HIST1H3B - HIST1H3B

HIST1H3B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3WKJ, 3B95, 2C1J, 3AYW, 3WA9, 3U4S, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3U31, 2UXN, 3AZK, 2C1N, 5C11, 3QO2, 3X1V, 5C13, 4A0J, 4U68, 5AV8, 4LLB, 3U5O, 1O9S, 4FT2, 4HON, 3W99, 3ZVY, 4Z0R, 5AVC, 1CT6, 1Q3L, 3O37, 3W97, 3SOW, 3КМТ, 4YM6, 4A7J, 3UEE, 2кВт, 4F4U, 3UEF, 3UIG, 4BD3, 3AZL, 4QBR, 4F56, 3AFA, 4ЛКА, 5CPK, 5FFV, 3V43, 5CH1, 3U5P, 3AZI, 3U5N, 3АЖ, 3UIK, 4QBQ, 1U35, 4UY4, 2OT7, 5AV9, 2B2W, 3U3D, 3AZF, 3W98, 4I51, 4X3K, 4FWF, 2B2T, 2B2V, 4A0N, 2кВтДж, 3WAA, 3QJ6, 5DAH, 3AZG, 3AZE, 3X1T, 3RIY, 2L75, 3A1B, 2VPG, 4QBS, 3O35, 5CPJ, 3ZG6, 4YM5, 3AZJ, 2RI7, 3AZN, 3AVR, 5CPI, 2LBM, 3W96, 3O34, 2M0O, 4L7X, 5CH2, 5AV6, 3AZM, 4UP0, 3X1S, 2OX0, 3UII, 3СОУ, 4N4H, 4TN7, 1CS9, 3X1U, 4LXL, 2Б2У, 2OQ6, 3RIG, 5C3I, 4YHP, 5B24, 5D6Y, 4YHZ, 4Z2M, 5HJD, 5HJC, 5HJB, 5B2I, 5HYN, 5FB0, 5FB1, 5IQL, 5B2J, 5JIN
Идентификаторы
Псевдонимы	HIST1H3B, H3 / l, H3FL, гистоновый кластер 1, H3b, гистоновый кластер 1, член семейства H3 b
Внешние идентификаторы	OMIM: 602819 MGI: 2448351 ГомолоГен: 136775 Генные карты: HIST1H3B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.2 Начинать 26,031,650 бп[1] Конец 26,032,060 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F2.1 Начинать 96,268,654 бп[2] Конец 96,269,141 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание гистонов • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • связывание кадгерина • связывание нуклеосомной ДНК Сотовый компонент • ядерная нуклеосома • мембрана • нуклеоплазма • хромосома • внеклеточная область • ядерная хромосома • внеклеточная экзосома • ядерная хромосома, теломерная область • нуклеосома • ядро клетки • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • теломерная организация • метаболический процесс клеточного белка • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • гетеротетрамеризация белков • коагуляция крови • Сборка нуклеосом, зависимая от репликации ДНК • регуляция сайленсинга генов • подавление хроматина на рДНК • отрицательная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • организация хроматина • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • сборка нуклеосом • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-7 • регуляция дифференцировки мегакариоцитов • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8358	319154
Ансамбль	ENSG00000274267	ENSMUSG00000074403
UniProt	P68431	P84228
RefSeq (мРНК)	NM_003537	NM_178215
RefSeq (белок)	NP_066298 NP_003520 NP_003525 NP_003527	NP_835511 NP_835510 NP_783584 NP_038576 NP_473386 NP_835734 NP_835512 NP_835587
Расположение (UCSC)	Chr 6: 26.03 - 26.03 Мб	Chr 3: 96,27 - 96,27 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон H3.1 это белок что у людей кодируется HIST1H3B ген.^[5][6][7]

Гистоны являются основными ядерными белками, которые отвечают за нуклеосомную структуру хромосомного волокна у эукариот. Эта структура состоит из приблизительно 146 п.н. ДНК, обернутой вокруг нуклеосомы, октамера, состоящего из пар каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4). Волокно хроматина дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкерного гистона H1 с ДНК между нуклеосомами с образованием структур хроматина более высокого порядка. Этот ген не имеет интронов и кодирует члена семейства гистонов H3. Транскрипты этого гена лишены полиА-хвостов; вместо этого они содержат палиндромный завершающий элемент. Этот ген находится в большом кластере гистоновых генов на хромосоме 6p22-p21.3.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000274267 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074403 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжун Р., Редер Р., Хайнц Н. (январь 1984 г.). «Первичная структура и экспрессия четырех клонированных гистоновых генов человека». Нуклеиновые кислоты Res. 11 (21): 7409–25. Дои:10.1093 / nar / 11.21.7409. ЧВК  326492. PMID  6647026.
6. Альбиг В., Киошис П., Поустка А., Меерганс К., Денеке Д. (апрель 1997 г.). «Организация гена гистонов человека: нерегулярное расположение в большом кластере». Геномика. 40 (2): 314–22. Дои:10.1006 / geno.1996.4592. PMID  9119399.
7. Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (октябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID  12408966.
8. «Энтрез Ген: HIST1H3B гистоновый кластер 1, H3b».

дальнейшее чтение

• Альбиг В., Кардалину Э., Драбент Б. и др. (1991). «Изоляция и характеристика двух гистоновых генов человека H1 в кластерах основных гистоновых генов». Геномика. 10 (4): 940–8. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90183-Ф. PMID  1916825.
• Мараши Ф., Хелмс С., Шилс А. и др. (1986). «Усиленная экспрессия прокариотических и эукариотических генов с использованием 5 'регуляторных последовательностей гистонового гена человека». Biochem. Cell Biol. 64 (4): 277–89. Дои:10.1139 / o86-039. PMID  3013246.
• Охе Y, Иваи К. (1982). «Гистон H3 селезенки человека. Выделение и аминокислотная последовательность». J. Biochem. 90 (4): 1205–11. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a133573. PMID  7309716.
• Kardalinou E, Eick S, Albig W, Doenecke D (1993). «Ассоциация гена гистона H1 человека с псевдогеном H2A и генами, кодирующими гистоны H2B.1 и H3.1». J. Cell. Биохим. 52 (4): 375–83. Дои:10.1002 / jcb.240520402. PMID  8227173. S2CID  42454232.
• Альбиг В., Меерганс Т., Денеке Д. (1997). «Характеристика гена H1.5 завершает набор генов подтипа H1 человека». Ген. 184 (2): 141–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00582-3. PMID  9031620.
• Альбиг В., Доенеке Д. (1998). «Кластер гистоновых генов человека в локусе D6S105». Гм. Genet. 101 (3): 284–94. Дои:10.1007 / s004390050630. PMID  9439656. S2CID  38539096.
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транскрипционная активация интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека, ассоциированного с хроматином». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.
• Гото Х, Томоно Й, Аджиро К. и др. (1999). «Идентификация нового сайта фосфорилирования на гистоне H3 в сочетании с конденсацией митотической хромосомы». J. Biol. Chem. 274 (36): 25543–25549. Дои:10.1074 / jbc.274.36.25543. PMID  10464286.
• Hsu JY, Sun ZW, Li X и др. (2000). «Митотическое фосфорилирование гистона H3 регулируется Ipl1 / aurora киназой и Glc7 / PP1 фосфатазой у почкующихся дрожжей и нематод». Клетка. 102 (3): 279–91. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00034-9. PMID  10975519. S2CID  16057773.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами» (PDF). Вирусология. 277 (2): 278–295. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476. S2CID  20145752.
• Лахнер М., О'Кэрролл Д., Ри С. и др. (2001). «Метилирование гистона H3 лизином 9 создает сайт связывания для белков HP1». Природа. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001 Натур.410..116л. Дои:10.1038/35065132. PMID  11242053. S2CID  4331863.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Ян Л., Ся Л., Ву Д.Й. и др. (2002). «Молекулярное клонирование ESET, новой гистон-H3-специфической метилтрансферазы, которая взаимодействует с фактором транскрипции ERG». Онкоген. 21 (1): 148–52. Дои:10.1038 / sj.onc.1204998. PMID  11791185.
• Гото Х, Ясуи Й, Нигг Э.А., Инагаки М (2002). «Аврора-B фосфорилирует гистон H3 по серину 28 в отношении конденсации митотических хромосом». Гены Клетки. 7 (1): 11–7. Дои:10.1046 / j.1356-9597.2001.00498.x. PMID  11856369. S2CID  23717416.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Пройсс У., Ландсберг Г, Шайдтманн К.Х. (2003). «Новое митоз-специфическое фосфорилирование гистона H3 по Thr11, опосредованное киназой Dlk / ZIP». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (3): 878–85. Дои:10.1093 / nar / gkg176. ЧВК  149197. PMID  12560483.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–811. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P68431 (Гистон H3.1) на PDBe-KB.