GNPDA1 - GNPDA1

GNPDA1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1NE7
Идентификаторы
Псевдонимы	GNPDA1, GNP1, GNPDA, GNPI, GPI, HLN, глюкозамин-6-фосфат дезаминаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601798 MGI: 1347054 ГомолоГен: 38054 Генные карты: GNPDA1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q31.3 Начните 141,991,749 бп[1] Конец 142,013,041 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 18 (мышь)[2] Группа 18 | 18 B3 Начните 38,327,535 бп[2] Конец 38,339,003 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • активность глюкозамин-6-фосфатдезаминазы • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • цитозоль • цитоплазма Биологический процесс • Метаболический процесс N-ацетилглюкозамина • производство метаболитов-предшественников и энергии • однократное оплодотворение • катаболический процесс глюкозамина • углеводный обмен • Катаболический процесс N-ацетилглюкозамина • Процесс биосинтеза UDP-N-ацетилглюкозамина • Катаболический процесс N-ацетилнейрамината Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10007	26384
Ансамбль	ENSG00000113552	ENSMUSG00000052102
UniProt	P46926	O88958
RefSeq (мРНК)	NM_005471	NM_011937
RefSeq (белок)	NP_005462	NP_036067
Расположение (UCSC)	Chr 5: 141.99 - 142.01 Мб	Chr 18: 38.33 - 38.34 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Глюкозамин-6-фосфат-изомераза 1 является фермент что у людей кодируется GNPDA1 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113552 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052102 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шевченко В., Хогбен М., Эконг Р., Паррингтон Дж., Лай Ф.А. (октябрь 1998 г.). «Ген глюкозамин-6-фосфат-дезаминазы человека: клонирование и экспрессия кДНК, геномная организация и хромосомная локализация». Ген. 216 (1): 31–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (98) 00335-7. PMID  9714720.
6. Wolosker H, Kline D, Bian Y, Blackshaw S, Cameron AM, Fralich TJ, Schnaar RL, Snyder SH (февраль 1998 г.). «Молекулярно клонированная глюкозамин-6-фосфатдезаминаза млекопитающих локализована в транспортном эпителии и лишена осциллиновой активности». FASEB J. 12 (1): 91–9. Дои:10.1096 / fasebj.12.1.91. PMID  9438414.
7. «Энтрез Ген: GNPDA1 глюкозамин-6-фосфат дезаминаза 1».

дальнейшее чтение

• Weidanz JA, Campbell P, DeLucas LJ и др. (1995). «Глюкозамин 6-фосфат дезаминаза в нормальных эритроцитах человека». Br. J. Haematol. 91 (1): 72–9. Дои:10.1111 / j.1365-2141.1995.tb05247.x. PMID  7577655. S2CID  31559803.
• Номура Н., Нагасе Т., Миядзима Н. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. II. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0041-KIAA0080), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 1 (5): 223–9. Дои:10.1093 / днарес / 1.5.223. PMID  7584044.
• Олива Г., Фонтес М.Р., Гарратт Р.С. и др. (1996). «Структура и каталитический механизм глюкозамин-6-фосфатдезаминазы из Escherichia coli при разрешении 2,1 A». Структура. 3 (12): 1323–32. Дои:10.1016 / S0969-2126 (01) 00270-2. HDL:11449/64662. PMID  8747459.
• Накамура Ю., Миура К., Фуджино Ю. и др. (2001). «Эволюция, структура и экспрессия ортологичных генов GNPI / Oscillin». Геномика. 68 (2): 179–86. Дои:10.1006 / geno.2000.6287. PMID  10964516.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжан Дж., Чжан В., Цзоу Д. и др. (2003). «Клонирование и функциональная характеристика GNPI2, нового человеческого гомолога глюкозамин-6-фосфат-изомеразы / осциллина». J. Cell. Биохим. 88 (5): 932–40. Дои:10.1002 / jcb.10444. PMID  12616532. S2CID  24448482.
• Арреола Р., Вальдеррама Б., Моранте М.Л., Хорхалес Э (2003). «Две глюкозамин-6-фосфат дезаминазы млекопитающих: структурное и генетическое исследование». FEBS Lett. 551 (1–3): 63–70. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00896-2. PMID  12965206. S2CID  45050024.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Шмутц Дж., Мартин Дж., Терри А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 5 человека». Природа. 431 (7006): 268–74. Дои:10.1038 / природа02919. PMID  15372022.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

внешняя ссылка

• GNPDA1 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• GNPDA1 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.