IFIT2 - IFIT2

IFIT2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4G1T
Идентификаторы
Псевдонимы	IFIT2, G10P2, GARG-39, IFI-54, IFI-54K, IFI54, IFIT-2, ISG-54 K, ISG-54K, ISG54, P54, cig42, интерферон-индуцированный белок с тетратрикопептидными повторами 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 147040 MGI: 99449 ГомолоГен: 1187 Генные карты: IFIT2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q23.31 Начните 89,283,694 бп[1] Конец 89,309,271 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 C1 Начните 34,550,694 бп[2] Конец 34,576,419 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • эндоплазматический ретикулум Биологический процесс • апоптотический процесс • положительная регуляция апоптотического процесса • ответ на вирус • врожденная иммунная система • защитный ответ на вирус • отрицательная регуляция связывания белков • апоптотические митохондриальные изменения • сигнальный путь интерферона I типа • клеточный ответ на интерферон-альфа • иммунная система Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3433	15958
Ансамбль	ENSG00000119922	ENSMUSG00000045932
UniProt	P09913	Q64112
RefSeq (мРНК)	NM_001547	NM_008332 NM_001355262
RefSeq (белок)	NP_001538	NP_032358 NP_001342191
Расположение (UCSC)	Chr 10: 89.28 - 89.31 Мб	Chr 19: 34,55 - 34,58 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Интерферон-индуцированный белок с тетратрикопептидными повторами 2 или IFIT2 это белок найден у людей, который кодируется IFIT2 ген.^[5][6][7]

Клиническое значение

IFIT2 может сыграть роль в предотвращении опухоль прогрессия.^[8] Действительно, было обнаружено, что ген IFIT2 постепенно подавляется в Вирус папилломы человека -положительный опухолевые кератиноциты происходит из шейки матки предопухолевые поражения на разных уровнях злокачественности.^[9] По этой причине этот ген, вероятно, связан с онкогенезом и может быть потенциальным прогностическим маркером шейки матки. предопухолевые поражения прогрессия.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000119922 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045932 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Wathelet MG, Szpirer J, Nols CB, Clauss IM, De Wit L, Islam MQ, Levan G, Horisberger MA, Content J, Szpirer C (ноябрь 1988 г.). «Клонирование и хромосомная локализация человеческих генов, индуцируемых интерфероном I типа». Somat Cell Mol Genet. 14 (5): 415–26. Дои:10.1007 / BF01534709. PMID  3175763. S2CID  42406993.
6. Уотелет М.Г., Клаус И.М., Content J, Huez GA (июнь 1988 г.). «Человеческие гены, индуцируемые интерфероном IFI-56K и IFI-54K, принадлежат к одному семейству генов». FEBS Lett. 231 (1): 164–71. Дои:10.1016/0014-5793(88)80724-5. PMID  3360121. S2CID  22937671.
7. «Ген Entrez: индуцированный интерфероном белок IFIT2 с тетратрикопептидными повторами 2».
8. Лай KC, Чанг KW, Лю CJ, Као SY, Ли TC (2008). «Индуцированный IFN белок с тетратрикопептидными повторами 2 ингибирует миграционную активность и увеличивает выживаемость плоскоклеточной карциномы полости рта». Мол. Рак Res. 6 (9): 1431–9. Дои:10.1158 / 1541-7786.MCR-08-0141. PMID  18819931.
9. Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа неопластических кератиноцитов шейки матки». J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. Дои:10.1002 / jcp.24808. PMID  25205602. S2CID  24986454.

дальнейшее чтение

• Lafage M, Clauss I, Couez D, Simonetti J, Wathelet MG, Huez G (1992). «Индуцируемые интерфероном и вирусом гены IFI-56K и IFI-54K расположены на хромосоме 10 человека в полосах q23-q24». Геномика. 13 (2): 458–60. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90272-Т. PMID  1377167.
• Уотелет М.Г., Клаусс И.М., Content J, Huez GA (1988). «Регулирование двух интерферон-индуцируемых генов человека интерфероном, поли (rI) .poly (rC) и вирусами». Евро. J. Biochem. 174 (2): 323–9. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1988.tb14101.x. PMID  2454816.
• Ulker N, Zhang X, Samuel CE (1988). «Механизм действия интерферона. I. Характеристика белка массой 54 кДа, индуцированного гамма-интерфероном, обладающего свойствами, аналогичными цитоскелетному компоненту». J. Biol. Chem. 262 (35): 16798–803. PMID  3119591.
• Леви Д., Ларнер А., Чаудхури А., Бабисс Л. Е., Дарнелл Дж. Э. (1987). «Интерферон-стимулированная транскрипция: выделение индуцибельного гена и идентификация его регуляторной области». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 83 (23): 8929–33. Дои:10.1073 / пнас.83.23.8929. ЧВК  387047. PMID  3466167.
• Чжу Х, Конг Дж. П., Шенк Т. (1998). «Использование анализа дифференциального дисплея для оценки влияния инфекции цитомегаловируса человека на накопление клеточных РНК: индукция интерферон-чувствительных РНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (25): 13985–90. Дои:10.1073 / пнас.94.25.13985. ЧВК  28419. PMID  9391139.
• Гаврилов Б.Г., Монастырская Г.С., Великодворская Т.В., Филюкова О.Б., Коновалова С.Н., Качко А.А., Протопопова Е.В., Николаев Л.Г., Локтев В.Б., Свердлов Е.Д. (2003). «[Поздняя активация индуцированных интерфероном генов IFI-54k и IFI-56k в клетках RH человека, инфицированных вирусом клещевого энцефалита]». Биоорг. Хим. 29 (2): 175–80. Дои:10.1023 / а: 1023260415910. PMID  12708317. S2CID  34300356.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Теренци Ф., Хуэй DJ, Меррик WC, Сен GC (2006). «Определенные модели индукции и функции двух тесно связанных интерферон-индуцируемых человеческих генов, ISG54 и ISG56». J. Biol. Chem. 281 (45): 34064–71. Дои:10.1074 / jbc.M605771200. PMID  16973618.
• Саха С., Сугумар П., Бхандари П., Рангараджан П.Н. (2006). «Идентификация генов, индуцируемых вирусом японского энцефалита, в мозге мышей и характеристика GARG39 / IFIT2 как белка, ассоциированного с микротрубочками». J. Gen. Virol. 87 (Пт 11): 3285–9. Дои:10.1099 / vir.0.82107-0. PMID  17030862.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.