Fimbriimonas ginsengisoli - Fimbriimonas ginsengisoli

Fimbriimonas ginsengisoli
Научная классификация
Домен:
Тип:
Класс:
Порядок:
Семья:
Род:
Виды:
F. ginsengisoli
Биномиальное имя
Fimbriimonas ginsengisoli
Ван-Таек Им и др. 2012 г.

Fimbriimonas ginsengisoli это Грамотрицательные бактерии а также первый представитель нового класса Фимбримонадия в пределах филума Арматимонадеты. В Арматимонадеты ранее были известны как кандидатный тип OP10. OP10 состоял исключительно из последовательностей клона гена 16S рРНК окружающей среды до F. ginsengisoli's родственник, Armatimonas rosea's открытие.

Открытие

F. ginsengisoli был первоначально выделен из образца почвы с поля женьшеня в провинции Почеон, Южная Корея. Культивирование проводили на агаре R2A половинной концентрации.

Родные

Последовательности гена 16S рРНК из окружающей среды, принадлежащие к типу Арматимонадеты в настоящее время разделены на шесть групп. Группы 2, 5 и 6 состоят исключительно из последовательностей. Группа 1 содержит Armatimonadetes rosea, Группа 3 содержит Chthonomonadetes calidirosea, а группа 4 содержит Fimbriimonas ginsengisoli.

Fimbriimonas ginsengisoli Im et al. 2012 г.

Armatimonas rosea Тамаки и др. 2011 г.

Chthonomonas calidirosea Ли и др. 2011 г.

Chthonomonas calidirosea штамм T49T, ан аэробный Сахаролитическая, облигатно термофильная, подвижная, неспорообразующая бактерия была выделена из геотермически нагретой почвы у Врат Ада, Тикитере, Новая Зеландия. Это первый представитель нового класса в типе Арматимонадеты. Он представляет собой первого культурного представителя Chthonomonadetes, соответствующая 3-й группе филума Арматимонадеты.

Armatimonas rosea ан аэробный, Грамотрицательная, розовая пигментированная, неподвижная, яйцевидная / палочковидная бактерия, была выделена из ризоплана водного растения. Phragmites australis в Японии. Это первый представитель филума Арматимонадеты.

Характеристики

При выращивании на половинной концентрации R2A колонии имели пигмент цвета слоновой кости, округлые, выпуклые, содержали жирную поверхность, сильно слизистые и были относительно небольшими (1-2 мм) по размеру после двух недель инкубации при 30 ° C. F. ginsengisoli имеет оптимальную температуру 30 ° C с диапазоном 15-30 ° C. Оптимальный pH для роста был 7,0 с диапазоном 6,0-8,5. Дополнительного NaCl для роста не требовалось, но допустимы концентрации до 1%.

При рассмотрении фазовый контраст клетки, полученные с помощью просвечивающей электронной микроскопии, были неподвижными, стержневидными, с размерами от 0,5-0,7 мкм в ширину и 2,5-5,0 мкм в длину. F. ginsengisoli несли перитрихозные фибриллы, которые были очень тонкими и волосатыми и выступали из клеточной стенки. Спорообразования не наблюдалось.

При исследовании в среде с половиной R2A культуры F. ginsengisoli наблюдались строго аэробные, без признаков роста в анаэробных условиях. Он отрицательный для теста на оксидазу, но положительный для теста на каталазу. Он не мог использовать большинство протестированных субстратов в качестве единственного источника углерода, но мог использовать пептон, казаминовые кислоты или дрожжевой экстракт в качестве единственных источников углерода. Штамм не разрушал ДНК, крахмал, ксилан или целлюлозу.

использованная литература

1. Тамаки, Хидеюки и др. «Armatimonas rosea gen. Nov., Sp. Nov., Нового бактериального типа, Armatimonadetes phyl. Nov., Формально названного кандидатным типом OP10». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии 61.6 (2011): 1442-1447.http://ijs.sgmjournals.org/content/61/6/1442.short

2. Ли, Кевин С.Й. и др. «Chthonomonas calidirosea gen. Nov., Sp. Nov., Аэробный, пигментированный, термофильный микроорганизм нового класса бактерий, Chthonomonadetes classis nov., Недавно описанного филума Armatimonadetes, первоначально обозначенного как подразделение-кандидат OP10». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии 61.10 (2011): 2482-2490.http://ijsb.sgmjournals.org/content/61/10/2482.short

3. Им, Ван-Тэк и др. "Описание Fimbriimonas ginsengisoli gen. Nov., Sp. Nov. В пределах класса Fimbriimonadia nov., Филума Armatimonadetes". Антони ван Левенгук (2012): 1-11. https://doi.org/10.1007%2Fs10482-012-9739-6