Глипикан 1 - Glypican 1

GPC1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4ACR, 4AD7, 4BWE, 4YWT
Идентификаторы
Псевдонимы	GPC1, глипикан, Глипикан 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600395 MGI: 1194891 ГомолоГен: 20477 Генные карты: GPC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q37.3 Начните 240,435,663 бп[1] Конец 240,468,076 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 Д Начните 92,831,645 бп[2] Конец 92,860,779 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фактора роста фибробластов • гепарансульфат связывание протеогликанов • связывание ионов меди • связывание ламинина Сотовый компонент • эндосома • мембрана • неотъемлемый компонент плазматической мембраны • просвет лизосомы • Просвет Гольджи • мембранный плот • закрепленный компонент мембраны • внеклеточная экзосома • внеклеточный • нуклеоплазма • цитозоль • клеточная мембрана • внеклеточный матрикс • внеклеточная область • внутренний компонент плазматической мембраны • синапс • закрепленный компонент плазматической мембраны • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс • поверхность клетки Биологический процесс • метаболический процесс гликозаминогликанов • миелиновая сборка • гепарансульфат, протеогликановый катаболический процесс • ретиноидный метаболический процесс • управление аксоном • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора фактора роста фибробластов • положительная регуляция дифференцировки клеток скелетных мышц • катаболический процесс гликозаминогликанов • процесс биосинтеза гликозаминогликанов • Дифференцировка шванновских клеток • миграция лейкоцитов • регулирование передачи сигнала • миграция клеток • регулирование локализации белка на мембране Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2817	14733
Ансамбль	ENSG00000063660	ENSMUSG00000034220
UniProt	P35052	Q9QZF2
RefSeq (мРНК)	NM_002081	NM_016696
RefSeq (белок)	NP_002072	NP_057905
Расположение (UCSC)	Chr 2: 240,44 - 240,47 Мб	Chr 1: 92,83 - 92,86 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Глипикан-1 это белок что у людей кодируется GPC1 ген.^[5][6]

Функция

Гепарансульфат клеточной поверхности протеогликаны состоят из ассоциированного с мембраной белкового ядра, замещенного переменным числом гепарансульфатных цепей. Члены глипикан родственные интегральные мембранные протеогликаны семейства (GRIPS) содержат ядерный белок, прикрепленный к цитоплазматической мембране через гликозилфосфатидилинозитол связь. Эти белки могут играть роль в контроле клеточного деления и регуляции роста.^[6]

Взаимодействия

Глипикан 1 был показан взаимодействовать с участием SLIT2.^[7]

Клиническое значение

Этот белок участвует в неправильном свертывании нормального прион белки клеточной мембраны в инфекционную прионную форму.^[8]

В 2015 году сообщалось, что присутствие этого белка в экзосомы в крови пациентов может рано обнаруживать панкреатический рак с абсолютной специфичностью и чувствительностью.^[9] Однако этот вывод оспаривается.^[10] и в более поздних обзорах потенциальных маркеров рака поджелудочной железы Глипикан 1 не упоминается.^[11][12]

Смотрите также

• Глипикан

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000063660 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034220 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Vermeesch JR, Mertens G, David G, Marynen P (июль 1995 г.). «Отнесение гена глипикана человека (GPC1) к 2q35-q37 путем флуоресцентной гибридизации in situ». Геномика. 25 (1): 327–9. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80152-С. PMID  7774946.
6. «Энтрез Ген: GPC1 глипикан 1».
7. Ронка Ф, Андерсен Дж. С., Паеч В., Марголис РУ (август 2001 г.). «Характеристика взаимодействия белка Slit с глипиканом-1». J. Biol. Chem. 276 (31): 29141–7. Дои:10.1074 / jbc.M100240200. PMID  11375980.
8. Тейлор Д. Р., Уайтхаус И. Дж., Хупер Н. М. (ноябрь 2009 г.). «Глипикан-1 опосредует как ассоциацию прионного белка с липидным рафтом, так и образование изоформы болезни». Патогены PLOS. 5 (11): e1000666. Дои:10.1371 / journal.ppat.1000666. ЧВК  2773931. PMID  19936054.
9. Melo SA, Luecke LB, Kahlert C, Fernandez AF, Gammon ST, Kaye J, LeBleu VS, Mittendorf EA, Weitz J, Rahbari N, Reissfelder C, Pilarsky C, Fraga MF, Piwnica-Worms D, Kalluri R (июль 2015 г.) . «Глипикан-1 идентифицирует экзосомы рака и обнаруживает рак поджелудочной железы на ранней стадии». Природа. 523 (7559): 177–82. Дои:10.1038 / природа14581. ЧВК  4825698. PMID  26106858.
10. Обсуждения на www.pubpeer.com; https://pubpeer.com/publications/70714D8ACB8F13164A2752B4335F38#fb119888
11. Balasenthil S, Huang Y, Liu S, Marsh T, Chen J, Stass SA, KuKuruga D, Brand R, Chen N, Frazier ML, Jack Lee J, Srivastava S, Sen S, McNeill Killary A (август 2017 г.). «Панель плазменных биомаркеров для выявления хирургически резектабельного рака поджелудочной железы на ранней стадии». Журнал Национального института рака. 109 (8). Дои:10.1093 / jnci / djw341. ЧВК  6059209. PMID  28376184.
12. Чанг Дж. К., Кундранда М. (март 2017 г.). «Новые диагностические и прогностические биомаркеры аденокарциномы поджелудочной железы». Международный журнал молекулярных наук. 18 (3): 667. Дои:10.3390 / ijms18030667. ЧВК  5372679. PMID  28335509.

дальнейшее чтение

• Картикеян Л; Maurel P; Rauch U; и другие. (1992). «Клонирование главного протеогликана гепарансульфата из мозга и идентификация как крысиная форма глипикана». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 188 (1): 395–401. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 92398-H. PMID  1417860.
• Дэвид Джи; Lories V; Декок B; и другие. (1991). «Молекулярное клонирование закрепленного на фосфатидилинозите мембранного гепарансульфат протеогликана из фибробластов легких человека». J. Cell Biol. 111 (6, часть 2): 3165–76. Дои:10.1083 / jcb.111.6.3165. ЧВК  2116352. PMID  2148568.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Suzuki Y; Ёситомо-Накагава К.; Маруяма К; и другие. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Kleeff J; Ishiwata T; Кумбасар А; и другие. (1998). «Гепарансульфат протеогликан-1 на клеточной поверхности регулирует действие фактора роста в клетках карциномы поджелудочной железы и сверхэкспрессируется при раке поджелудочной железы человека». J. Clin. Вкладывать деньги. 102 (9): 1662–73. Дои:10.1172 / JCI4105. ЧВК  509114. PMID  9802880.
• Генгринович С; Берман Б; Дэвид Джи; и другие. (1999). «Глипикан-1 представляет собой протеогликан, связывающий VEGF165, который действует как внеклеточный шаперон для VEGF165». J. Biol. Chem. 274 (16): 10816–22. Дои:10.1074 / jbc.274.16.10816. PMID  10196157.
• Liang Y; Annan RS; Carr SA; и другие. (1999). «Гомологи млекопитающих щелевого белка Drosophila являются лигандами гепарансульфатного протеогликана глипикана-1 в мозге». J. Biol. Chem. 274 (25): 17885–92. Дои:10.1074 / jbc.274.25.17885. PMID  10364234.
• Шофилд КП, Галлахер Дж. Т., Дэвид Г. (2000). «Экспрессия белков ядра протеогликана в строме костного мозга человека». Biochem. J. 343 Pt 3 (3): 663–8. Дои:10.1042/0264-6021:3430663. ЧВК  1220599. PMID  10527946.
• Каруманчи С.А.; Jha V; Рамчандран Р; и другие. (2001). «Глипиканы клеточной поверхности представляют собой рецепторы эндостатина с низким сродством» (PDF). Мол. Ячейка. 7 (4): 811–22. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00225-8. PMID  11336704.
• Matsuda K; Маруяма Х; Guo F; и другие. (2001). «Глипикан-1 сверхэкспрессируется при раке груди человека и модулирует митогенные эффекты множества гепарин-связывающих факторов роста в клетках рака груди». Рак Res. 61 (14): 5562–9. PMID  11454708.
• Альварес К., Фадич Р., Брандан Е. (2002). «Расширенный синтез и дифференциальная локализация протеогликанов гепарансульфата при мышечной дистрофии Дюшенна». J. Cell. Биохим. 85 (4): 703–13. Дои:10.1002 / jcb.10184. PMID  11968010. S2CID  20243469.
• Дин К; Mani K; Cheng F; и другие. (2002). «Медьзависимое автоотщепление гепарансульфата глипикан-1 оксидом азота, полученным из собственных нитрозотиолов». J. Biol. Chem. 277 (36): 33353–60. Дои:10.1074 / jbc.M203383200. PMID  12084716.
• Штраусберг Р.Л .; Feingold EA; Рябчик LH; и другие. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Бельтинг М; Mani K; Jönsson M; и другие. (2004). «Глипикан-1 является средством для захвата полиамина в клетках млекопитающих: ключевую роль оксида азота, производного от нитрозотиола». J. Biol. Chem. 278 (47): 47181–9. Дои:10.1074 / jbc.M308325200. PMID  12972423.
• Ота Т; Suzuki Y; Nishikawa T; и другие. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Watanabe N; Araki W; Чуйский DH; и другие. (2004). «Глипикан-1 как Abeta-связывающий HSPG в мозге человека: его локализация в доменах DIG и возможные роли в патогенезе болезни Альцгеймера». FASEB J. 18 (9): 1013–5. Дои:10.1096 / fj.03-1040fje. PMID  15084524. S2CID  83560098.
• Ли Дж; Kleeff J; Kayed H; и другие. (2004). «Антисмысловая трансфекция Glypican-1 модулирует TGF-бета-зависимую передачу сигналов в клетках рака поджелудочной железы Colo-357». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 320 (4): 1148–55. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.06.063. PMID  15249209.
• Дэвис EJ; Блэкхолл Ф.Х .; Шанкс JH; и другие. (2005). «Распространение и клиническое значение протеогликанов гепарансульфата при раке яичников». Clin. Рак Res. 10 (15): 5178–86. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-03-0103. PMID  15297422.