ITGB1BP1 - ITGB1BP1

ITGB1BP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4DX8, 4DX9, 4JIF
Идентификаторы
Псевдонимы	ITGB1BP1, ICAP-1A, ICAP-1B, ICAP-1alpha, ICAP1, ICAP1A, ICAP1B, субъединица интегрина бета 1, связывающий белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 607153 MGI: 1306802 ГомолоГен: 3496 Генные карты: ITGB1BP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п25.1 Начните 9,403,475 бп[1] Конец 9,423,547 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 A1.3 Начните 21,240,825 бп[2] Конец 21,286,284 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание интегрина • связывание киназы • GO: 0001948 связывание с белками • Активность ингибитора GDP-диссоциации • связывание протеинкиназы • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • проекция клетки • мембрана • очаговая адгезия • взъерошить • клеточная мембрана • перинуклеарная область цитоплазмы • цитоскелет • ядро клетки • ламеллиподиум • периферия клетки • нуклеоплазма • центр организации микротрубочек • ядерное тело Биологический процесс • Notch сигнальный путь • положительное регулирование нацеливания белков на мембрану • дифференциация клеток • активация активности протеинкиназы B • миграция миобластов • отрицательная регуляция миграции фибробластов • регуляция клеточной адгезии, опосредованная интегрином • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция активности протеинкиназы • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • развитие биоминеральной ткани • отрицательная регуляция связывания белков • клеточный ответ на стимул фактора роста фибробластов • кластеризация рецепторов • пролиферация эндотелиальных клеток кровеносных сосудов, участвующих в прорастании ангиогенеза • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция миграции эндотелиальных клеток • отрицательная регуляция клеточной адгезии, участвующая в миграции клеток, связанных с субстратом • отрицательная регуляция миграции клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза • отрицательная регуляция нацеливания белка на мембрану • формирование трубки • регуляция интегрин-опосредованного сигнального пути • клеточная адгезия • ангиогенез • положительное регулирование пролиферации клеток • транспорт белка • интегрин-опосредованный сигнальный путь • отрицательная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • положительная регуляция узла фокальной адгезии • клеточный ответ на стимул фактора роста эндотелия сосудов • активация интегрина • адгезия клеточного матрикса • отрицательная регуляция распространения клеток, зависящих от адгезии субстрата • миграция клеток • отрицательная регуляция узла фокальной адгезии • положительная регуляция деления клеток • положительное регулирование сборки напряженного волокна • положительная регуляция сигнального пути Notch • отрицательное регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • локализация белка на плазматической мембране Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9270	16413
Ансамбль	ENSG00000119185	ENSMUSG00000062352
UniProt	O14713	O35671
RefSeq (мРНК)	NM_004763 NM_022334 NM_001319066 NM_001319067 NM_001319068 NM_001319069 NM_001319070 NM_001369744 NM_001369745 NM_001369746 NM_001369747 NM_001369748 NM_001369749 NM_001369750	NM_008403 NM_001355609
RefSeq (белок)	NP_001305995 NP_001305996 NP_001305997 NP_001305998 NP_001305999 NP_004754 NP_071729 NP_001356673 NP_001356674 NP_001356675 NP_001356676 NP_001356677 NP_001356678 NP_001356679	NP_032429 NP_001342538
Расположение (UCSC)	Chr 2: 9.4 - 9.42 Мб	Chr 12: 21.24 - 21.29 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Интегрин бета-1-связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется ITGB1BP1 ген.^[5][6][7]

Цитоплазматические домены интегринов необходимы для клеточной адгезии. Белок, кодируемый этим геном, связывается с цитоплазматическим доменом интегрина бета1. Взаимодействие между этим белком и интегрином бета1 очень специфично. Две изоформы этого белка происходят из транскриптов, подвергнутых альтернативному сплайсингу. Более короткая форма этого белка не взаимодействует с цитоплазматическим доменом интегрина бета1. Более длинная форма представляет собой фосфопротеин, и степень его фосфорилирования регулируется взаимодействием клетка-матрикс, что предполагает важную роль этого белка во время интегрин-зависимой клеточной адгезии.^[7]

Взаимодействия

ITGB1BP1 был показан взаимодействовать с участием КРИТ1,^[5][8] LRP2,^[9] CD29^[6][10] и LRP1.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000119185 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062352 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Завистовский Ю.С., Серебряский И.Г., Ли М.Ф., Големис Е.А., Марчук Д.А. (март 2002 г.). «Связь KRIT1 с интегрин-связывающим белком ICAP-1: новое направление в выяснении патогенеза кавернозных мальформаций головного мозга (CCM1)». Хум Мол Генет. 11 (4): 389–96. Дои:10,1093 / чмг / 11.4.389. PMID  11854171.
6. Чанг Д.Д., Вонг С., Смит Х., Лю Дж. (Октябрь 1997 г.). «ICAP-1, новый белок, связанный с цитоплазматическим доменом интегрина бета1, связывается с консервативным и функционально важным мотивом последовательности NPXY интегрина бета1». J Cell Biol. 138 (5): 1149–57. Дои:10.1083 / jcb.138.5.1149. ЧВК  2136751. PMID  9281591.
7. "Ген Entrez: ITGB1BP1 интегрин бета 1 связывающий белок 1".
8. Чжан, Дж; Clatterbuck R E; Ригамонти Д; Чанг Д Д; Дитц Х. С. (декабрь 2001 г.). «Взаимодействие между krit1 и icap1alpha приводит к нарушению ангиогенеза, опосредованного интегрином бета1, в патогенезе кавернозной мальформации головного мозга». Гм. Мол. Genet. Англия. 10 (25): 2953–60. Дои:10.1093 / hmg / 10.25.2953. ISSN  0964-6906. PMID  11741838.
9. Gotthardt, M; Trommsdorff M; Невитт М Ф; Шелтон Дж; Ричардсон Дж. А; Стокингер W; Nimpf J; Герц Дж (август 2000 г.). «Взаимодействие семейства генов рецепторов липопротеинов низкой плотности с цитозольным адаптером и белками каркаса предполагает различные биологические функции в клеточной коммуникации и передаче сигналов». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 275 (33): 25616–24. Дои:10.1074 / jbc.M000955200. ISSN  0021-9258. PMID  10827173.
10. Чанг, Дэвид Д; Хоанг Бао Q; Лю Дженни; Спрингер Тимоти А (март 2002 г.). «Молекулярная основа взаимодействия между альфа-PTB-доменом Icap1 и интегрином бета-1». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 277 (10): 8140–5. Дои:10.1074 / jbc.M109031200. ISSN  0021-9258. PMID  11741908.

дальнейшее чтение

• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Бувар D, Блок MR (1998). «Кальций / кальмодулин-зависимая протеинкиназа II контролирует опосредованную интегрином альфа5бета1 клеточную адгезию через белок-1альфа, связанный с цитоплазматическим доменом интегрина». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 252 (1): 46–50. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9592. PMID  9813144.
• Готтхардт М., Троммсдорф М., Невитт М.Ф. и др. (2000). «Взаимодействие семейства генов рецепторов липопротеинов низкой плотности с цитозольным адаптером и белками каркаса предполагает различные биологические функции в клеточной коммуникации и передаче сигналов». J. Biol. Chem. 275 (33): 25616–24. Дои:10.1074 / jbc.M000955200. PMID  10827173.
• Чжан Дж., Клаттербак Р. Э., Ригамонти Д. и др. (2002). «Взаимодействие между krit1 и icap1alpha приводит к нарушению ангиогенеза, опосредованного интегрином бета1, в патогенезе кавернозной мальформации головного мозга». Гм. Мол. Genet. 10 (25): 2953–60. Дои:10.1093 / hmg / 10.25.2953. PMID  11741838.
• Чанг Д.Д., Хоанг Б.К., Лю Дж., Спрингер Т.А. (2002). «Молекулярная основа взаимодействия между альфа-PTB-доменом Icap1 и интегрином бета-1». J. Biol. Chem. 277 (10): 8140–5. Дои:10.1074 / jbc.M109031200. PMID  11741908.
• Fournier HN, Dupé-Manet S, Bouvard D, et al. (2002). «Цитоплазматический домен интегрина-ассоциированный белок 1альфа (ICAP-1альфа) напрямую взаимодействует с супрессором метастазов nm23-H2, и оба белка нацелены на вновь образованные участки клеточной адгезии при взаимодействии с интегрином». J. Biol. Chem. 277 (23): 20895–902. Дои:10.1074 / jbc.M200200200. PMID  11919189.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). «Недооцененная роль надзора за РНК». Геном Биол. 5 (2): R8. Дои:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. ЧВК  395752. PMID  14759258.
• Ся Х, Нхо Р.С., Кам Дж. И др. (2004). «Киназа фокальной адгезии находится выше фосфатидилинозитол-3-киназы / Akt в регулировании выживания фибробластов в ответ на сокращение матриксов коллагена типа I через сигнальный путь жизнеспособности интегрина бета-1». J. Biol. Chem. 279 (31): 33024–34. Дои:10.1074 / jbc.M313265200. PMID  15166238.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Fournier HN, Dupé-Manet S, Bouvard D, et al. (2005). «Ядерная транслокация белка 1, связанного с цитоплазматическим доменом интегрина, стимулирует клеточную пролиферацию». Мол. Биол. Ячейка. 16 (4): 1859–71. Дои:10.1091 / mbc.E04-08-0744. HDL:2318/38098. ЧВК  1073667. PMID  15703214.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• О Дж. Х., Ян Дж., Хан И и др. (2006). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Мамм. Геном. 16 (12): 942–54. Дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID  16341674. S2CID  69278.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Строекен П.Дж., Альварес Б., Ван Рейнен Дж. И др. (2006). «Интегрин-ассоциированный с цитоплазматическим доменом белок-1 (ICAP-1) взаимодействует с киназой ROCK-I на плазматической мембране». J. Cell. Физиол. 208 (3): 620–8. Дои:10.1002 / jcp.20699. PMID  16741948. S2CID  23448867.
• Фурусу А., Накаяма К., Сюй К. и др. (2007). «MAP-киназа-зависимая, NF-kappaB-независимая регуляция ингибитора генов белка апоптоза с помощью TNF-альфа». J. Cell. Физиол. 210 (3): 703–10. Дои:10.1002 / jcp.20881. PMID  17133355. S2CID  84971749.