HERC1 - HERC1

HERC1
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4O2W, 4QT6
Идентификаторы
Псевдонимы	HERC1, p532, p619, домен HECT и RLD, содержащий член 1 семейства убиквитин протеинлигаз E3, MDFPMR
Внешние идентификаторы	OMIM: 605109 MGI: 2384589 ГомолоГен: 31207 Генные карты: HERC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q22.31 Начинать 63,608,618 бп[1] Конец 63,833,948 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 С Начинать 66,350,450 бп[2] Конец 66,508,775 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность убиквитин-протеинтрансферазы • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • ARF активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • трансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • аппарат Гольджи • мембрана Биологический процесс • дифференцировка клеток Пуркинье мозжечка • отрицательная регуляция аутофагии • развитие проекции нейрона • убиквитинирование белков • нервно-мышечный процесс, контролирующий баланс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8925	235439
Ансамбль	ENSG00000103657	ENSMUSG00000038664
UniProt	Q15751	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_003922	NM_145617
RefSeq (белок)	NP_003913	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 15: 63,61 - 63,83 Мб	Chr 9: 66,35 - 66,51 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Вероятная E3-убиквитин-протеинлигаза HERC1 является фермент что у людей кодируется HERC1 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, стимулирует обмен гуаниновых нуклеотидов на белках ARF1 и Rab. Считается, что этот белок участвует в процессах мембранного транспорта.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103657 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038664 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Роза Дж. Л., Касароли-Марано Р. П., Баклер А. Дж., Виларо С., Барбацид М. (декабрь 1996 г.). «p619, гигантский белок, связанный с регулятором хромосомной конденсации RCC1, стимулирует обмен гуаниновых нуклеотидов на ARF1 и Rab белках». EMBO J. 15 (16): 4262–73. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00801.x. ЧВК  452152. PMID  8861955.
6. Rosa JL, Barbacid M (август 1997 г.). «Гигантский белок, который стимулирует обмен гуаниновых нуклеотидов на белках ARF1 и Rab, образует цитозольный тройной комплекс с клатрином и Hsp70». Онкоген. 15 (1): 1–6. Дои:10.1038 / sj.onc.1201170. PMID  9233772.
7. «Ген Entrez: домен HERC1 hect (гомологичный карбоксильному концу E6-AP (UBE3A)) и RCC1 (CHC1) -подобный домен (RLD) 1».

дальнейшее чтение

• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Гарсия-Гонсало FR, Бартронс Р., Вентура Ф., Роза Дж. Л. (2005). «Необходимость фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата для HERC1-опосредованного высвобождения гуаниновых нуклеотидов из белков ARF». FEBS Lett. 579 (2): 343–8. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.11.095. PMID  15642342.
• Гарсия-Гонсало FR, Муньос П., Гонсалес Э. и др. (2004). «Гигантский белок HERC1 рекрутируется в вызванные фторидом алюминия выступы на поверхности, богатые актином, в клетках HeLa». FEBS Lett. 559 (1–3): 77–83. Дои:10.1016 / S0014-5793 (04) 00030-4. PMID  14960311.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Гарсия-Гонсало FR, Крус С., Муньос П. и др. (2003). «Взаимодействие между HERC1 и пируваткиназой M2-типа». FEBS Lett. 539 (1–3): 78–84. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00205-9. PMID  12650930.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Круз С., Паладугу А., Вентура Ф. и др. (1999). «Отнесение гена P532 человека (HERC1) к хромосоме 15q22 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 86 (1): 68–9. Дои:10.1159/000015414. PMID  10516438.
• Ji Y, Walkowicz MJ, Buiting K и др. (1999). «Предковый ген транскрибируемых низкокопийных повторов в области Прадера-Вилли / Ангельмана кодирует большой белок, участвующий в транспортировке белков, который отсутствует у мышей с нейромышечными и спермиогенными аномалиями». Гм. Мол. Genet. 8 (3): 533–42. Дои:10,1093 / чмг / 8,3,533. PMID  9949213.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.