависящих от адгезии субстрата Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55679	225341
Ансамбль	ENSG00000072163	ENSMUSG00000024395
UniProt	Q7Z4I7	Q91XD2
RefSeq (мРНК)	NM_001136037 NM_001161403 NM_001161404 NM_001256542 NM_017980	NM_144862 NM_001365015 NM_001379137 NM_001379138
RefSeq (белок)	NP_001129509 NP_001154875 NP_001154876 NP_001243471 NP_060450	NP_659111 NP_001351944 NP_001366066 NP_001366067
Расположение (UCSC)	Chr 2: 127,64 - 127,68 Мб	Chr 18: 31.92 - 31.96 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

LIM домен цинковых пальцев, содержащий 2 это белок что у человека кодируется LIMS2 ген.^[5]

Функция

Этот ген кодирует член небольшого семейства белков фокальной адгезии, который взаимодействует с ILK (интегрин-связанная киназа), белком, который влияет на белок-белковые взаимодействия с экстрацеллярным матриксом. Кодируемый белок имеет пять доменов LIM, каждый из которых образует два цинковых пальца, которые позволяют взаимодействовать, регулируя форму и миграцию клеток. Псевдоген этого гена расположен на хромосоме 4. Для этого гена обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы. [предоставлено RefSeq, ноябрь 2011 г.].

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000072163 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024395 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: LIM домен цинкового пальца, содержащий 2". Получено 2017-11-06.

дальнейшее чтение

• Чжан И, Чен К., Го Л., Ву Ц. (2002). «Характеристика PINCH-2, нового белка фокальной адгезии, который регулирует взаимодействие PINCH-1-ILK, распространение и миграцию клеток». J. Biol. Chem. 277 (41): 38328–38. Дои:10.1074 / jbc.M205576200. PMID  12167643.
• Ким С.К., Чан Х.Р., Ким Дж.Х., Но С.М., Сон К.С., Ким М.Р., Ким СИ, Йом Йи, Ким Н.С., Ю ХС, Ким Ю.С. (2006). «Эпигенетическое молчание LIMS2 при раке желудка и его ингибирующее действие на миграцию клеток». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 349 (3): 1032–40. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.08.128. PMID  16959213.
• Давила С., Фроилинг Ф.Е., Тан А., Боннар С., Боланд Г.Дж., Снайппе Х, Хибберд М.Л., Зайелстад М. (2010). «Новые генетические ассоциации, обнаруженные в исследовании реакции хозяина на вакцину против гепатита В». Гены иммунной. 11 (3): 232–8. Дои:10.1038 / gene.2010.1. PMID  20237496.
• Юань Ю., Донг Х.П., Наймоен Д.А., Несланд Дж. М., Ву С., Дэвидсон Б. (2011). «Экспрессия PINCH-2 при раке, включающем серозные выпоты, с использованием количественной ПЦР». Цитопатология. 22 (1): 22–9. Дои:10.1111 / j.1365-2303.2010.00757.x. ЧВК  3225403. PMID  20500520.
• Пак СН, Ра С.И., Ан Дж.Б., Шин С.Дж., Квон В.С., Ким Т.С., Ан С., Ким Н.К., Ян В.И., Чанг ХК (2015). «PINCH-2 представляет функциональные вариации числа копий и подавляет миграцию клеток рака толстой кишки за счет паракринной активности». Int. J. Рак. 136 (10): 2273–83. Дои:10.1002 / ijc.29273. PMID  25346044. S2CID  2850271.
• Chardon JW, Smith AC, Woulfe J, Pena E, Rakhra K, Dennie C, Beaulieu C, Huang L, Schwartzentruber J, Hawkins C., Harms MB, Dojeiji S, Zhang M, Majewski J, Bulman DE, Boycott KM, Dyment DA (2015). «Мутации LIMS2 связаны с новой мышечной дистрофией, тяжелой кардиомиопатией и треугольными языками». Clin. Genet. 88 (6): 558–64. Дои:10.1111 / cge.12561. PMID  25589244. S2CID  23714774.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.