HDLBP - HDLBP

HDLBP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1VIG, 1VIH, 2CTE, 2CTF, 2CTJ, 2CTK, 2CTL, 2CTM
Идентификаторы
Псевдонимы	HDLBP, HBP, PRO2900, VGL, липопротеин-связывающий белок высокой плотности
Внешние идентификаторы	OMIM: 142695 MGI: 99256 ГомолоГен: 38035 Генные карты: HDLBP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q37.3 Начинать 241,227,264 бп[1] Конец 241,317,061 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 D | 1 47,24 см Начинать 93,405,940 бп[2] Конец 93,478,815 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание липидов • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК • связывание кадгерина Сотовый компонент • клеточная мембрана • ядро клетки • частица липопротеинов высокой плотности • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • липидный обмен • стероидный метаболический процесс • липидный транспорт • метаболический процесс холестерина • клиренс липопротеинов высокой плотности • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3069	110611
Ансамбль	ENSG00000115677	ENSMUSG00000034088
UniProt	Q00341	Q8VDJ3
RefSeq (мРНК)	NM_001243900 NM_005336 NM_203346 NM_001320965 NM_001320966 NM_001320967	NM_001301364 NM_133808 NM_001357556
RefSeq (белок)	NP_001230829 NP_001307894 NP_001307895 NP_001307896 NP_005327 NP_976221	NP_001288293 NP_598569 NP_001344485
Расположение (UCSC)	Chr 2: 241.23 - 241.32 Мб	Chr 1: 93.41 - 93.48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Виджилин составляет 110 кДа белок что у людей кодируется HDLBP ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115677 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034088 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Макнайт Г.Л., Ризонер Дж., Гилберт Т., Сандквист К.О., Хокланд Б., МакКернан П.А., Шампань Дж., Джонсон С.Дж., Бейли М.С., Холли Р. и др. (Июль 1992 г.). «Клонирование и экспрессия клеточного липопротеинсвязывающего белка высокой плотности, который регулируется нагрузкой клеток холестерином». J Biol Chem. 267 (17): 12131–41. PMID  1318310.
6. Xia YR, Klisak I., Sparkes RS, Oram J, Lusis AJ (июль 1993 г.). «Локализация гена липопротеин-связывающего белка высокой плотности (HDLBP) на хромосоме 2q37 человека». Геномика. 16 (2): 524–5. Дои:10.1006 / geno.1993.1221. PMID  8390966.
7. «Ген Entrez: липопротеин-связывающий белок высокой плотности HDLBP (вигилин)».

дальнейшее чтение

• Андерсон Н.Л., Андерсон Н.Г. (2003). «Протеом плазмы человека: история, характер, диагностические перспективы». Мол. Клетка. Протеомика. 1 (11): 845–67. Дои:10.1074 / mcp.R200007-MCP200. PMID  12488461.
• Грэм Д.Л., Орам Дж. Ф. (1987). «Идентификация и характеристика липопротеин-связывающего белка высокой плотности в клеточных мембранах с помощью блоттинга лигандов». J. Biol. Chem. 262 (16): 7439–42. PMID  3034894.
• Пленц Г., Кюглер С., Шнитгер С. и др. (1994). «Ген вигилина человека: идентификация, хромосомная локализация и образец экспрессии». Гм. Genet. 93 (5): 575–82. Дои:10.1007 / BF00202827. PMID  8168838. S2CID  25536273.
• Neu-Yilik G, Zorbas H, Gloe TR, et al. (1993). «Виджилин - это цитоплазматический белок. Исследование его экспрессии в первичных клетках и в установленных клеточных линиях различных видов». Евро. J. Biochem. 213 (2): 727–36. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb17813.x. PMID  8477745.
• Кюглер С., Грюнвеллер А., Пробст С. и др. (1996). «Вигилин содержит функциональную последовательность ядерной локализации и присутствует как в цитоплазме, так и в ядре». FEBS Lett. 382 (3): 330–4. Дои:10.1016/0014-5793(96)00204-9. PMID  8605996. S2CID  42740112.
• Kügler S, Plenz G, Müller PK (1996). «Два дополнительных 5 'экзона в гене Vigilin человека отличают его от гена курицы и обеспечивают структурную основу для дифференциальных путей экспрессии гена». Евро. J. Biochem. 238 (2): 410–7. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0410z.x. PMID  8681952.
• Chiu DS, Oram JF, LeBoeuf RC и др. (1998). «Липопротеин-связывающий белок высокой плотности (HBP) / вигилин экспрессируется в атеросклеротических поражениях человека и колокализуется с аполипопротеином E.». Артериосклер. Тромб. Васк. Биол. 17 (11): 2350–8. Дои:10.1161 / 01.ATV.17.11.2350. PMID  9409201.
• Kruse C, Willkomm DK, Grünweller A, et al. (2000). «Экспорт и транспорт тРНК связаны с мультибелковым комплексом». Biochem. J. 346 (Pt 1): 107–15. Дои:10.1042/0264-6021:3460107. ЧВК  1220829. PMID  10657246.
• Бочаров А.В., Вишнякова Т.Г., Баранова И.Н. и др. (2001). «Характеристика человеческого связывающего липопротеин высокой плотности белка с высоким сродством 95 кДа». Биохимия. 40 (14): 4407–16. Дои:10.1021 / bi001503k. PMID  11284697.
• Вистоу Г., Бернштейн С.Л., Рэй С. и др. (2002). «Анализ экспрессируемых последовательностей радужной оболочки глаза взрослого человека для проекта NEIBank: факторы стероидного ответа и сходство с пигментным эпителием сетчатки». Мол. Vis. 8: 185–95. PMID  12107412.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Адкинс Дж. Н., Варнум С. М., Обери К. Дж. И др. (2003). «К протеому сыворотки крови человека: анализ методом многомерного разделения в сочетании с масс-спектрометрией». Мол. Клетка. Протеомика. 1 (12): 947–55. Дои:10.1074 / mcp.M200066-MCP200. PMID  12543931.
• Goolsby KM, Shapiro DJ (2003). «РНКи-опосредованное истощение белка домена 15 KH, вигилина, индуцирует гибель делящихся и неделящихся клеток человека, но изначально не ингибирует синтез белка». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (19): 5644–53. Дои:10.1093 / нар / gkg768. ЧВК  206468. PMID  14500828.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Воллбрандт Т., Уиллкомм Д., Стоссберг Н., Круз С. (2004). «Видилин локализован вместе с 80S рибосомами и связывается с рибосомным комплексом через свой С-концевой домен». Int. J. Biochem. Cell Biol. 36 (7): 1306–18. Дои:10.1016 / j.biocel.2003.11.006. PMID  15109574.
• Колланд Ф., Жак Х, Троплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.