Faecalibacterium - Faecalibacterium

Faecalibacterium
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Тип:
Фирмикуты
Класс:
Clostridia
Заказ:
Clostridiales
Семья:
Ruminococcaceae
Род:
Faecalibacterium

Дункан и др., 2002 г.
Разновидность:
F. prausnitzii
Биномиальное имя
Faecalibacterium prausnitzii
(Hauduroy et al., 1937) Duncan et al., 2002

Faecalibacterium это род бактерий. Его единственный известный вид, Faecalibacterium prausnitzii грамположителен,[1] мезофильный, палочковидный,[2] анаэробный[3] и является одним из самых распространенных и важных комменсальные бактерии человека кишечная микробиота. Он не вызывает спор и неподвижен.[4] Эти бактерии производят бутират и другие короткоцепочечные жирные кислоты через ферментацию пищевые волокна.

История

Ранее считался членом Фузобактерии, бактерия названа в честь немецкого бактериолога Отто Праусниц. В 2002 году его предложили реклассифицировать как собственный род, Faecalibacterium, содержащий виды Faecalibacterium prausnitzii, поскольку филогенетический анализ изолятов показал, что он только отдаленно связан с Фузобактерии, и более близкий член Клостридий кластер IV.[5]

Генетика

Faecalibacterium prausnitzii имеет геном длиной 2 868 932 п.н. и содержание GC 56,9%. Обнаружено, что бактерия имеет 2707 кодирующих последовательностей, включая 77 РНК, кодирующих гены.[6] Реконструировано 128 метаболических путей, а также 27 белковых комплексов и 64 тРНК.[7] Филогенетически штаммы F. prausnitzii сочинять филогруппы I и II. Большинство новых изолятов этого вида, выделенных М. Tanweer Khan, относятся к филогруппе II.[8] Белок, продуцируемый этой бактерией, оказывает противовоспалительное действие.[9]

Клиническая значимость

У здоровых взрослых Faecalibacterium prausnitzii представляют более 5% бактерий в кишечнике, что делает его одной из самых распространенных кишечных бактерий. Помимо прочего, он укрепляет иммунную систему.[10] Более низкий, чем обычно, уровень F. prausnitzii в кишечнике были связаны с болезнь Крона, ожирение, астма и сильное депрессивное расстройство,[11][12][13][14]и более высокие, чем обычно, уровни были связаны с псориазом.[15]

Воспалительное заболевание кишечника

При болезни Крона по состоянию на 2015 г. в большинстве исследований (за одним исключением) было обнаружено снижение уровня F. prausnitzii;[16] это было обнаружено как в образцах фекалий, так и в образцах слизистых оболочек.[17] Однако это привередливый организм чувствителен к кислороду и с трудом доставляется в кишечник.[17]

Эксклюзивное энтеральное питание, которое, как известно, вызывает ремиссию при болезни Крона, снижает F. prausnitzii в ответчиках.[18]

Рекомендации

  1. ^ Мартин Р., Микель С., Беневидес Л., Бридонно С., Роберт В., Худо С., Цепь Ф, Берто О, Азеведо В., Шатель Дж. М., Сокол Н., Бермудес-Хумаран Л. Г., Томас М., Лангелла П. (2017). «F. prausnitzii как пробиотик нового поколения». Границы микробиологии. 8: 1226. Дои:10.3389 / fmicb.2017.01226. ЧВК  5492426. PMID  28713353.
  2. ^ Мартин Р., Микель С., Беневидес Л., Бридонно С., Роберт В., Худо С., Чейн Ф, Берто О, Азеведо В., Шатель Дж. М., Сокол Н., Бермудес-Хумаран Л. Г., Томас М., Лангелла П. (2017). «F. prausnitzii как пробиотик нового поколения». Границы микробиологии. 8: 1226. Дои:10.3389 / fmicb.2017.01226. ЧВК  5492426. PMID  28713353.
  3. ^ Хан М.Т., Дункан С.Х., Стамс А.Дж., ван Дейл Дж.М., Флинт Г.Дж., Хармсен Г.Дж. (август 2012 г.). «Кишечный анаэроб Faecalibacterium prausnitzii использует внеклеточный электронный шаттл для роста на кислородно-аноксических интерфазах». Журнал ISME. 6 (8): 1578–85. Дои:10.1038 / ismej.2012.5. ЧВК  3400418. PMID  22357539.
  4. ^ Bag S, Ghosh TS, Das B (ноябрь 2017 г.). «Faecalibacterium prausnitzii, выделенный из кишечника здорового взрослого индейца». Анонсы генома. 5 (46). Дои:10.1128 / genomeA.01286-17. ЧВК  5690339. PMID  29146862.
  5. ^ Дункан С.Х., Холд Г.Л., Хармсен Х.Дж., Стюарт С.С., Флинт Г.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Требования к выращиванию и продукты ферментации Fusobacterium prausnitzii, а также предложение реклассифицировать его как Faecalibacterium prausnitzii gen. Nov., Comb. Nov.». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 52 (Pt 6): 2141–6. Дои:10.1099/00207713-52-6-2141. PMID  12508881.
  6. ^ Bag S, Ghosh TS, Das B (ноябрь 2017 г.). «Faecalibacterium prausnitzii, выделенный из кишечника здорового взрослого индейца». Анонсы генома. 5 (46). Дои:10.1128 / genomeA.01286-17. ЧВК  5690339. PMID  29146862.
  7. ^ "Краткое описание Faecalibacterium prausnitzii, штамм A2-165, версия 21.5". BioCyc.
  8. ^ Лопес-Силес М., Хан Т.М., Дункан С.Х., Хармсен Х.Дж., Гарсия-Хиль Л.Дж., Флинт Х.Д. (январь 2012 г.). «Культивируемые представители двух основных филогрупп толстой кишки человека Faecalibacterium prausnitzii могут использовать пектин, уроновые кислоты и субстраты, полученные от хозяина, для роста». Прикладная и экологическая микробиология. 78 (2): 420–8. Дои:10.1128 / AEM.06858-11. ЧВК  3255724. PMID  22101049.
  9. ^ Кеврен Э, Мобер М.А., Мишон С., Чейн Ф, Маркуант Р., Хейдес Дж., Микель С., Карлье Л., Бермудес-Хумаран Л.Г., Пиньер Б., Лекен О, Харрат П., Томас Дж., Рейнто Д., Обри К., Брейнер Н., Афонсу С., Лавьель С., Гриль Дж. П., Чассен Дж., Шатель Дж. М., Тругнан Дж., Ксавье Р., Лангелла П., Сокол Н., Сексик П. (март 2016 г.). «Идентификация противовоспалительного белка из Faecalibacterium prausnitzii, комменсальной бактерии, дефицитной при болезни Крона». Кишечник. 65 (3): 415–425. Дои:10.1136 / gutjnl-2014-307649. ЧВК  5136800. PMID  26045134.
  10. ^ Микель С., Мартин Р., Росси О., Бермудес-Хумаран Л.Г., Шатель Дж. М., Сокол Н., Томас М., Уэллс Дж. М., Лангелла П. (июнь 2013 г.). «Faecalibacterium prausnitzii и здоровье кишечника человека». Текущее мнение в микробиологии. 16 (3): 255–61. Дои:10.1016 / j.mib.2013.06.003. PMID  23831042.
  11. ^ Сокол Х, Пиньер Б., Ваттерлот Л., Лахдари О., Бермудес-Хумаран Л. Г., Гратаду Дж. Дж., Блюгеон С., Бридонно С., Фюре Дж. П., Кортье Дж., Гранжетт С., Васкес Н., Покарт П., Тругнан Г., Томас Дж., Блоттьер Х. М. Доре Дж, Марто П., Сексик П., Ланджелла П. (октябрь 2008 г.). «Faecalibacterium prausnitzii - противовоспалительная комменсальная бактерия, идентифицированная анализом кишечной микробиоты пациентов с болезнью Крона». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 105 (43): 16731–6. Дои:10.1073 / pnas.0804812105. ЧВК  2575488. PMID  18936492.
  12. ^ "Бактерия" виновата в болезни Крона'". Новости BBC. 2008-10-21. Получено 2008-10-21.
  13. ^ Ньютон Р.Дж., Маклеллан С.Л., Дила Д.К., Вайнис Дж.Х., Моррисон Г.Г., Эрен А.М., Согин М.Л. (февраль 2015 г.). «Сточные воды отражают микробиомы человеческих популяций». мБио. 6 (2): e02574. Дои:10,1128 / мБио.02574-14. ЧВК  4358014. PMID  25714718.
  14. ^ Цзян Х, Лин З, Чжан И, Мао Х, Ма З, Инь И, Ван В, Тан В, Тан З, Ши Дж, Ли Л., Жуань Б. (август 2015 г.). «Измененный состав фекальной микробиоты у пациентов с большим депрессивным расстройством». Мозг, поведение и иммунитет. 48: 186–94. Дои:10.1016 / j.bbi.2015.03.016. PMID  25882912.
  15. ^ Codoñer FM, Ramírez-Bosca A, Climent E, Carrión-Gutierrez M, Guerrero M, Pérez-Orquín JM, Horga de la Parte J, Genovés S, Ramón D, Navarro-López V, Chenoll E (февраль 2018 г.). «Микробный состав кишечника у больных псориазом». Научные отчеты. 8 (1): 3812. Bibcode:2018НатСР ... 8,38 12C. Дои:10.1038 / с41598-018-22125-у. ЧВК  5830498. PMID  29491401.
  16. ^ Райт EK, Kamm MA, Teo SM, Inouye M, Wagner J, Kirkwood CD (июнь 2015 г.). «Последние достижения в характеристике микробиома желудочно-кишечного тракта при болезни Крона: систематический обзор». Воспалительные заболевания кишечника. 21 (6): 1219–28. Дои:10.1097 / MIB.0000000000000382. ЧВК  4450900. PMID  25844959.
  17. ^ а б Эль Хаге Р., Эрнандес-Санабриа Э, Ван де Виле Т. (2017-09-29). «Новые тенденции в« умных пробиотиках »: функциональное рассмотрение для разработки новых медицинских и промышленных приложений». Границы микробиологии. 8: 1889. Дои:10.3389 / fmicb.2017.01889. ЧВК  5626839. PMID  29033923.
  18. ^ Эдвардс, Кристина А .; Макгроган, Параик; Блаут, Майкл; Ханске, Лаура; Берц, Мартин; Ломан, Ник; Айва, Кристофер; Хансен, Ричард; Рассел, Ричард (2014-07-01). «Роль Faecalibacterium prausnitzii в болезни Крона: друг, враг или на самом деле не имеет значения?». Воспалительные заболевания кишечника. 20 (7): E18 – E19. Дои:10.1097 / MIB.0000000000000079. ISSN  1078-0998. PMID  24859302.