Стандарт цитометрии изображений - Image Cytometry Standard
Расширение имени файла | .ics, .ids |
---|---|
Тип формата | Форматы файлов изображений |
В Стандарт цитометрии изображений (ICS) - это цифровое многомерное изображение формат файла используется в Науки о жизни микроскопия. В нем хранится не только данные изображения, но также и микроскопические параметры, описывающие оптику во время съемки.
Впервые ICS был предложен в: P. Dean, L. Mascio, D. Ow, D. Sudar, J. Mullikin, Предлагаемый стандарт для файлов данных цитометрии изображений, Цитометрия, н. 11. С. 561-569, 1990. [1].
Исходный формат файла ICS фактически использует два отдельных файла: файл текстового заголовка с расширением .ics и другой, гораздо большего размера и с фактическими данными изображения, с расширением .ids. Это позволяет сжимать данные, оставляя доступным файл заголовка. С другой стороны, в новом формате файлов ICS2 используется только один файл .ics с заголовком и данными вместе.
.Ics в двухфайловом формате представляет собой текстовый файл с полями, разделенными вкладки, и строки, оканчивающиеся на новая линия характер. В новом формате ICS2 этот текстовый заголовок предшествует двоичным данным.
Формат ICS может хранить:
- многомерные и многоканальные данные
- изображения в 8, 16, 32 или 64-битных целочисленных, 32 или 64-битных с плавающей запятой и комплексных данных с плавающей запятой
- все микроскопические параметры, имеющие непосредственное отношение к формированию изображения
- комментарии в свободной форме
внешняя ссылка
- Исходные коды библиотеки чтения / записи файлов ICS, выпущенной под лицензией LGPL v2.1: https://github.com/svi-opensource/libics. Текущая версия 1.6.3 выпущена 24 мая 2019 г.
- Интерфейс Python для libics: пилибика
- Открывалка ICS за ImageJ.
- Био-форматы за Fiji_ (программное обеспечение) / ImageJ.