Международный консорциум эпигенома человека - International Human Epigenome Consortium

Не путать с Проект человеческого эпигенома.

В Международный консорциум эпигенома человека (IHEC) - это научная организация, основанная в 2010 году, которая помогает координировать глобальные усилия в области Эпигеномика.^[1][2][3][4] Первоначальная цель заключалась в создании не менее 1000 ссылок (базовый уровень) человеческие эпигеномы от различных типов нормальных и связанных с болезнями людей типы клеток.^[5][6][7]

Структура и финансирование

Деятельность IHEC финансируется его полноправными членами (национальными и региональными научными финансовыми агентствами) и укомплектована в основном на добровольной основе учеными и другими экспертами из участвующих финансовых агентств и проектов картирования эпигеномов.^[8]

Текущие страны-члены IHEC

• Канадские институты медицинских исследований (Канада)^[9]
• Европейская комиссия (ЕВРОПА)^{[10][11][12][13][14]}
• Федеральное министерство образования и науки, Агентство по управлению проектами в Немецкий аэрокосмический центр (Германия)^[15][16]
• Институт генома Сингапура (Сингапур)^[17]
• Гонконгский эпигеномический проект (Гонконг)^[18][19]
• Японское агентство медицинских исследований и разработок (Япония)^[20]
• Национальный институт здоровья (Южная Корея)
• Национальные институты здоровья: Программа эпигеномики дорожной карты^[21] и Энциклопедия элементов ДНК (КОДИРОВАТЬ ) проект (США)

Кроме того, страны и агентства, поддерживающие цели IHEC, - это организации, которые еще не сделали полного финансового вклада в проект, но члены которых предоставляют время и знания:^[22]

• Европейский институт онкологии, Фонд Института молекулярной онкологии FIRC, Итальянский технологический институт, Центр геномных наук (Италия)
• Национальное агентство исследований (Франция)
• Национальный совет здравоохранения и медицинских исследований (Австралия)
• Британский альянс спонсоров: Совет медицинских исследований, Совет по исследованиям биотехнологии и биологических наук, Cancer Research UK, и Wellcome Trust (ВЕЛИКОБРИТАНИЯ)

Надзор за IHEC осуществляется Исполнительным комитетом, члены которого назначаются полноправными организациями.^[23] Этот комитет работает в тесном сотрудничестве с Международным научным руководящим комитетом, членами которого являются научные руководители участвующих проектов и другие лидеры в области эпигенетики, а также с Центром координации данных. Дополнительный опыт вносят рабочие группы, состоящие из членов участвующих исследовательских проектов.

IHEC взаимодействует и координирует свои усилия с другими крупномасштабными международными проектами в области геномики, такими как Международный консорциум генома рака (МКГК),^[24] КОДИРОВАТЬ.,^[25][26] и Глобальный альянс за геномику и здоровье.^[27] Члены комитетов и рабочих групп, а также другие лица, участвующие в IHEC, ежегодно встречаются на мероприятии, проводимом странами-членами на ротационной основе.^[28] Большинство встреч проводится вместе с научными симпозиумами, некоторые из которых открыты для ученых, не входящих в IHEC, а иногда и для представителей общественности.

Цели

Конечная цель IHEC - определить, как Эпигеном формировала человеческое население на протяжении поколений и в ответ на окружающую среду.^[25][29] Первый этап операций IHEC включает в себя координацию производства не менее 1000 эталонных эпигеномов из здоровых и больных клеток человека, а также ограниченного числа модельные организмы относится к конкретным заболеваниям человека. Первоначальный акцент делается на клеточных состояниях, включая стволовость, бессмертие, распространение, дифференциация, старение и стресс. Эталонный эпигеном для каждого образца содержит карты высокого разрешения Метилирование ДНК и ключевые нормативные гистон модификации с соответствующей информацией о типе и уровне экспрессии всех транскрибируемых генов (белок кодирование, а также некодирование / малые РНК).^[30]Полученные данные предоставляются в свободный доступ исследовательскому сообществу через портал данных IHEC,^[31][32] Европейский архив генома-фенома (EGA),^[33] и другие места.^[34][25][35]

Кроме того, участвующие исследовательские проекты занимаются разработкой новой эпигеномики и связанных биоинформатика методы.

В ноябре 2016 года члены IHEC из Канады, Консорциума BLUEPRINT Европейского Союза, Немецкой программы эпигенома «DEEP», Японии, Сингапура и США опубликовали группу из 41 согласованной статьи в Cell Press и другие журналы.^{[36][37][38][39]} Документы включали описания молекулярной биологии и вычислительных методов, а также новые исследования в области нормальной биологии и биологии болезней.^{[40][41][42][43]}

Смотрите также

• Эпигеном человека

Рекомендации

^[44]

1. «Время эпигенома: статья: Природа».
2. Проект настроен на отображение меток на геноме: Природа 463: 596-597 (2010) DOI: 10.1038 / 463596b
3. Бэ, JB (2013). «Перспективы международного консорциума эпигенома человека». Геномика Информ. 11 (1): 7–14. Дои:10.5808 / GI.2013.11.1.7. ЧВК  3630389. PMID  23613677.
4. «BioNews - запуск проекта« Эпигеном человека »».
5. «Франция: Консорциум эпигенома человека делает первые шаги» В архиве 2015-07-08 в Wayback Machine. 5 марта 2010 г.
6. "Frontiers | Многослойный анализ рака человека: исследование биомаркеров и мишеней лекарств на основе деятельности Международного консорциума эпигенома человека | Эпигеномика и эпигенетика". Границы.
7. GmbH, Eurice. «О ИВЭЦ · ИВЭЦ». ihec-epigenomes.org. Получено 2017-06-23.
8. GmbH, Eurice. «Страны IHEC · IHEC». ihec-epigenomes.org. Получено 2017-06-23.
9. «Обзор Канадского консорциума исследований в области эпигенетики, окружающей среды и здоровья».
10. «ЕС инвестирует 30 миллионов евро в карту новой территории в области медицинских исследований».
11. «Путешествие от стволовой клетки к клетке крови раскрыто: исследование BLUEPRINT каталогизирует события, которые регулируют образование клеток крови».
12. «Каталог того, как белые клетки образуются стволовыми клетками крови».
13. «Европа для карты эпигенома человека».
14. GmbH, Eurice. «IHEC приветствует два новых европейских проекта-члена | IHEC». ihec-epigenomes.org. Получено 2017-06-23.
15. "Deutsche Beteiligung am International Human Epigenome Consortium (IHEC)" В архиве 2015-07-08 в Wayback Machine.
16. "Проект DEEP (Deutsches Epigenom Programm)".
17. GmbH, Eurice. «Сингапур · IHEC». ihec-epigenomes.org. Получено 2017-06-23.
18. GmbH, Eurice. «IHEC приветствует Гонконгский проект эпигеномики в качестве нового члена консорциума | IHEC». ihec-epigenomes.org. Получено 2017-06-23.
19. "Гонконгский эпигеномический проект". epihk.org. Получено 2017-06-23.
20. «Международный консорциум эпигенома человека (IHEC) | Сотрудничество / сотрудничество с внешними учреждениями | Японское агентство медицинских исследований и разработок». www.amed.go.jp. Получено 2017-06-23.
21. "Дорожная карта проекта эпигеномики - Главная". www.roadmapepigenomics.org. Получено 2017-07-18.
22. Eurice GmbH. «Члены IHEC · IHEC» В архиве 2013-10-08 в Wayback Machine.
23. GmbH, Eurice. «Рабочие группы IHEC · IHEC». ihec-epigenomes.org. Получено 2017-06-23.
24. «Геномная медицина | Авторизация | Синергия и конкуренция между проектами секвенирования генома рака и картирования эпигенома».
25. Eurice GmbH. «Цели».
26. «Углубляясь в геном животных».
27. «На главную | Глобальный альянс за геномику и здоровье». genomicsandhealth.org. Получено 2017-07-18.
28. Eurice GmbH. «Новости + События · IHEC».
29. Stunnenberg, Hendrik G .; Абриньяни, Серджио; Адамс, Дэвид; Алмейда, Мелани де; Альтуччи, Лючия; Амин, Вирен; Амит, Идо; Антонаракис, Стилианос Э .; Апарисио, Самуэль (17 ноября 2016 г.). "Международный консорциум эпигенома человека: план научного сотрудничества и открытий". Клетка. 167 (5): 1145–1149. Дои:10.1016 / j.cell.2016.11.007. ISSN  0092-8674. PMID  27863232.
30. Протоколы и стандарты »
31. «Портал данных | IHEC». epigenomesportal.ca. Получено 2017-06-23.
32. Буджольд, Дэвид; Мораис, Дэвид Андерсон де Лима; Готье, Кэрол; Коте, Катрин; Кэрон, Максим; Кван, Тони; Чен, Куанг Чунг; Лаперле, Джонатан; Марковиц, Алексей Норделл (23.11.2016). "Портал данных Международного консорциума эпигенома человека". Сотовые системы. 3 (5): 496–499.e2. Дои:10.1016 / j.cels.2016.10.019. ISSN  2405-4712. PMID  27863956.
33. «Согласованный выпуск документов IHEC». Блог EGA. Получено 2017-06-23.
34. Eurice GmbH. «О ИВЭК».
35. «Портал данных IHEC».
36. «Консорциум: IHEC: Cell Press». Получено 2017-06-23.
37. Редакция Cell (17.11.2016). "Рог изобилия достижений в области эпигеномики человека". Клетка. 167 (5): 1139. Дои:10.1016 / j.cell.2016.11.001. ISSN  0092-8674. PMID  27863229.
38. «Эпигенетика во всем Интернете: главные эпигенетические истории 2016 года - эпигенетика». Эпигенетика. Получено 2017-06-23.
39. "Опубликовано более 40 новых статей по эпигенетике | The Scientist Magazine®". Ученый. Получено 2017-06-23.
40. «Сингапурские ученые - участник прорыва в исследованиях аутизма». Получено 2017-06-23.
41. "Эпигеномные исследования рака, сообщенные членами международных консорциумов". GenomeWeb. Получено 2017-06-23.
42. «Исследовательские группы Консорциума эпигенома занимаются эпигенетикой иммунного ответа». GenomeWeb. Получено 2017-06-23.
43. «Как генетические вариации клеток крови влияют на распространенные заболевания». Получено 2017-06-23.
44. «Интегративная функциональная геномика идентифицирует энхансерную петлю к гену SOX9, нарушенную локусом риска рака простаты 17q24.3».