Кариоферин альфа 1 - Karyopherin alpha 1

KPNA1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2JDQ, 3TJ3, 4B18
Идентификаторы
Псевдонимы	KPNA1, IPOA5, NPI-1, RCH2, SRP1, Импортин, Кариоферин альфа 1, субъединица кариоферина альфа 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600686 MGI: 103560 ГомолоГен: 55642 Генные карты: KPNA1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q21.1 Начинать 122,421,902 бп[1] Конец 122,514,945 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 16 (мышь)[2] Группа 16 | 16 B3 Начинать 35,978,750 бп[2] Конец 36,037,131 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание с последовательностью ядерной локализации • активность рецептора ядерного импортного сигнала Сотовый компонент • ядерная пора • нуклеоплазма • дендрит • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль • клетка-хозяин • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • глутаматергический синапс Биологический процесс • регуляция рекомбинации ДНК • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • апоптотическая фрагментация ДНК • импорт белка в ядро • транспорт белка • модуляция вирусом хост-процесса • Импорт NLS-несущего белка в ядро • GO: 0022415 вирусный процесс • постсинапс к ядру сигнальный путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3836	16646
Ансамбль	ENSG00000114030	ENSMUSG00000022905
UniProt	P52294	Q60960
RefSeq (мРНК)	NM_002264	NM_008465
RefSeq (белок)	NP_002255	NP_032491
Расположение (UCSC)	Chr 3: 122,42 - 122,51 Мб	Chr 16: 35.98 - 36.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица импортина альфа-1 это белок что у людей кодируется KPNA1 ген.^[5]

Взаимодействия

Кариоферин альфа-1 может взаимодействовать с КПНБ1^[6][7] и УБР5.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000114030 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022905 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Cortes P, Ye ZS, Baltimore D (сентябрь 1994 г.). «RAG-1 взаимодействует с повторяющимся аминокислотным мотивом человеческого гомолога дрожжевого белка SRP1». Proc Natl Acad Sci U S A. 91 (16): 7633–7. Bibcode:1994PNAS ... 91.7633C. Дои:10.1073 / пнас.91.16.7633. ЧВК  44456. PMID  8052633.
6. Köhler, M; Speck C; Christiansen M; Bischoff F R; Prehn S; Haller H; Görlich D; Hartmann E (ноябрь 1999 г.). «Доказательства различных субстратных специфичностей членов семейства импортина альфа в импорте ядерного белка». Мол. Клетка. Биол. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 19 (11): 7782–91. Дои:10.1128 / mcb.19.11.7782. ISSN  0270-7306. ЧВК  84838. PMID  10523667.
7. Percipalle, P; Кларксон В.Д .; Kent H M; Родос D; Стюарт М. (март 1997 г.). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол. АНГЛИЯ. 266 (4): 722–32. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0801. ISSN  0022-2836. PMID  9102465.
8. Хендерсон, Мишель Дж; Рассел Аманда Дж; Хирд Саманта; Муньос Марсия; Клэнси Дженнифер Л; Lehrbach Gillian M; Calanni Sophina T; Янс Дэвид А; Сазерленд Роберт Л; Уоттс Колин К. В. (июль 2002 г.). «EDD, белок гиперпластических дисков человека, играет роль в коактивации рецептора прогестерона и потенциальном участии в ответе на повреждение ДНК». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 277 (29): 26468–78. Дои:10.1074 / jbc.M203527200. ISSN  0021-9258. PMID  12011095.

дальнейшее чтение

• Букринский М.И., Хаффар О.К. (2004). «Ядерный импорт ВИЧ-1: в поисках лидера». Передний. Biosci. 2 (4): d578–87. Дои:10.2741 / A213. PMID  9366553.
• Букринский М.И., Хаффар О.К. (1998). «Ядерный импорт ВИЧ-1: матричный белок снова в центре внимания, на этот раз вместе с Vpr». Мол. Med. 4 (3): 138–43. Дои:10.1007 / BF03401911. ЧВК  2230352. PMID  9562972.
• Кино Т, Павлакис Г.Н. (2004). «Молекулы-партнеры вспомогательного белка Vpr вируса иммунодефицита человека 1 типа». ДНК клетки биол. 23 (4): 193–205. Дои:10.1089/104454904773819789. PMID  15142377.
• Букринский М.И., Шарова Н., Демпси М.П. и др. (1992). «Активный ядерный импорт преинтеграционных комплексов вируса иммунодефицита человека 1 типа». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (14): 6580–4. Bibcode:1992PNAS ... 89.6580B. Дои:10.1073 / пнас.89.14.6580. ЧВК  49545. PMID  1631159.
• Шарова Н, Букринская А (1991). «p17 и p17-содержащие предшественники gag входящего вируса иммунодефицита человека транспортируются в ядра инфицированных клеток». AIDS Res. Гм. Ретровирусы. 7 (3): 303–6. Дои:10.1089 / помощь.1991.7.303. PMID  2064827.
• Ди Марцио П., Чхве С., Эбрайт М. и др. (1996). «Мутационный анализ остановки клеточного цикла, ядерной локализации и упаковки вирионов вируса иммунодефицита человека типа 1 Vpr». Дж. Вирол. 69 (12): 7909–16. Дои:10.1128 / JVI.69.12.7909-7916.1995. ЧВК  189735. PMID  7494303.
• Галлай П., Свинглер С., Сонг Дж. И др. (1995). «Ядерный импорт ВИЧ регулируется фосфотирозин-опосредованным связыванием матрицы с основным доменом интегразы». Клетка. 83 (4): 569–76. Дои:10.1016/0092-8674(95)90097-7. PMID  7585960. S2CID  15536328.
• Морояну Дж., Хидзиката М., Блобель Дж., Раду А. (1995). «Гетеродимеры кариоферина альфа 1 бета и альфа 2 бета млекопитающих: субъединица альфа 1 или альфа 2 связывает сигнал ядерной локализации, а субъединица бета взаимодействует с нуклеопоринами, содержащими пептидные повторы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (14): 6532–6. Bibcode:1995ПНАС ... 92.6532М. Дои:10.1073 / пнас.92.14.6532. ЧВК  41552. PMID  7604027.
• Фрид Е.О., Энглунд Дж., Мартин М.А. (1995). «Роль основного домена матрицы вируса иммунодефицита человека 1 типа в макрофагальной инфекции». Дж. Вирол. 69 (6): 3949–54. Дои:10.1128 / JVI.69.6.3949-3954.1995. ЧВК  189124. PMID  7745752.
• Вайс К., Маттай И.В., Ламонд А.И. (1995). «Идентификация hSRP1 альфа в качестве функционального рецептора ядерных последовательностей локализации». Наука. 268 (5213): 1049–53. Bibcode:1995Научный ... 268.1049W. Дои:10.1126 / science.7754385. PMID  7754385.
• О'Нил Р. Е., Палезе П. (1995). «NPI-1, человеческий гомолог SRP-1, взаимодействует с нуклеопротеином вируса гриппа». Вирусология. 206 (1): 116–25. Дои:10.1016 / S0042-6822 (95) 80026-3. PMID  7831767.
• Галлай П., Свинглер С., Эйкен С., Троно Д. (1995). «ВИЧ-1 инфекция неделящихся клеток: С-концевое фосфорилирование тирозина вирусного матричного белка является ключевым регулятором». Клетка. 80 (3): 379–88. Дои:10.1016/0092-8674(95)90488-3. PMID  7859280. S2CID  15064293.
• Морояну Дж., Блобель Дж., Раду А. (1995). «Ранее идентифицированный белок с неопределенной функцией - это кариоферин альфа и вместе с кариоферином бета доки импортируют субстрат в комплексы ядерных пор». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (6): 2008–11. Bibcode:1995 ПНАС ... 92 2008M. Дои:10.1073 / пнас.92.6.2008. ЧВК  42412. PMID  7892216.
• фон Шведлер U, Корнблут RS, Trono D (1994). «Сигнал ядерной локализации матричного белка вируса иммунодефицита человека типа 1 позволяет установить инфекцию в макрофагах и покоящихся Т-лимфоцитах». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (15): 6992–6. Bibcode:1994PNAS ... 91.6992V. Дои:10.1073 / пнас.91.15.6992. ЧВК  44324. PMID  8041734.
• Хайнцингер Н.К., Букинский М.И., Хаггерти С.А. и др. (1994). «Белок Vpr вируса иммунодефицита человека 1 типа влияет на ядерную локализацию вирусных нуклеиновых кислот в неделящихся клетках-хозяевах». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (15): 7311–5. Bibcode:1994PNAS ... 91.7311H. Дои:10.1073 / пнас.91.15.7311. ЧВК  44389. PMID  8041786.
• Букринский М.И., Хаггерти С., Демпси М.П. и др. (1993). «Сигнал ядерной локализации в матричном белке ВИЧ-1, который управляет инфекцией неделящихся клеток». Природа. 365 (6447): 666–9. Bibcode:1993Натура.365..666Б. Дои:10.1038 / 365666a0. PMID  8105392. S2CID  25678.
• Дубровский Л., Ульрих П., Нуово Г. Дж. И др. (1996). «Сигнал ядерной локализации ВИЧ-1 как новая мишень для терапевтического вмешательства». Мол. Med. 1 (2): 217–30. Дои:10.1007 / BF03401569. ЧВК  2229944. PMID  8529100.
• Галлай П., Ститт В., Манди С. и др. (1996). «Роль кариоферинового пути в ядерном импорте вируса иммунодефицита человека 1 типа». Дж. Вирол. 70 (2): 1027–32. Дои:10.1128 / JVI.70.2.1027-1032.1996. ЧВК  189908. PMID  8551560.
• Букринская А.Г., Горпаде А., Хайнцингер Н.К. и др. (1996). «Зависимая от фосфорилирования инфекция вируса иммунодефицита человека типа 1 и ядерное нацеливание вирусной ДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (1): 367–71. Bibcode:1996ПНАС ... 93..367Б. Дои:10.1073 / pnas.93.1.367. ЧВК  40239. PMID  8552640.