Interolog - Interolog
An интеролог это сохраняющееся взаимодействие между парой белки которые взаимодействуют гомологи в другом организме. Этот термин был введен в 2000 году в статье Walhout et al.[1][2]
Пример
Предположим, что A и B - два разных взаимодействующих белка человека, а A 'и B' - два разных взаимодействующих белка собаки. Тогда взаимодействие между A и B является интерологом взаимодействия между A 'и B', если выполняются все следующие условия:
- A - гомолог A '. (Гомологи белков имеют аналогичные аминокислота последовательности и происходят от общей наследственной последовательности).
- B является гомологом B '.
- A и B взаимодействуют.
- A 'и B' взаимодействуют.
Таким образом, интерологи представляют собой пары гомологичных белковых взаимодействий между разными организмами.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Walhout, A.J .; Sordella, R .; Лу, X .; Hartley, J. L .; Temple, G. F .; Brasch, M. A .; Thierry-Mieg, N .; Видаль, М. (2000). «Картирование взаимодействия белков в C. elegans с использованием белков, участвующих в развитии вульвы». Наука. 287 (5450): 116–122. Bibcode:2000Sci ... 287..116W. Дои:10.1126 / science.287.5450.116. PMID 10615043.
- ^ Yu, H .; Luscombe, N.M .; Лу, Х. Х .; Чжу, X .; Xia, Y .; Han, J.D .; Bertin, N .; Chung, S .; Vidal, M .; Герштейн, М. (2004). «Перенос аннотаций между геномами: интерологи белок-белок и регулоги белок-ДНК». Геномные исследования. 14 (6): 1107–1118. Дои:10.1101 / гр.1774904. ЧВК 419789. PMID 15173116.
- Yu, H .; Luscombe, N.M .; Лу, Х. Х .; Чжу, X .; Xia, Y .; Han, J.D .; Bertin, N .; Chung, S .; Vidal, M .; Герштейн, М. (2004). «Перенос аннотаций между геномами: интерологи белок-белок и регулоги белок-ДНК». Геномные исследования. 14 (6): 1107–1118. Дои:10.1101 / гр.1774904. ЧВК 419789. PMID 15173116.
- Kemmer, D .; Huang, Y .; Shah, S.P .; Lim, J .; Brumm, J .; Yuen, M. M .; Ling, J .; Xu, T .; Вассерман, В. В .; Уэллетт, Б. Ф. (2005). «Ulysses - приложение для проектирования молекулярных взаимодействий между видами». Геномная биология. 6 (12): R106. Дои:10.1186 / gb-2005-6-12-r106. ЧВК 1414088. PMID 16356269.
- Wiles, A.M .; Додерер, М .; Ruan, J .; Gu, T. T .; Ravi, D .; Blackman, B .; Бишоп, А. Дж. (2010). «Построение и анализ сетей белковых взаимодействий путем межвидовых сравнений». BMC Systems Biology. 4: 36. Дои:10.1186/1752-0509-4-36. ЧВК 2859380. PMID 20353594.
внешняя ссылка
- Interactome.org: Сайт портала Interactome.
- Interactomics.org: Сайт интерактивного портала.
- [1]: Сайт прогнозирования межвидовых взаимодействий.
  | Эта статья по биоинформатике заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |